155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2787 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 
254 aa  517  1e-146  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  50.19 
 
 
276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  50.19 
 
 
286 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  49.79 
 
 
256 aa  265  8e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  49.79 
 
 
256 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  49.12 
 
 
252 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.09 
 
 
252 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.68 
 
 
252 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.28 
 
 
257 aa  238  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  51.52 
 
 
280 aa  235  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  48.78 
 
 
249 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.66 
 
 
257 aa  216  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  47.01 
 
 
257 aa  208  5e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  45.31 
 
 
255 aa  206  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  45.22 
 
 
268 aa  202  4e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.95 
 
 
248 aa  202  6e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  42.21 
 
 
268 aa  201  8e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.83 
 
 
248 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.527932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  42.31 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  41.95 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  42.31 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  41.95 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  41.95 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  41.95 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.25 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.25 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.25 
 
 
268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.83 
 
 
248 aa  184  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  38.7 
 
 
251 aa  176  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  36.59 
 
 
253 aa  170  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  50.64 
 
 
333 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  36.9 
 
 
272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0518  thiol:disulfide interchange protein DsbG  45.45 
 
 
141 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  31.36 
 
 
274 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  33.01 
 
 
255 aa  106  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  33.01 
 
 
283 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  31.41 
 
 
208 aa  90.5  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  32.48 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  32.48 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  33.94 
 
 
178 aa  82.4  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  33.94 
 
 
225 aa  82  0.000000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  39.5 
 
 
122 aa  81.3  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  32.72 
 
 
203 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  32.72 
 
 
203 aa  77  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  28.22 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.65 
 
 
237 aa  70.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  30.71 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4214  hypothetical protein  27.18 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000071573  normal  0.744992 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  27.86 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  27.86 
 
 
193 aa  66.6  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  35 
 
 
231 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  32.14 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70818 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  29.07 
 
 
245 aa  66.6  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3784  protein-disulfide isomerase  30.59 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00018308  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  28.49 
 
 
246 aa  63.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  29.29 
 
 
248 aa  62  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  29.29 
 
 
248 aa  62  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1066  thiol:disulfide interchange protein  27.65 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2037  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.57 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.672217  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  26.47 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  30.63 
 
 
233 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  28.5 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  28.5 
 
 
302 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.74 
 
 
210 aa  58.5  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.89 
 
 
245 aa  58.5  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  27.06 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  27.59 
 
 
399 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  25.98 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  26.44 
 
 
252 aa  57.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  25.98 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  27.42 
 
 
235 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  25.49 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  25.49 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  27.36 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  25.49 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  27.92 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  28.23 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.78 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.18 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1026  glutaredoxin  27.87 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  28.18 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.18 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  29.87 
 
 
533 aa  54.7  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  31.17 
 
 
530 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0323  protein-disulfide isomerase  29.1 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  25.37 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1335  hypothetical protein  29.58 
 
 
161 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.919795  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  25.52 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.23 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  27.73 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0642  thiol:disulfide interchange protein  25.51 
 
 
275 aa  52.8  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.374404  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.52 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.37 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.37 
 
 
245 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.37 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.37 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.37 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.37 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.37 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 
263 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>