More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1384 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  100 
 
 
283 aa  573  1e-163  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  47.23 
 
 
440 aa  256  2e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  2.92327e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.02 
 
 
402 aa  256  4e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 
453 aa  254  1e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3733  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.32 
 
 
283 aa  253  2e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000159277  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  46.8 
 
 
398 aa  246  3e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.86 
 
 
411 aa  246  4e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0326  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  45.62 
 
 
276 aa  244  9e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.339036  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  43.51 
 
 
284 aa  244  1e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  1.76304e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  46.13 
 
 
456 aa  244  1e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.48 
 
 
395 aa  238  6e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  40.36 
 
 
380 aa  237  2e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  44.11 
 
 
284 aa  235  5e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 
278 aa  235  6e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.49 
 
 
403 aa  234  1e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  46.03 
 
 
278 aa  231  1e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1858  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
541 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  43.95 
 
 
281 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 
281 aa  225  5e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1103  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.63 
 
 
266 aa  223  3e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2439  cobalt transport protein ATP-binding subunit  41.22 
 
 
252 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 
403 aa  214  1e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  39.59 
 
 
249 aa  214  1e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 
285 aa  211  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
270 aa  211  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1151  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
276 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.949542  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
277 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.41 
 
 
285 aa  209  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 
271 aa  208  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
250 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 
281 aa  206  2e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.55 
 
 
285 aa  206  5e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.92 
 
 
243 aa  205  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.8 
 
 
277 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 
259 aa  204  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.85 
 
 
288 aa  203  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1756  cobalt transport protein ATP-binding subunit  37.2 
 
 
274 aa  202  3e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.62 
 
 
281 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
242 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.93 
 
 
246 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  37.04 
 
 
263 aa  201  1e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  41.13 
 
 
310 aa  201  1e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0515  cobalt ABC transporter ATPase subunit  39.43 
 
 
271 aa  198  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0790003  normal  0.0377696 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.04 
 
 
285 aa  198  1e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000401598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.56 
 
 
256 aa  197  1e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.286665  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
264 aa  197  2e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.06 
 
 
277 aa  197  2e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4722  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.13 
 
 
274 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0275  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.33 
 
 
270 aa  196  3e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2592  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.86 
 
 
283 aa  196  5e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.201845  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1548  ABC transporter related  34.78 
 
 
280 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  4.72949e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1694  cobalt transport protein ATP-binding subunit  36.06 
 
 
291 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.76 
 
 
257 aa  194  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 
244 aa  193  3e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.36 
 
 
273 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  4.82859e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.6 
 
 
280 aa  192  7e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00576105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1801  ABC transporter related protein  37.75 
 
 
254 aa  192  7e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.447386  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  35.84 
 
 
282 aa  191  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4055  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.27 
 
 
250 aa  190  2e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.50741  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  36.02 
 
 
258 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.24 
 
 
259 aa  190  3e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.93 
 
 
253 aa  190  3e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0563  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.5 
 
 
243 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2004  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 
249 aa  189  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.25623e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0160  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.07 
 
 
280 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00729869  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2790  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
305 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154415  decreased coverage  0.00019128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  38.14 
 
 
246 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0170  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
280 aa  189  6e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  5.74409e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
280 aa  189  6e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.685034  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
256 aa  188  7e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 
276 aa  188  8e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2223  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 
249 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.84786e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3657  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  34.85 
 
 
286 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.910975  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0152  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
280 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.00748e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.45 
 
 
280 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.4479e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1354  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.3 
 
 
252 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0884  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
255 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0139  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.07 
 
 
300 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0134  cobalt transporter ATP-binding subunit  37.07 
 
 
300 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000103896  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0057  ABC transporter related  40.25 
 
 
255 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0112195  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0059  ABC transporter related  40.25 
 
 
255 aa  185  7e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0169  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40.45 
 
 
252 aa  185  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.889814 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 
274 aa  185  8e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  39.58 
 
 
242 aa  183  2e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0542  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  39.75 
 
 
255 aa  184  2e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1184  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 
254 aa  184  2e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116331  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0132  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.68 
 
 
300 aa  183  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0897  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.92 
 
 
277 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  1.5399e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2767  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.84 
 
 
255 aa  183  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  39.61 
 
 
272 aa  182  4e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1706  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 
267 aa  182  5e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5166  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.91 
 
 
280 aa  182  6e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  1.09304e-05  hitchhiker  6.33423e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0140  cobalt transporter ATP-binding subunit  38.1 
 
 
280 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  2.87993e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0789  ABC transporter related  41.73 
 
 
281 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0847492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2934  ABC transporter related protein  41.22 
 
 
299 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.786781  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3823  ABC transporter related  34.25 
 
 
284 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0540  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.54 
 
 
279 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0133  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.43 
 
 
280 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  4.21792e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1750  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
248 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.79026  normal  0.0336767 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 
270 aa  179  5e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.286064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>