More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2129 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2129  transcriptional regulator CysB-like protein  100 
 
 		 311 aa  633    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.74673e-16  decreased coverage  0.00000124662 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1739  transcriptional regulator CysB-like protein  63.11 
 
 		 314 aa  414  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.000000279611  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  61.64 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.625225  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0810  transcriptional regulator CysB-like protein  61.64 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.259681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1205  transcriptional regulator CysB-like protein  61.64 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.215298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2018  transcriptional regulator CysB-like protein  61.64 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.962244  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0350  transcriptional regulator CysB-like protein  61.64 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0871745  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2476  transcriptional regulator CysB-like protein  61.97 
 
 		 308 aa  412  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1694  transcriptional regulator CysB-like protein  61.64 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.272702  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1851  transcriptional regulator CysB-like protein  61.64 
 
 		 308 aa  411  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1521  transcriptional regulator CysB-like protein  60.33 
 
 		 308 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1501  transcriptional regulator CysB-like protein  60.33 
 
 		 308 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.33535  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4743  transcriptional regulator CysB-like protein  60.66 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217696  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1632  transcriptional regulator CysB-like protein  60.66 
 
 		 308 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1605  transcriptional regulator CysB-like protein  60.33 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339549  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1582  transcriptional regulator CysB-like protein  60.33 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.610687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1125  transcriptional regulator CysB-like protein  60 
 
 		 308 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2466  transcriptional regulator CysB-like protein  59.34 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1777  transcriptional regulator CysB-like protein  59.34 
 
 		 308 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1625  transcriptional regulator CysB-like protein  59.02 
 
 		 308 aa  397  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.879627  normal  0.658708 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0621  transcriptional regulator CysB-like protein  61.49 
 
 		 309 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0963  LysR family transcriptional regulator  60.06 
 
 		 308 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.377381  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1287  transcriptional regulator CysB-like protein  58.88 
 
 		 319 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.767639  normal  0.313196 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1967  transcriptional regulator CysB-like protein  59.21 
 
 		 315 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  59.21 
 
 		 316 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1224  transcriptional regulator CysB-like protein  58.55 
 
 		 319 aa  370  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.178615  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1348  transcriptional regulator CysB-like protein  58.22 
 
 		 327 aa  368  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3810  LysR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 312 aa  368  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0818  transcriptional regulator CysB-like protein  54.55 
 
 		 313 aa  358  7e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2525  transcriptional regulator CysB-like protein  54.55 
 
 		 313 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2393  transcriptional regulator CysB-like protein  54.55 
 
 		 313 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5807  transcriptional regulator CysB-like protein  54.55 
 
 		 313 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0834641 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2481  transcriptional regulator CysB-like protein  54.22 
 
 		 313 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1865  transcriptional regulator CysB-like protein  54.22 
 
 		 313 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2476  transcriptional regulator CysB-like protein  54.22 
 
 		 313 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14516  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5610  LysR family transcriptional regulator  53.92 
 
 		 354 aa  355  5.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.519955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1658  transcriptional regulator Cbl  52.92 
 
 		 316 aa  353  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000765107  normal  0.0208007 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2831  transcriptional regulator Cbl  52.6 
 
 		 316 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000101541  normal  0.682702 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0127  LysR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 311 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.191807  hitchhiker  0.00233416 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01897  DNA-binding transcriptional activator of cysteine biosynthesis  52.92 
 
 		 316 aa  348  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000685239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1668  transcriptional regulator, LysR family  52.92 
 
 		 316 aa  348  5e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2269  transcriptional regulator Cbl  52.92 
 
 		 316 aa  348  5e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000889139  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01886  hypothetical protein  52.92 
 
 		 316 aa  348  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000554591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2236  transcriptional regulator CysB-like protein  53.44 
 
 		 313 aa  348  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1137  transcriptional regulator Cbl  52.92 
 
 		 316 aa  348  6e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000142733  hitchhiker  0.0000552963 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0620  transcriptional regulator CysB-like protein  53.38 
 
 		 313 aa  347  2e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0418657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0971  transcriptional regulator Cbl  52.92 
 
 		 316 aa  346  3e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000168411  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0813  transcriptional regulator CysB-like protein  51.95 
 
