179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2594 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  100 
 
 
255 aa  521  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  43.48 
 
 
252 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  43.48 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  43.1 
 
 
252 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  46.72 
 
 
254 aa  218  7.999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.54 
 
 
256 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.94 
 
 
249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  44.1 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  42.31 
 
 
276 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  42.56 
 
 
248 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  42.31 
 
 
286 aa  203  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.93 
 
 
268 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  46.96 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.69 
 
 
248 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.69 
 
 
248 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.69 
 
 
248 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.69 
 
 
248 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.87 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  40.87 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  40.26 
 
 
248 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  42.67 
 
 
257 aa  196  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  42.15 
 
 
268 aa  191  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  42.15 
 
 
268 aa  191  8e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  44.78 
 
 
280 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  42.15 
 
 
248 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  41.74 
 
 
248 aa  186  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  41.3 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  43.53 
 
 
257 aa  178  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  39.91 
 
 
268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  34.5 
 
 
253 aa  142  6e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  39.74 
 
 
333 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0518  thiol:disulfide interchange protein DsbG  47.5 
 
 
141 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  32.95 
 
 
272 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  30.77 
 
 
274 aa  102  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  31.96 
 
 
283 aa  89.7  4e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.96 
 
 
255 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2771  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.91 
 
 
254 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.756706  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  34.82 
 
 
122 aa  73.9  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  31.94 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  28.57 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  28.57 
 
 
201 aa  73.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  34.69 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  27.81 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  31.39 
 
 
208 aa  71.2  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  27.81 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1487  thiol-disulfide interchange protein DsbC  31.29 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  29.41 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  32.43 
 
 
193 aa  68.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2103  Disulphide bond isomerase, DsbC/G-like protein  28.26 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.84966 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4214  hypothetical protein  25.23 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000071573  normal  0.744992 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  28.32 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  29.2 
 
 
201 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.82 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0592  putative thiol:disulfide interchange protein  28.5 
 
 
246 aa  63.2  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0154668  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3190  putative thiol:disulfide interchange protein  29.06 
 
 
252 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00541638  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.16 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2253  thiol-disulfide interchange protein DsbC  29.31 
 
 
245 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000301453  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  22.7 
 
 
178 aa  60.5  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3891  thiol:disulfide interchange protein DsbC  26.67 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.305682  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  22.7 
 
 
225 aa  60.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.4 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  28.4 
 
 
236 aa  60.1  0.00000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  27.54 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  21.4 
 
 
237 aa  59.7  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.79 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2868  protein-disulfide isomerase-like protein  27.95 
 
 
242 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0799094  normal  0.459288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  27.54 
 
 
248 aa  58.9  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3035  thiol:disulfide interchange protein  27.16 
 
 
249 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  27.51 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  27.51 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  27.51 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3425  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.11 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.668672  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  27.51 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2956  protein-disulfide isomerase-like protein  31.78 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.61 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1327  protein-disulfide isomerase-like protein  31.78 
 
 
242 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00347079  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  30.28 
 
 
399 aa  57  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1066  thiol:disulfide interchange protein  24.4 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000006488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0880  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.43 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.331864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3848  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.43 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.31275 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0921  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.43 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  33.96 
 
 
182 aa  56.6  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.48 
 
 
241 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.48 
 
 
241 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.32 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  27.11 
 
 
240 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0646  thiol:disulfide interchange protein DsbC  25.44 
 
 
238 aa  55.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.363751  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0951  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.09 
 
 
241 aa  55.5  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02725  protein disulfide isomerase II  24.89 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.09778  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  27.16 
 
 
237 aa  55.5  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02688  hypothetical protein  24.89 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116965  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3052  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.89 
 
 
236 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0799  Thioredoxin, conserved site  24.89 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.152013  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  23.01 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0575  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.85 
 
 
210 aa  55.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.452646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4184  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.89 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  27.51 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  27.62 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3026  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.89 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3219  thiol:disulfide interchange protein DsbC  24.89 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>