156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0179 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_0179  protein of unknown function DUF47  100 
 
 
217 aa  443  1e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0191  protein of unknown function DUF47  54.93 
 
 
213 aa  233  2e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.170479 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2678  protein of unknown function DUF47  46.26 
 
 
213 aa  198  4e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.509665 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2577  hypothetical protein  41.86 
 
 
214 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0388  hypothetical protein  43 
 
 
205 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1039  hypothetical protein  39.07 
 
 
209 aa  163  2e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0589632  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0763  hypothetical protein  40.19 
 
 
209 aa  154  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.615042  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3584  hypothetical protein  40.1 
 
 
206 aa  153  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0575149  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3132  hypothetical protein  39.13 
 
 
205 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.31524e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3866  protein of unknown function DUF47  38.65 
 
 
205 aa  151  6e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0997  6Fe-6S prismane cluster-containing protein-like protein  37.5 
 
 
209 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.3197  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3782  protein of unknown function DUF47  38.16 
 
 
205 aa  150  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.287695  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3130  hypothetical protein  38.86 
 
 
204 aa  148  5e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.418855  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4136  hypothetical protein  38.16 
 
 
205 aa  147  1e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00579708  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0033  hypothetical protein  40.29 
 
 
209 aa  147  2e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_31  hypothetical protein  40.1 
 
 
219 aa  145  3e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1967  protein of unknown function DUF47  34.76 
 
 
209 aa  144  7e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0784272 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0030  hypothetical protein  38.57 
 
 
209 aa  142  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4227  hypothetical protein  38.32 
 
 
211 aa  140  2e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0044  hypothetical protein  38.16 
 
 
209 aa  139  4e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4360  protein of unknown function DUF47  38.32 
 
 
211 aa  137  8e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4383  protein of unknown function DUF47  38.32 
 
 
211 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0340167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1022  hypothetical protein  36.67 
 
 
209 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.808051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0586  protein of unknown function DUF47  38.46 
 
 
205 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0141186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0891  protein of unknown function DUF47  38.94 
 
 
205 aa  136  3e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4377  hypothetical protein  37.38 
 
 
211 aa  133  2e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.552455  normal  0.0605917 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0449  hypothetical protein  37.5 
 
 
205 aa  130  2e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.124613  normal  0.413809 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0548  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  128  8e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0562  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  127  1e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2745  hypothetical protein  36.71 
 
 
205 aa  125  3e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0308297  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0739  protein of unknown function DUF47  35.1 
 
 
210 aa  121  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2888  Putitive phosphate transport regulator  35.27 
 
 
208 aa  121  1e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.977017 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0588  protein of unknown function DUF47  36.1 
 
 
205 aa  120  1e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33550  phosphate transport regulator related to PhoU  35.61 
 
 
206 aa  120  1e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.108249  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0128  protein of unknown function DUF47  34.93 
 
 
212 aa  120  2e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2118  protein of unknown function DUF47  34.63 
 
 
207 aa  119  4e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140894  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2707  protein of unknown function DUF47  33.8 
 
 
215 aa  117  1e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1336  protein of unknown function DUF47  33.97 
 
 
211 aa  117  1e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3022  Putative phosphate transport regulator  32.38 
 
 
206 aa  117  1e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3359  hypothetical protein  33.8 
 
 
215 aa  117  1e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0282  hypothetical protein  36.54 
 
 
282 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.838969  normal  0.0453648 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4385  Putitive phosphate transport regulator  35.96 
 
 
205 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1398  hypothetical protein  34.74 
 
 
215 aa  116  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2657  hypothetical protein  33.65 
 
 
204 aa  115  4e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1151  hypothetical protein  33.8 
 
 
215 aa  115  4e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5349  hypothetical protein  34.58 
 
 
215 aa  115  6e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0870  protein of unknown function DUF47  32.68 
 
 
206 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422278  normal  0.132499 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1248  protein of unknown function DUF47  34.78 
 
 
208 aa  115  7e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.108583  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1187  protein of unknown function DUF47  34.78 
 
 
208 aa  115  7e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0873064  normal  0.0562102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1778  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  114  8e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1892  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  114  8e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  4.97448e-05  hitchhiker  6.94622e-09 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0325  hypothetical protein  35.1 
 
 
208 aa  114  8e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6210  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  114  8e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.528851  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1869  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  114  8e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1405  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  114  1e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.80224 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1806  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  114  1e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.49421  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1880  hypothetical protein  35.05 
 
 
215 aa  114  1e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0558  protein of unknown function DUF47  31.92 
 
 
215 aa  113  2e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0299  protein of unknown function DUF47  34.15 
 
 
206 aa  113  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.686471  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5169  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  112  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2411  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  112  4e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.644101  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2184  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  112  4e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.390365  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1399  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  112  4e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.238771  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2396  inorganic phosphate transporter  32.06 
 
 
208 aa  112  4e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.333431  normal  0.154826 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1122  hypothetical protein  31.88 
 
 
212 aa  112  4e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.12514e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2246  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  112  4e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0649417  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1889  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  112  4e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336902  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0007  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  112  4e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582837  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2285  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  112  4e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1162  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  112  4e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1469  protein of unknown function DUF47  33.8 
 
 
214 aa  112  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1312  hypothetical protein  34.3 
 
 
208 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1686  hypothetical protein  33.8 
 
 
215 aa  112  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2238  protein of unknown function DUF47  33.99 
 
 
206 aa  112  5e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.746394 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2384  protein of unknown function DUF47  42.24 
 
 
204 aa  111  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2877  protein of unknown function DUF47  33.33 
 
 
206 aa  111  7e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0461875  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1791  protein of unknown function DUF47  32.06 
 
 
208 aa  111  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0557964 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1974  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  110  1e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0570237  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1647  hypothetical protein  31.43 
 
 
211 aa  110  2e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1405  hypothetical protein  31.46 
 
 
215 aa  110  2e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0916  hypothetical protein  32.21 
 
 
208 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0624506  normal  0.265186 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2818  Putitive phosphate transport regulator  35.12 
 
 
206 aa  108  4e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.653252  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1484  protein of unknown function DUF47  28.5 
 
 
208 aa  108  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  5.48446e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2001  hypothetical protein  32.85 
 
 
208 aa  108  6e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1509  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  108  7e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0044058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1179  hypothetical protein  32.86 
 
 
206 aa  108  8e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  7.50489e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1084  Putitive phosphate transport regulator  31.1 
 
 
211 aa  108  9e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3420  protein of unknown function DUF47  31.43 
 
 
210 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3836  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.103602  hitchhiker  8.51308e-11 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1377  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  1.52766e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0240  hypothetical protein  31.88 
 
 
209 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1615  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  106  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.02331e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1335  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  6.52491e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1577  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  106  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  1.93859e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1362  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.80581e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0920  hypothetical protein  31.6 
 
 
208 aa  105  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1546  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.12847e-09 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1472  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  105  5e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.121556  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1336  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  105  5e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0728144  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2028  hypothetical protein  31.22 
 
 
205 aa  103  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>