23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0422 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0422  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  587  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000226876  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0452  hypothetical protein  31.82 
 
 
222 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.262735  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3902  heavy metal efflux pump CzcA  28.21 
 
 
270 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2118  hypothetical protein  37.14 
 
 
228 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0137  hypothetical protein  29.35 
 
 
204 aa  70.1  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5337  protein of unknown function DUF1707  35.21 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.066976  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1285  hypothetical protein  32.67 
 
 
190 aa  62.8  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000861164  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0580  hypothetical protein  33.33 
 
 
235 aa  61.2  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00417112  hitchhiker  0.000606233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1539  hypothetical protein  21.72 
 
 
261 aa  60.5  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.312846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08380  hypothetical protein  34.91 
 
 
219 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3489  putative transmembrane protein  27.27 
 
 
234 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.292504  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6589  putative transmembrane protein  30.84 
 
 
268 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.508374  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0345  protein of unknown function DUF1707  30.77 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0733531  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0138  hypothetical protein  36.47 
 
 
206 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6436  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 
218 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2915  putative transmembrane protein  29.27 
 
 
227 aa  48.9  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.614544  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3279  protein of unknown function DUF1707  33.33 
 
 
215 aa  48.5  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.361126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1801  protein of unknown function DUF1707  34.94 
 
 
231 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.266155 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3765  hypothetical protein  27.48 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.541695  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1382  protein of unknown function DUF1707  28.85 
 
 
217 aa  47.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05520  protein of unknown function (DUF1707)  35.29 
 
 
215 aa  43.5  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5250  protein of unknown function DUF1707  32.14 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.935721  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3297  protein of unknown function DUF1707  35.53 
 
 
200 aa  42  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>