More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0363 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  100 
 
 		 390 aa  806    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  72.09 
 
 		 392 aa  611  9.999999999999999e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  71.58 
 
 		 392 aa  609  1e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2208  aminotransferase class I and II  70.98 
 
 		 387 aa  600  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0150  aminotransferase class I and II  62.96 
 
 		 386 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.870631  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  62.24 
 
 		 407 aa  511  1e-144  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3192  aminotransferase, class I and II  56.96 
 
 		 399 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  59.15 
 
 		 393 aa  471  1e-132  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2182  aminotransferase, class I and II  54.78 
 
 		 405 aa  470  1.0000000000000001e-131  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.100524  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  56.48 
 
 		 388 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1205  putative aspartate aminotransferase  56.05 
 
 		 397 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  55.17 
 
 		 390 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  53.54 
 
 		 387 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3463  aminotransferase  53.37 
 
 		 393 aa  449  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  53.28 
 
 		 404 aa  450  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  56.07 
 
 		 388 aa  450  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0048  aminotransferase class I and II  55.61 
 
 		 401 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00536151  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2099  aminotransferase  52.09 
 
 		 391 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  53.99 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0041  aminotransferase class I and II  54.83 
 
 		 402 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.782752  normal  0.197817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  54.81 
 
 		 386 aa  443  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  53.21 
 
 		 396 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  52.11 
 
 		 396 aa  435  1e-121  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  52.67 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  52.51 
 
 		 398 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  52.24 
 
 		 398 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  52.67 
 
 		 396 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  51.45 
 
 		 398 aa  432  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  53.07 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  51.84 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  53.07 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  52.8 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  53.07 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  53.07 
 
 		 396 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3007  hypothetical protein  54.38 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  52.14 
 
 		 396 aa  432  1e-120  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  53.49 
 
 		 387 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  54.84 
 
 		 388 aa  426  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1304  aminotransferase class I and II  54.17 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  50.13 
 
 		 385 aa  418  1e-116  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2473  aminotransferase, class I and II  49.6 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  52.11 
 
 		 386 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1745  aminotransferase class I and II  52.53 
 
 		 393 aa  413  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  53.63 
 
 		 391 aa  414  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  49.74 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  50.8 
 
 		 386 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  51.47 
 
 		 387 aa  404  1e-111  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3529  aminotransferase class I and II  51.99 
 
 		 385 aa  402  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1533  aminotransferase class I and II  50.4 
 
 		 385 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3535  aminotransferase class I and II  51.6 
 
 		 381 aa  397  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2858  aminotransferase class I and II  48.66 
 
 		 381 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.961149  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2149  aminotransferase class I and II  50.53 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.152538 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2839  aminotransferase class I and II  48.95 
 
 		 395 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326737 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1319  aminotransferase class I and II  50.93 
 
 		 380 aa  382  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0755058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  45.45 
 
 		 387 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  44.68 
 
 		 387 aa  364  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  44.68 
 
 		 387 aa  364  2e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  44.42 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  44.42 
 
 		 387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  44.42 
 
 		 387 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  44.76 
 
 		 385 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  44.42 
 
 		 387 aa  360  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  44.3 
 
 		 387 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  43.9 
 
 		 387 aa  358  8e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  44.16 
 
 		 387 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0316  aminotransferase A  43.32 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  40.89 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1809  aminotransferase A  40.67 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2836  aminotransferase class I and II  44.21 
 
 		 387 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.04752  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0046  aromatic amino acid aminotransferase  41.12 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0104565  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0045  aromatic amino acid aminotransferase  40.66 
 
 		 391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1232  aminotransferase  41.38 
 
 		 399 aa  306  3e-82  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28200  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  42.63 
 
 		 379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000110278  normal  0.621857 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  44.04 
 
 		 392 aa  305  1.0000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  39.63 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  39.63 
 
 		 380 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0921  aminotransferase  39.89 
 
 		 401 aa  300  3e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000271022  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0019  aromatic amino acid aminotransferase  39.57 
 
 		 391 aa  299  6e-80  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0735711  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0617  aminotransferase  39.64 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  40.78 
 
 		 380 aa  291  1e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0744  aminotransferase  41.33 
 
 		 394 aa  291  1e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0285306  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  41.71 
 
 		 370 aa  291  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  39.67 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  39.67 
 
 		 384 aa  288  1e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  41.94 
 
 		 379 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0633  aminotransferase, class I  37.47 
 
 		 394 aa  286  5.999999999999999e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0813459  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  41.49 
 
 		 375 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  40.8 
 
 		 375 aa  286  5.999999999999999e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  41.75 
 
 		 444 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  41.18 
 
 		 367 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  40.79 
 
 		 386 aa  282  9e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  42.86 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  39.12 
 
 		 387 aa  280  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2331  aspartate aminotransferase  42.3 
 
 		 388 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2382  aspartate aminotransferase  42.3 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1200  aminotransferase  38.21 
 
 		 393 aa  279  7e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.241319  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1924  aspartate aminotransferase  40.86 
 
 		 397 aa  279  8e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  40.87 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  40.59 
 
 		 397 aa  277  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1838  aromatic amino acid aminotransferase  37.92 
 
 		 397 aa  276  5e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>