More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1290 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_1290  small multidrug resistance protein  100 
 
 		 105 aa  196  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.167958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2158  small multidrug resistance protein  47.52 
 
 		 104 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0337  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  47.17 
 
 		 105 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000205037 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5609  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.329891  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1965  small multidrug resistance protein  45.92 
 
 		 104 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0685  small multidrug resistance protein  46.23 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0773  sugE protein  45.92 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.757365  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2515  small multidrug resistance protein  47.96 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.686448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1666  small multidrug resistance protein  46.94 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0202268  normal  0.0201318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3611  small multidrug resistance protein  45.28 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.417891 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1856  putative transporter  44.9 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101547  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21770  DMT family permease  45.92 
 
 		 104 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.932562  normal  0.189308 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2305  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3817  small multidrug resistance protein  47.96 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.113303  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1670  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.35207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2282  small multidrug resistance protein  48.48 
 
 		 106 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.597092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3671  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  47.47 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3146  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 104 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.169458  normal  0.0263424 
 
 
-
 
NC_004310  BR0780  sugE protein  44.9 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.243642  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0853  small multidrug resistance protein  45.54 
 
 		 105 aa  74.3  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1701  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.218727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4019  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 105 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1298  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 105 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0090  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE2  44.34 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259737  normal  0.0421305 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0085  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE1  44.34 
 
 		 146 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.161559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2336  small multidrug resistance protein  45.92 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.155364  normal  0.542758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1634  small multidrug resistance protein  45.45 
 
 		 105 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0656851 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1256  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 105 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00359766 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3842  small multidrug resistance protein  44.34 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4392  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.34 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0996  small multidrug resistance protein  46.46 
 
 		 106 aa  72  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.762024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4620  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.34 
 
 		 105 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0974286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3862  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.34 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.131807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4681  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.34 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4202  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 105 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.545062 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4708  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.34 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5667  quaternary ammonium compound-resistance protein SugE  44.34 
 
 		 105 aa  72  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0511297 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1338  membrane transporter  44 
 
 		 106 aa  72.4  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.265274  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2080  small multidrug resistance protein  44.9 
 
 		 104 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235888  normal  0.293882 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0613  hypothetical protein  41.41 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0595  hypothetical protein  41.41 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2235  small multidrug resistance protein  41.84 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0616  small multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 105 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.88639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0324  SugE protein  39.25 
 
 		 231 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3404  putative transporter  43.14 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.649616  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1313  small multidrug resistance protein  42.42 
 
 		 106 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.177322 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1878  small multidrug resistance protein  43.88 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.337942  normal  0.058805 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04020  multidrug efflux system protein  45.45 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03982  hypothetical protein  45.45 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2198  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2320  small multidrug resistance protein  44.44 
 
 		 106 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.303478  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2446  small multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 105 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4914  SugE protein  39.25 
 
 		 231 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3247  small multidrug efflux pump  44.44 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.848781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00178  putative exporter protein (SMR family)  40.59 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1005  sugE protein  46.94 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2052  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712643 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4732  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00175948 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1870  sugE protein  43.43 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.437905  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1399  suppresses groEL, may be chaperone  43.43 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0373  sugE protein  43.43 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40170  putative transporter  42.16 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1090  sugE protein  43.43 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0777  sugE protein  43.43 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.590294  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1249  SMR family multidrug efflux pump  43.43 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1257  SMR family multidrug efflux pump  43.43 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303472  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0283  SugE protein  48.78 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2526  small multidrug resistance protein  41.84 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.158974  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5065  small multidrug resistance protein  43.56 
 
 		 105 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.929302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1679  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 104 aa  67  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.627389  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0112  membrane transporter  48 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000063895  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3903  small multidrug resistance protein  41.28 
 
 		 112 aa  67  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1759  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 106 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0707  sugE protein  44.44 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.411222  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3312  small multidrug resistance protein  43.3 
 
 		 106 aa  66.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0627719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1950  small multidrug resistance protein  41.84 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.498297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1392  small multidrug resistance protein  44.12 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0982  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.900184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0415  small multidrug resistance protein  40.37 
 
 		 108 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179992 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1016  small multidrug resistance protein  42.86 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.555667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1027  sugE protein  41.41 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3160  small multidrug resistance protein  43.43 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1672  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.737958  normal  0.915426 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1352  small multidrug resistance protein  41.41 
 
 		 104 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1397  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 106 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118337 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0763  small multidrug resistance protein  41.84 
 
 		 110 aa  65.1  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6417  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 106 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3195  small multidrug resistance protein  39.18 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.141243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4254  small multidrug resistance protein  45.26 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3713  small multidrug resistance protein  39 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.314785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3948  small multidrug resistance protein  42.57 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3825  small multidrug resistance protein  42.16 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2170  small multidrug resistance protein  43.16 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2650  small multidrug resistance protein  39.6 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0325  SugE protein  41.25 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1141  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.564702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2027  small multidrug resistance protein  40.4 
 
 		 105 aa  63.9  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.067086  normal  0.084051 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3646  small multidrug resistance protein  43.14 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4436  sugE protein  38.54 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1502  small multidrug resistance protein  42.27 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>