92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_2560 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2947  thiol:disulfide interchange protein DsbG, putative  99.67 
 
 		 302 aa  614  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2560  hypothetical protein  100 
 
 		 302 aa  616  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.883741 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1547  hypothetical protein  42 
 
 		 283 aa  152  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116305 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1872  thiol:disulfide interchange protein, putative  44 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1085  thiol:disulfide interchange domain protein  35 
 
 		 274 aa  129  6e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00153173  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1397  Fis family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2762  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.15 
 
 		 256 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.194838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3803  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.24 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0452  hypothetical protein  41.3 
 
 		 203 aa  89.4  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.912774  hitchhiker  0.000257257 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0275  thiol:disulfide interchange domain protein  41.3 
 
 		 203 aa  89.4  7e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1075  hypothetical protein  28.12 
 
 		 372 aa  89  8e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00702033  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.15 
 
 		 256 aa  89  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347111  normal  0.0253122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1627  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.78 
 
 		 252 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.759797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4237  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.68 
 
 		 252 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.919377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2396  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  33.14 
 
 		 257 aa  85.9  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000025188  hitchhiker  0.0000223583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2787  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.5 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.856388  normal  0.976704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4241  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.22 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147962  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  33.9 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  33.9 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1057  hypothetical protein  33.57 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000413495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0765  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.77 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.527932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30.46 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2396  thiol:disulfide interchange protein  35.37 
 
 		 280 aa  79.7  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.903284  normal  0.517846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5854  protein-disulfide isomerase-like protein  39.45 
 
 		 333 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0690  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.67 
 
 		 248 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.678233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0625  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.67 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1615  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.56 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.110652  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2299  hypothetical protein  37.01 
 
 		 399 aa  76.3  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.441757  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1943  dsbG domain protein  32.56 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00562  hypothetical protein  27.18 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0306036  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3039  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.31 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0656  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.31 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3020  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.31 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00573  periplasmic disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.31 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.023443  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1355  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  32.77 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.617458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4182  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  28.49 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0704  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.36 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.970694  normal  0.0618042 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2228  hypothetical protein  32.37 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0646  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.36 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0719  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.36 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.635315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3938  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  29.41 
 
 		 249 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.450979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0660  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  31.36 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05940  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  30 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000139676  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1018  thiol:disulfide interchange domain protein  30.08 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.977804  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2594  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.62 
 
 		 255 aa  66.2  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.67724  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2031  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  27.59 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2246  dsbG domain protein  33.33 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.119068  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.649573 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1853  Fis family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.70818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2292  hypothetical protein  37.8 
 
 		 413 aa  61.6  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2559  hypothetical protein  36.8 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.948214  normal  0.318604 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3811  hypothetical protein  33.08 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2291  Ankyrin  33.04 
 
 		 533 aa  53.9  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2302  Ankyrin  33.04 
 
 		 530 aa  53.5  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70161  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0140  putative thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 		 237 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0153  putative thiol:disulfide interchange protein  25 
 
 		 238 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.313521 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3504  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  29.09 
 
 		 241 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.478883  normal  0.0108218 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0884  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  31.71 
 
 		 246 aa  50.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.776267  normal  0.695906 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0453  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.48 
 
 		 241 aa  49.7  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4180  protein-disulfide isomerase  28.21 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0898923  hitchhiker  0.00161761 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0463  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  32.11 
 
 		 246 aa  48.1  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1531  thiol:disulfide interchange protein DsbC  30.3 
 
 		 272 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3509  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  26.09 
 
 		 233 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.074793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2892  thiol:disulfide interchange protein  27.41 
 
 		 248 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2706  putative thiol-disulfide interchange protein, DsbC  28.57 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1124  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  38.36 
 
 		 237 aa  46.2  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.574462 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0514  thiol:disulfide interchange protein DsbG  30.53 
 
 		 122 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1288  hypothetical protein  27.5 
 
 		 237 aa  45.8  0.0008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0948  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.2 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0525  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.2 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1918  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.2 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2768  thiol:disulfide interchange protein  26.55 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3591  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.2 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.404848  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0652  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.2 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3584  thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.2 
 
 		 245 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3564  putative thiol:disulfide interchange protein DsbC  32.2 
 
 		 242 aa  45.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2917  thiol:disulfide interchange protein DsbC, putative  32.2 
 
 		 242 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3367  putative thiol:disulphide interchange protein (periplasmic)  29.7 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2143  putative thiol:disulphide interchange protein  34.33 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0944083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0982  Protein-disulfide isomerase-like protein  21.83 
 
 		 294 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00356461  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3134  putative thiol:disulfide interchange protein  26.55 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.649028 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0498  protein-disulfide isomerase-like protein  33.04 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0267  putative thiol:disulfide interchange protein  26.32 
 
 		 235 aa  44.3  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231487 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2579  protein-disulfide isomerase-like  33.04 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0526  protein-disulfide isomerase-like protein  33.04 
 
 		 242 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3613  protein-disulfide isomerase-like  33.04 
 
 		 242 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4214  hypothetical protein  24.64 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000071573  normal  0.744992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3621  thiol:disulfide interchange protein DsbC  28.05 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2931  Thioredoxin, conserved site  28.05 
 
 		 236 aa  42.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.353115  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4644  thiol:disulfide interchange protein DsbC  29.36 
 
 		 240 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0455  protein-disulfide isomerase-like protein  32.17 
 
 		 242 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0600413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0431  protein-disulfide isomerase-like protein  32.17 
 
 		 242 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>