32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1080 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1080  putative lipoprotein  100 
 
 		 226 aa  461  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00439977  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0140  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0037  hypothetical protein  30.32 
 
 		 226 aa  98.6  7e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2669  hypothetical protein  28.3 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0400  hypothetical protein  25 
 
 		 233 aa  78.6  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3853  hypothetical protein  30.49 
 
 		 232 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1467  hypothetical protein  29.34 
 
 		 211 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2583  hypothetical protein  27.01 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.823407 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2734  putative lipoprotein  28.43 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.128638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2710  hypothetical protein  27.72 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20600  hypothetical protein  26.85 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000461916  normal  0.707445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1768  putative lipoprotein  26.85 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6350  putative lipoprotein  26.67 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.483058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2569  hypothetical protein  26.73 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2705  hypothetical protein  28.95 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229078 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3853  hypothetical protein  20.98 
 
 		 231 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.182683 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3047  putative lipoprotein  26.85 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.566933  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3145  hypothetical protein  26.24 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0689  hypothetical protein  20.96 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3425  putative lipoprotein  23.32 
 
 		 231 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2516  hypothetical protein  26.51 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.518035  normal  0.553883 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3499  hypothetical protein  22.47 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1721  putative lipoprotein  28.43 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1785  hypothetical protein  28.43 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1554  putative lipoprotein  28.43 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1735  putative lipoprotein  28.43 
 
 		 222 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0167  hypothetical protein  32.29 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1448  putative lipoprotein  21.32 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288417  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2561  putative lipoprotein  23.86 
 
 		 237 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.45576  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1724  putative lipoprotein  27.92 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0895113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2390  hypothetical protein  28.12 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.954642  normal  0.832106 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1604  hypothetical protein  24.28 
 
 		 240 aa  42.7  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>