173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_2191 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_2191  small multidrug resistance protein  100 
 
 
103 aa  202  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0107  small multidrug resistance protein  35.29 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.252801  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1886  sugE protein  35.71 
 
 
108 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4115  sugE protein  34.34 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3956  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.193441  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4435  sugE protein  34.34 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.944937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4232  sugE protein  34.34 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4343  sugE protein  34.34 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4288  sugE protein  34.34 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.948578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3967  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0909  sugE protein  34.34 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000446848  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4324  sugE protein  34.34 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.80388  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4068  small multidrug resistance protein  34.34 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2904  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
111 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.174839  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1773  DMT superfamily multidrug efflux pump  38.24 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.251074  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0420  small multidrug resistance protein  38.24 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  32.71 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1336  chaperonin  37.63 
 
 
108 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.660374  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2478  small multidrug resistance protein  36.27 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
104 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0570  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
101 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.36116 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2430  small multidrug resistance protein  34.91 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0811704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0979  small multidrug resistance protein  34.29 
 
 
107 aa  56.6  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 
153 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  31.73 
 
 
104 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  32.67 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1574  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
106 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 
105 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
104 aa  55.1  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1398  small multidrug resistance protein  35.24 
 
 
106 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  33.98 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  34.65 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  31.73 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
105 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1290  small multidrug resistance protein  30.1 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167958  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
105 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4914  SugE protein  35.05 
 
 
231 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0324  SugE protein  35.05 
 
 
231 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
105 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4068  small multidrug resistance protein  32.38 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  29.7 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
104 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  40 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2945  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46208  normal  0.904124 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  29.81 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  29.52 
 
 
110 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 
104 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1392  putative multidrug resistance protein, SMR family  32.93 
 
 
115 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.464032  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2011  SugE protein  31.37 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.257959 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1403  small multidrug resistance protein  29.81 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0526825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  33.66 
 
 
104 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  34 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0996  putative sugE protein  29 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000683055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0925  sugE protein, putative  29.81 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0705375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  29.7 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  29.7 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  29.7 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1231  small multidrug resistance protein  29.52 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.116721  normal  0.7202 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  29.7 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  29.7 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  29.7 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  32.67 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  29.7 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  29.7 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  29.7 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  28.97 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0744  small multidrug resistance protein  28.85 
 
 
118 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0355  SMR family multidrug efflux pump  30 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0792  sugE protein  28.85 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000018109  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0741  quaternary ammonium compound-resistance protein  28.85 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00140212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0728  quaternary ammonium compound-resistance protein  28.85 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00042757  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  29.41 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  29.41 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  35.64 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  31.68 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0832  sugE protein  28.85 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000381598  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4447  putative sugE protein  29.81 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00163881  normal  0.507706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0927  putative sugE protein  28.85 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3479e-48 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0332  SMR family multidrug efflux pump  30 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.887885  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1655  SMR family multidrug efflux pump  29.63 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0677066  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  31.68 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  29.41 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  29.7 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
106 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0887  putative sugE protein  29.81 
 
 
114 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3013  small multidrug resistance protein  33.33 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  26.73 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1183  chaperonin  44.23 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1727  exporter protein  30.39 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2731  small multidrug resistance protein  30.69 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000850052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4913  SugE protein  31.68 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  29.7 
 
 
104 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>