90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3642 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3642  citrate transporter  100 
 
 		 469 aa  925    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.994424  normal  0.156784 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1707  citrate transporter  66.1 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1431  GntP family transporter  67.1 
 
 		 471 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.68613  normal  0.475499 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1595  GntP family transporter  67.4 
 
 		 471 aa  607  9.999999999999999e-173  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.845191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4048  citrate transporter  60.81 
 
 		 461 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3347  citrate transporter  55.05 
 
 		 462 aa  518  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916908  normal  0.492307 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0416  citrate transporter  56.41 
 
 		 464 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00414278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13910  integral membrane permease/GntP family/citrate transporter  57.85 
 
 		 463 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00000614873  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1768  citrate transporter  55.02 
 
 		 481 aa  477  1e-133  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3440  Citrate transporter  51.98 
 
 		 521 aa  462  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4691  putative permease  49.39 
 
 		 485 aa  418  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00173372  normal  0.147987 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10190  H+/gluconate symporter family protein  49.57 
 
 		 469 aa  408  1e-113  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.438603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0830  citrate transporter  45.92 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.857504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2437  citrate transporter  48.19 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.568762  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2569  Citrate transporter  48.05 
 
 		 484 aa  390  1e-107  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212099 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0794  citrate transporter  49.47 
 
 		 491 aa  385  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0751  hypothetical protein  42.35 
 
 		 459 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0683587  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0768  hypothetical protein  42.57 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.402373  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01390  H+/gluconate symporter family protein  45.65 
 
 		 489 aa  378  1e-103  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22430  H+/gluconate symporter family protein  45.44 
 
 		 483 aa  366  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.399146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1395  citrate transporter  46.91 
 
 		 484 aa  362  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3481  hypothetical protein  48.6 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31169 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0594  citrate transporter  46.39 
 
 		 463 aa  353  5e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0456  hypothetical protein  44.44 
 
 		 465 aa  348  1e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.259355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1268  citrate transporter  44.69 
 
 		 466 aa  344  2e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2065  hypothetical protein  43.07 
 
 		 479 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2333  hypothetical protein  42.74 
 
 		 479 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0140317  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2221  hypothetical protein  43.07 
 
 		 479 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.751134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2249  hypothetical protein  43.07 
 
 		 479 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9907900000000003e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2046  citrate transporter  43.01 
 
 		 479 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.02921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2203  hypothetical protein  42.51 
 
 		 479 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2005  gluconate permease  42.86 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0226101  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3122  hypothetical protein  42.44 
 
 		 479 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000385329 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2792  citrate transporter  45.35 
 
 		 463 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221695  normal  0.129925 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1629  citrate transporter  43.91 
 
 		 479 aa  339  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0518899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38580  hypothetical protein  46.31 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.27646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3285  hypothetical protein  46.31 
 
 		 463 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.612003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2004  gluconate permease  42.65 
 
 		 479 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000311316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2717  citrate transporter  45.58 
 
 		 463 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203556  normal  0.0827168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2650  citrate transporter  45.13 
 
 		 463 aa  336  5e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4323  Citrate transporter  46.85 
 
 		 463 aa  336  7e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3955  citrate transporter  46.68 
 
 		 463 aa  335  7e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.376659  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3074  citrate transporter  44.42 
 
 		 463 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.846868 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3078  hypothetical protein  43.67 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17600  membrane protein, D-beta-hydroxybutyrate permease  45.05 
 
 		 463 aa  334  2e-90  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2251  hypothetical protein  42.8 
 
 		 466 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162052  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1666  citrate transporter family protein  45.22 
 
 		 463 aa  332  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2001  citrate transporter  42.76 
 
 		 465 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2686  permease  42.37 
 
 		 478 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422279  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4755  citrate transporter  43.52 
 
 		 463 aa  325  9e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.708141 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4432  Citrate transporter  46.12 
 
 		 463 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.605428 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2707  integral membrane protein; gluconate transporter  42.92 
 
 		 478 aa  324  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2789  Citrate transporter  44.32 
 
 		 466 aa  321  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2382  Citrate transporter  43.89 
 
 		 466 aa  319  6e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.463878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1854  Citrate transporter  45.23 
 
 		 463 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.761609 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2980  hypothetical protein  42.92 
 
 		 466 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6939  Citrate transporter  43.15 
 
 		 466 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.135388  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0564  citrate transporter  43.23 
 
 		 461 aa  312  9e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4278  citrate transporter  43.08 
 
 		 466 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.991467  normal  0.456122 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3728  hypothetical protein  44.1 
 
 		 463 aa  303  6.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2518  hypothetical protein  45.18 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  0.019888 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5401  citrate transporter  41.67 
 
 		 467 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.487736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4854  citrate transporter  41.67 
 
 		 467 aa  298  9e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0583  citrate transporter  43.54 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0128  H+/gluconate symporter family protein  41.31 
 
 		 467 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4742  citrate transporter  41.08 
 
 		 467 aa  296  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3275  citrate transporter  40.9 
 
 		 495 aa  296  5e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.143329  normal  0.0330596 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5331  citrate transporter  41.08 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5530  citrate transporter  41.08 
 
 		 467 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0362  hypothetical protein  41.7 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1244  YxjC protein  41.7 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460946  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1545  hypothetical protein  41.7 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0375228  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1734  hypothetical protein  41.7 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0301594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0395  hypothetical protein  41.7 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.202442  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3009  hypothetical protein  41.7 
 
 		 467 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000107347  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2211  hypothetical protein  41.7 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2892  hypothetical protein  41.48 
 
 		 467 aa  289  6e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0547  citrate transporter  40.59 
 
 		 463 aa  286  4e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104636 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1979  citrate transporter  37.14 
 
 		 431 aa  256  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02262  GntP family permease  36.81 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.470308  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2081  hypothetical protein  36.6 
 
 		 464 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2554  citrate transporter  37.8 
 
 		 457 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000334363  hitchhiker  1.3683e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0963  citrate transporter family protein  46.85 
 
 		 141 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.589813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1012  citrate transporter family protein  46.85 
 
 		 141 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0122891  normal  0.705838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0992  citrate transporter family protein  46.85 
 
 		 141 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.646761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0931  citrate transporter family protein  46.85 
 
 		 141 aa  90.1  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0112  gluconate transporter  29.51 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4051  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  29.51 
 
 		 422 aa  45.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4082  gluconate:H+ symporter (GntP) family protein  28.96 
 
 		 422 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.143116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3399  Citrate transporter  42.47 
 
 		 424 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>