24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_4190 on replicon NC_008738
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008738  Maqu_4190  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  864    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.43 
 
 
252 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.43 
 
 
252 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  29.85 
 
 
272 aa  56.6  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.39 
 
 
286 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.57 
 
 
252 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.39 
 
 
276 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  37.97 
 
 
399 aa  52.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  26.81 
 
 
333 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  27.66 
 
 
280 aa  50.1  0.00009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.46 
 
 
256 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  26.76 
 
 
256 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  26.24 
 
 
268 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  27.54 
 
 
208 aa  48.5  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.25 
 
 
255 aa  47.4  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  32.26 
 
 
283 aa  47  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  32.26 
 
 
255 aa  47  0.0007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  36.11 
 
 
231 aa  46.6  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.73 
 
 
257 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  25.85 
 
 
533 aa  45.4  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.46 
 
 
254 aa  45.8  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  43.18 
 
 
222 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2292  hypothetical protein  36.07 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.36 
 
 
257 aa  43.5  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>