208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0107 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0107  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 124 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.252801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  42.34 
 
 		 111 aa  94.4  5e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4115  sugE protein  40.37 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3956  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4435  sugE protein  40.37 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.944937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4232  sugE protein  40.37 
 
 		 110 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4288  sugE protein  40.37 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.948578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3967  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4343  sugE protein  40.37 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4068  small multidrug resistance protein  39.45 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4324  sugE protein  39.45 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0909  sugE protein  42.42 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000446848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1886  sugE protein  36.97 
 
 		 108 aa  81.3  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1073  small multidrug resistance protein  37.1 
 
 		 113 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.15784e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  43.27 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  41.67 
 
 		 108 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04008  SugE  43.27 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 104 aa  67  0.00000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 104 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  44.55 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  45.54 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  39.05 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  44 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  42.45 
 
 		 106 aa  65.5  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2191  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1336  chaperonin  35.79 
 
 		 108 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  41.18 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 105 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  35.58 
 
 		 105 aa  62  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  40.59 
 
 		 104 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  42.72 
 
 		 105 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  40.78 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0744  small multidrug resistance protein  32.73 
 
 		 118 aa  60.1  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  41.58 
 
 		 105 aa  59.7  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 112 aa  59.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  38.1 
 
 		 107 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4447  putative sugE protein  32.11 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00163881  normal  0.507706 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0792  sugE protein  35.29 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0996  putative sugE protein  34.31 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0741  quaternary ammonium compound-resistance protein  35.29 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140212  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0728  quaternary ammonium compound-resistance protein  35.29 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00042757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0832  sugE protein  35.29 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381598  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4914  SugE protein  34.62 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0927  putative sugE protein  35.29 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3479e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0324  SugE protein  34.62 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0887  putative sugE protein  34.31 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373229  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  40.2 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0925  sugE protein, putative  33.33 
 
 		 114 aa  57.8  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0705375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  40.59 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  39.81 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  44.55 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0476  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 106 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.651583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  40.38 
 
 		 105 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1183  chaperonin  42.86 
 
 		 108 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2608  small multidrug resistance protein  39.45 
 
 		 108 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  41.41 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4255  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.956608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  38.46 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 106 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1095  SMR drug efflux transporter  34.58 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.1863  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  38.1 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  35.92 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  35.92 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2659  small multidrug resistance protein  38.68 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.188052  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1901  sugE protein  45.78 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1338  membrane transporter  32.08 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.265274  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  39 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  39 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  35.85 
 
 		 106 aa  53.5  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  34.58 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1722  small multidrug resistance protein  44.58 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  38.61 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  37.74 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  36.89 
 
 		 155 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0113  small multidrug resistance protein  39.42 
 
 		 105 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  37.62 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0272  small multidrug resistance protein  37.25 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  36.79 
 
 		 106 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2825  small multidrug resistance protein  44.58 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2970  small multidrug resistance protein  44.58 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.82632  normal  0.546887 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 		 106 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8958  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  35.64 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.205406  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  36.89 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 		 105 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3464  small multidrug resistance protein  38.89 
 
 		 116 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.667657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>