More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1445 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1445  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  358  3e-98  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000632214  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1226  hypothetical protein  87.57 
 
 
188 aa  276  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1248  hypothetical protein  82.19 
 
 
77 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171324  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  33.9 
 
 
203 aa  103  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1406  protein of unknown function DUF205  39.25 
 
 
200 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1788  membrane protein  50.89 
 
 
198 aa  101  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  37.42 
 
 
198 aa  95.1  4e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  35.33 
 
 
204 aa  94.7  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  37.42 
 
 
198 aa  94.4  8e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.94 
 
 
200 aa  94.4  8e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1357  membrane protein  45.83 
 
 
232 aa  94  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  41.1 
 
 
198 aa  92.8  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1493  hypothetical protein  44 
 
 
232 aa  93.2  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_8  hypothetical protein  41.5 
 
 
212 aa  92.4  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1611  membrane protein  42.75 
 
 
233 aa  92.4  4e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0856  membrane protein  41.96 
 
 
210 aa  92  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000027794  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0965  membrane protein  41.96 
 
 
210 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000215591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_838  hypothetical protein  41.96 
 
 
210 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000326909  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13811  membrane protein  42.34 
 
 
206 aa  90.5  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  37.16 
 
 
194 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0008  membrane protein  44.34 
 
 
200 aa  88.6  5e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.89 
 
 
198 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.89 
 
 
198 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.89 
 
 
198 aa  87  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.89 
 
 
198 aa  87  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05631  membrane protein  40.69 
 
 
205 aa  87  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.89 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  39.16 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.89 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0684  protein of unknown function DUF205  34.69 
 
 
186 aa  86.7  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.89 
 
 
198 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  39.16 
 
 
190 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2057  membrane protein  46.96 
 
 
210 aa  86.3  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  41.94 
 
 
195 aa  86.7  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02929  hypothetical protein  41.09 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0641  protein of unknown function DUF205  41.09 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3352  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.09 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.187945  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0640  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.09 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000218346  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4371  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.09 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02879  hypothetical protein  41.09 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00143193  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3522  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.09 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3237  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.09 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.400213  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3490  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  41.09 
 
 
205 aa  85.9  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7848  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3397  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
205 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0827634  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3461  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0949629  normal  0.0662148 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3467  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.088969  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3393  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000138608  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3563  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.31 
 
 
203 aa  85.5  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.299047  normal  0.098829 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14881  membrane protein  29.89 
 
 
198 aa  84.7  7e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.97 
 
 
215 aa  84.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  33.33 
 
 
198 aa  84.7  8e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0008  membrane protein  39.25 
 
 
208 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.19 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1160  protein of unknown function DUF205  40.16 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  37.28 
 
 
200 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1223  protein of unknown function DUF205  36.36 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.165062  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2099  membrane protein  40.91 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.960995  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  44.44 
 
 
194 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.19 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1982  membrane protein  37.04 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  35.2 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1442  hypothetical protein  39.02 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.219709  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1415  hypothetical protein  39.02 
 
 
202 aa  82.8  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.06877  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1178  hypothetical protein  43.09 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.19 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1757  protein of unknown function DUF205  37.31 
 
 
198 aa  82  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2058  membrane protein  37.91 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1199  protein of unknown function DUF205  31.94 
 
 
215 aa  81.3  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1205  membrane protein  43.09 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1396  membrane protein  43.09 
 
 
216 aa  80.9  0.000000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0924  hypothetical protein  38.84 
 
 
202 aa  80.9  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.190869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5082  protein of unknown function DUF205  34.44 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2443  membrane protein  37.93 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2305  hypothetical protein  41.44 
 
 
277 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  34.01 
 
 
197 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2278  hypothetical protein  41.44 
 
 
277 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  34.75 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  35.83 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  39.17 
 
 
200 aa  79.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  40.83 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  40.68 
 
 
193 aa  79  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  34.04 
 
 
197 aa  79  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  40.16 
 
 
214 aa  79  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2175  membrane protein  36.71 
 
 
235 aa  79  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  30.94 
 
 
195 aa  78.6  0.00000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1592  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.69 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.827594  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0917  protein of unknown function DUF205  34.57 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.245059  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1025  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.62 
 
 
207 aa  78.2  0.00000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.942008  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1217  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.91 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10540  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.4 
 
 
208 aa  77.4  0.00000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3462  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.98 
 
 
203 aa  77.8  0.00000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000897575  normal  0.177811 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  34.13 
 
 
207 aa  77.4  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1321  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  43.93 
 
 
194 aa  77  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.351308 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  44.04 
 
 
203 aa  77  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0998  hypothetical protein  38.94 
 
 
219 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17280  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.77 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2581  membrane protein  37.24 
 
 
235 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0829  protein of unknown function DUF205  38.84 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.59 
 
 
182 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2260  hypothetical protein  37.7 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>