29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3850 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010580  Bind_3850  hypothetical protein  100 
 
 
354 aa  723    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.27 
 
 
252 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  26.84 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  26.84 
 
 
252 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.93 
 
 
257 aa  60.5  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.02 
 
 
256 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.15 
 
 
251 aa  57.4  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.76 
 
 
276 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.76 
 
 
286 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.04 
 
 
256 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  22.51 
 
 
249 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.13 
 
 
248 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.31 
 
 
248 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.37 
 
 
268 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24.37 
 
 
268 aa  50.1  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  22.39 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  22.39 
 
 
247 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.33 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.33 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.33 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.33 
 
 
248 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.33 
 
 
268 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  22.39 
 
 
253 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.13 
 
 
248 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  22.07 
 
 
254 aa  47.4  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  22.22 
 
 
268 aa  45.4  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  22.02 
 
 
274 aa  45.8  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  24 
 
 
253 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  23.24 
 
 
255 aa  43.1  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>