108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4241 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 
268 aa  533  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  46.15 
 
 
276 aa  231  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  46.15 
 
 
286 aa  230  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  45.22 
 
 
252 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  45 
 
 
252 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.78 
 
 
252 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.4 
 
 
256 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  43.57 
 
 
256 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  45.22 
 
 
254 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  43.82 
 
 
249 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.58 
 
 
257 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40 
 
 
257 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.17 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  38.89 
 
 
280 aa  170  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  37.1 
 
 
248 aa  162  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.91 
 
 
255 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.84 
 
 
268 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  37.39 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  37.39 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.71 
 
 
248 aa  155  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  37.1 
 
 
248 aa  155  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.3 
 
 
248 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.3 
 
 
248 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.3 
 
 
248 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  34.58 
 
 
247 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  35.78 
 
 
251 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.58 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.3 
 
 
248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.29 
 
 
248 aa  149  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.79 
 
 
253 aa  145  9e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  42.61 
 
 
333 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  32.5 
 
 
272 aa  112  7.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0518  thiol:disulfide interchange protein DsbG  35.54 
 
 
141 aa  95.9  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  27.23 
 
 
274 aa  87  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  32.89 
 
 
201 aa  85.9  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  32.89 
 
 
201 aa  85.9  6e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  28.5 
 
 
283 aa  85.5  7e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  28.5 
 
 
255 aa  85.1  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  31.25 
 
 
208 aa  78.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  28.66 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  29.86 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  29.86 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  33.33 
 
 
399 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  32.8 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  32.8 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  34.15 
 
 
122 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  28.77 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  28.76 
 
 
193 aa  62.4  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.07 
 
 
178 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  30.07 
 
 
225 aa  61.6  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  26.02 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  34.38 
 
 
231 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1066  thiol:disulfide interchange protein  24.86 
 
 
261 aa  58.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  30.61 
 
 
533 aa  56.2  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  22.08 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  29.87 
 
 
530 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4214  hypothetical protein  26.75 
 
 
301 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000071573  normal  0.744992 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  37.93 
 
 
182 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.52 
 
 
241 aa  52  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  26.37 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1075  hypothetical protein  26 
 
 
372 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00702033  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  24.08 
 
 
254 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  28.02 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2250  hypothetical protein  25.59 
 
 
284 aa  50.4  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000197952  decreased coverage  1.85525e-19 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  23.86 
 
 
238 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2292  hypothetical protein  32.67 
 
 
413 aa  49.3  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4190  hypothetical protein  25.49 
 
 
430 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0642  thiol:disulfide interchange protein  22.6 
 
 
275 aa  48.9  0.00008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.374404  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0850  hypothetical protein  23.56 
 
 
268 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.842936  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.35 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.35 
 
 
241 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  27.1 
 
 
249 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  26.42 
 
 
252 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  23.74 
 
 
245 aa  48.1  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6169  thiol-disulfide isomerase  24.77 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00370649  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  26.61 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  26.61 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.72 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 
238 aa  46.6  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  26.61 
 
 
242 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1150  hypothetical protein  24.74 
 
 
267 aa  46.2  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000405305  normal  0.155093 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  31.06 
 
 
207 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  31.06 
 
 
207 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  31.82 
 
 
207 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  31.06 
 
 
207 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  31.06 
 
 
207 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  26.61 
 
 
242 aa  45.8  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  32 
 
 
249 aa  45.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  25.47 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  25.69 
 
 
242 aa  45.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1803  hypothetical protein  28.21 
 
 
260 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000076837  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3850  hypothetical protein  22.22 
 
 
354 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  25.69 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0260  protein-disulfide isomerase  23.2 
 
 
250 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  25.69 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1288  hypothetical protein  23.7 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  23.3 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0985  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.35 
 
 
262 aa  43.5  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  22.47 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>