36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2171 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2171  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2359  phosphatidate cytidylyltransferase  87.34 
 
 		 237 aa  429  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0369  phosphatidate cytidylyltransferase  88.19 
 
 		 237 aa  429  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.104235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2225  phosphatidate cytidylyltransferase  71.05 
 
 		 237 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0239  hypothetical protein  77.93 
 
 		 227 aa  352  4e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.978297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0424  phosphatidate cytidylyltransferase  31.35 
 
 		 275 aa  107  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46136  predicted protein  34.95 
 
 		 719 aa  95.1  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35668  predicted protein  30.41 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.406511 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0735  phosphatidate cytidylyltransferase  28.02 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.859315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3363  phosphatidate cytidylyltransferase  30.29 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37217 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4221  phosphatidate cytidylyltransferase  25.97 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.030183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3224  phosphatidate cytidylyltransferase  27.78 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.28276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2872  phosphatidate cytidylyltransferase  27.31 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0082  phosphatidate cytidylyltransferase  40.22 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.184871  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34441  predicted protein  28.57 
 
 		 286 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2240  phosphatidate cytidylyltransferase  26.34 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.687386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4143  phosphatidate cytidylyltransferase  29.81 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.444862  normal  0.0250371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0667  phosphatidate cytidylyltransferase  27.89 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18321  dolichol kinase  28.95 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21791  dolichol kinase  28.12 
 
 		 217 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29961  dolichol kinase  27.14 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.853518 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2717  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  26.4 
 
 		 208 aa  48.9  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.480674  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2406  CTP:2, 3-di-O-geranylgeranyl-sn-glycero-1-phosphate cytidyltransferase  27.03 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.531038  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0852  hypothetical protein  30.77 
 
 		 387 aa  48.5  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3830  phosphatidate cytidylyltransferase  27.55 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56382  predicted protein  26.57 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58284  dolichol kinase  28.66 
 
 		 562 aa  46.2  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0456879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3113  hypothetical protein  29.33 
 
 		 298 aa  45.4  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0147985 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1306  hypothetical protein  27.13 
 
 		 217 aa  45.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1951  phosphatidate cytidylyltransferase  28.69 
 
 		 444 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05650  dolichol kinase, putative  27.93 
 
 		 1011 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.979152  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2262  phosphatidate cytidylyltransferase  33.61 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1715  protein of unknown function DUF92 transmembrane  30.35 
 
 		 509 aa  43.1  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1043  hypothetical protein  26.24 
 
 		 217 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0488  phosphatidate cytidylyltransferase  25.5 
 
 		 220 aa  42.4  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1564  membrane protein  28.21 
 
 		 206 aa  42  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>