 		 313 aa  346  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1663  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0662  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.631688  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1005  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1165  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2110  transcriptional regulator Cbl  52.6 
 
 		 316 aa  344  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.3178700000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2936  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1012  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2349  transcriptional regulator CysB-like protein  51.62 
 
 		 313 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2705  transcriptional regulator CysB-like protein  56.29 
 
 		 317 aa  341  8e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0969  transcriptional regulator CysB-like protein  51.8 
 
 		 313 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0071  LysR family transcriptional regulator  54.66 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.16172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3665  transcriptional regulator CysB-like protein  51.8 
 
 		 313 aa  340  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.891363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1394  transcriptional regulator CysB-like protein  56.15 
 
 		 317 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0061  transcriptional regulator, LysR family  56.25 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2818  transcriptional regulator CysB-like protein  53.29 
 
 		 313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2231  transcriptional regulator CysB-like protein  54.92 
 
 		 313 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3039  LysR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 309 aa  335  5.999999999999999e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.0769631 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2698  transcriptional regulator CysB-like protein  52.3 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2691  transcriptional regulator CysB-like protein  54.92 
 
 		 313 aa  334  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.644017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2427  transcriptional regulator CysB-like protein  53.9 
 
 		 313 aa  333  2e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1289  transcriptional regulator CysB-like protein  54.97 
 
 		 317 aa  333  2e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1792  transcriptional regulator CysB-like protein  55.81 
 
 		 317 aa  333  3e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2917  transcriptional regulator CysB-like protein  55.15 
 
 		 317 aa  331  8e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1669  transcriptional regulator CysB-like protein  50.49 
 
 		 312 aa  331  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0453898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2563  transcriptional regulator Cbl  54.82 
 
 		 316 aa  328  5.0000000000000004e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00294474  normal  0.0988351 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0847  transcriptional regulator, LysR family  50.66 
 
 		 320 aa  328  8e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.960379 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0699  sulfur assimilation transcriptional regulator, LysR family  50.66 
 
 		 320 aa  328  8e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.735105  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2910  transcriptional regulator CysB-like protein  49.84 
 
 		 313 aa  326  2.0000000000000001e-88  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.170902  normal  0.254391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1145  transcriptional regulator CysB-like protein  50.33 
 
 		 308 aa  325  8.000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207377  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1296  transcriptional regulator, LysR family  49.34 
 
 		 320 aa  324  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.842409  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0800  transcriptional regulator CysB-like protein  48.36 
 
 		 313 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2341  transcriptional regulator CysB  47.91 
 
 		 335 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00664929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2279  Cys regulon transcriptional activator  47.59 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0003435  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2077  transcriptional regulator CysB  47.59 
 
 		 324 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0047105 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2292  transcriptional regulator CysB-like protein  47.04 
 
 		 306 aa  305  9.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.524252  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4003  transcriptional regulator CysB  47.27 
 
 		 324 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.260583  normal  0.45598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1768  transcriptional regulator CysB  47.27 
 
 		 324 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000142013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2327  transcriptional regulator CysB  47.27 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.184075  hitchhiker  0.000046762 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1928  transcriptional regulator CysB  47.27 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0221409  hitchhiker  0.0000000000199307 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3443  transcriptional regulator CysB  47.27 
 
 		 324 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0457028  hitchhiker  0.00255719 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2726  transcriptional regulator CysB-like protein  47.7 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.634553  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4926  transcriptional regulator CysB-like protein  46.45 
 
 		 313 aa  300  2e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.74642 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23140  transcriptional regulator CysB  47.54 
 
 		 324 aa  299  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41870  transcriptional regulator CysB  48.2 
 
 		 324 aa  298  1e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2546  transcriptional regulator CysB  46.95 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000891923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3553  transcriptional regulator CysB  48.2 
 
 		 324 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  45.78 
 
 		 333 aa  296  3e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2173  transcriptional regulator CysB-like protein  47.54 
 
 		 314 aa  295  6e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.147691 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2428  transcriptional regulator CysB  45.39 
 
 		 323 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3535  transcriptional regulator CysB-like protein  46.38 
 
 		 326 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00820033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1946  transcriptional regulator CysB-like protein  46.6 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.226921  normal  0.0811949 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3166  transcriptional regulator CysB-like protein  45.39 
 
 		 313 aa  292  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0200207  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>