56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1183 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1183  chaperonin  100 
 
 		 108 aa  213  5e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1336  chaperonin  53.7 
 
 		 108 aa  121  3e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.660374  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1392  putative multidrug resistance protein, SMR family  44.44 
 
 		 115 aa  64.3  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.464032  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0332  SMR family multidrug efflux pump  38.89 
 
 		 112 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.887885  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0355  SMR family multidrug efflux pump  38.89 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1655  SMR family multidrug efflux pump  38.89 
 
 		 112 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0677066  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0107  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.252801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  30 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0925  sugE protein, putative  30.56 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0705375  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0324  SugE protein  31.37 
 
 		 231 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0996  putative sugE protein  29.63 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0744  small multidrug resistance protein  29.63 
 
 		 118 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2191  small multidrug resistance protein  44.23 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0792  sugE protein  28.7 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0832  sugE protein  28.7 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0927  putative sugE protein  28.7 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3479e-48 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4447  putative sugE protein  29.63 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00163881  normal  0.507706 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0728  quaternary ammonium compound-resistance protein  28.7 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00042757  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0741  quaternary ammonium compound-resistance protein  28.7 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3956  small multidrug resistance protein  27 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4115  sugE protein  27 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0887  putative sugE protein  29.63 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4435  sugE protein  27 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.944937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4232  sugE protein  27 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  35.19 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3967  small multidrug resistance protein  27.27 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4343  sugE protein  27 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4288  sugE protein  27 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.948578  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4914  SugE protein  29.41 
 
 		 231 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1886  sugE protein  29.17 
 
 		 108 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 105 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  35.63 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  35.63 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  28.43 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0909  sugE protein  25 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000446848  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4324  sugE protein  25.25 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  32.08 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4068  small multidrug resistance protein  25.25 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  34 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  32.35 
 
 		 104 aa  43.5  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  32.35 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  31.13 
 
 		 105 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2408  small multidrug resistance protein  25.23 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.272126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  24.51 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2320  small multidrug resistance protein  34.38 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  33 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0455  multidrug resistance protein SugE, putative  35 
 
 		 105 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4387  small multidrug resistance protein  25.49 
 
 		 106 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0621  small multidrug resistance protein  27.68 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.852662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  28.28 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3403  small multidrug resistance protein  26.21 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1073  small multidrug resistance protein  30.77 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.15784e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4409  small multidrug resistance protein  25.49 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>