62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0518 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0518  thiol:disulfide interchange protein DsbG  100 
 
 		 141 aa  292  8e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 		 253 aa  288  1e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  289  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 		 248 aa  288  1e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 		 248 aa  288  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 		 268 aa  288  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 		 248 aa  288  1e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 		 248 aa  289  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 		 248 aa  288  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  86.86 
 
 		 248 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  86.86 
 
 		 248 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  86.86 
 
 		 268 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  86.86 
 
 		 268 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  86.86 
 
 		 248 aa  260  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  69.17 
 
 		 251 aa  187  4e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  52.07 
 
 		 256 aa  164  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  51.24 
 
 		 256 aa  161  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  54.48 
 
 		 253 aa  157  6e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  53.72 
 
 		 257 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  50.39 
 
 		 249 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.76 
 
 		 252 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.33 
 
 		 252 aa  143  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.5 
 
 		 252 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  46.97 
 
 		 255 aa  136  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  46.15 
 
 		 254 aa  126  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  37.88 
 
 		 286 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  37.88 
 
 		 276 aa  123  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  40.83 
 
 		 280 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.17 
 
 		 257 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  35.14 
 
 		 268 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.75 
 
 		 257 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  35 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  50 
 
 		 333 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3311  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.82 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.679493  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  31.47 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  31.47 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  31.47 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.47 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.47 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0816  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.47 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.774755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.47 
 
 		 236 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.47 
 
 		 236 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3313  thiol:disulfide interchange protein DsbC  31.47 
 
 		 236 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.21 
 
 		 238 aa  47  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3299  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.4 
 
 		 239 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  25.69 
 
 		 283 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.25 
 
 		 238 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  25.69 
 
 		 255 aa  44.7  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3277  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.89 
 
 		 237 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3379  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.89 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3199  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.89 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.414652  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3211  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.89 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3274  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.89 
 
 		 237 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2738  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.57 
 
 		 242 aa  42.4  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3448  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.71 
 
 		 241 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  27.91 
 
 		 274 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3523  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.71 
 
 		 241 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3642  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.71 
 
 		 241 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  28.24 
 
 		 252 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0844  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.71 
 
 		 241 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  32.1 
 
 		 249 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3850  hypothetical protein  23.76 
 
 		 354 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>