More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1621 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1621  phosphate binding protein  100 
 
 
290 aa  592  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.048738  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1037  phosphate binding protein  83.76 
 
 
272 aa  475  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.231366  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1776  phosphate binding protein  76.31 
 
 
290 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1246  phosphate binding protein  77.12 
 
 
271 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.249148  normal  0.478503 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0943  phosphate binding protein  72.32 
 
 
272 aa  394  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.478701 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1229  phosphate binding protein  74.23 
 
 
271 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.994319 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1620  phosphate binding protein  71.54 
 
 
272 aa  371  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.631729  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1245  phosphate binding protein  66.53 
 
 
264 aa  353  2e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.120357  normal  0.505527 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1038  phosphate binding protein  62.78 
 
 
270 aa  343  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1682  phosphate binding protein  68.42 
 
 
276 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000225602  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0095  phosphate binding protein  45.02 
 
 
272 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1097  phosphate binding protein  39.78 
 
 
277 aa  211  1e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00171228  normal  0.562956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0566  phosphate binding protein  41.76 
 
 
282 aa  206  4e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0381981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21620  phosphate binding protein  42.21 
 
 
273 aa  206  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.207448  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0765  phosphate binding protein  46.56 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.173796 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1118  hypothetical protein  41.09 
 
 
278 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1062  phosphate binding protein  41.44 
 
 
267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1956  phosphate binding protein  41.39 
 
 
283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1161  phosphate binding protein  43.55 
 
 
272 aa  191  8e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.946616  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2985  phosphate binding protein  42.23 
 
 
303 aa  186  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2276  phosphate binding protein  39.93 
 
 
285 aa  185  7e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1925  phosphate binding protein  43.9 
 
 
278 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0255189  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1778  phosphate-binding protein  38.74 
 
 
301 aa  180  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.362088  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2753  phosphate binding protein  40.91 
 
 
381 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0480  phosphate binding protein  42.91 
 
 
332 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0232  phosphate binding protein  44.4 
 
 
284 aa  179  4.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0138  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  42.74 
 
 
278 aa  174  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0069  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  38.04 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.524942  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1667  phosphate binding protein  37.74 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000945137  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05137  ABC-type phosphate transport system periplasmic component  37.91 
 
 
273 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001262  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein PstS  37.18 
 
 
273 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0752  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  37.97 
 
 
285 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.294794  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_146  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  39.93 
 
 
285 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0618  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  36.23 
 
 
272 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2106  phosphate binding protein  38.52 
 
 
284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2886  phosphate binding protein  40.23 
 
 
271 aa  166  4e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.197521 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1652  phosphate binding protein  39.68 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0474574  normal  0.902005 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1572  phosphate binding protein  36.4 
 
 
281 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0705  phosphate binding protein  40.67 
 
 
330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.125425  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0603  extracellular solute-binding protein, putative  37.11 
 
 
276 aa  162  6e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.924235  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0347  phosphate binding protein  35.92 
 
 
281 aa  161  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000432428 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2118  phosphate ABC transporter, extracellular solute-binding protein  35.74 
 
 
273 aa  159  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0418  phosphate binding protein  40.49 
 
 
270 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.704619 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1345  phosphate binding protein  37.86 
 
 
272 aa  158  9e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.773694  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0617  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  37.02 
 
 
276 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.774542  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0270  phosphate binding protein  39.52 
 
 
287 aa  155  6e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.100843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0489  phosphate binding protein  39 
 
 
281 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.895081  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2834  phosphate binding protein  36.86 
 
 
307 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4148  phosphate binding protein  41.7 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4122  phosphate binding protein  41.7 
 
 
272 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1428  phosphate binding protein  34.91 
 
 
278 aa  151  8.999999999999999e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4006  ABC transporter, periplasmic phosphate binding protein  41.98 
 
 
272 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0604  phosphate ABC transporter phosphate-binding protein  38.99 
 
 
218 aa  151  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.404016  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0420  phosphate binding protein  38.17 
 
 
279 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2545  phosphate binding protein  34.54 
 
 
268 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.12686 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4292  phosphate ABC transporter, periplasmic phosphate-binding protein  33.8 
 
 
269 aa  149  8e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0781  phosphate binding protein  39.69 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0456  phosphate binding protein  37.34 
 
 
292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1917  phosphate binding protein  38.46 
 
 
328 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.266865  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1355  phosphate binding protein  35.98 
 
 
273 aa  145  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.251811  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2843  phosphate binding protein  36.51 
 
 
277 aa  145  9e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000171596  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1829  phosphate binding protein  32.6 
 
 
273 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0589  phosphate binding protein  41.24 
 
 
292 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1995  phosphate binding protein  38.58 
 
 
294 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.932228  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21580  phosphate binding protein  36.47 
 
 
302 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4359  OmpA/MotB domain-containing protein  35.24 
 
 
558 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0286  phosphate binding protein  33.33 
 
 
281 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.453711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2587  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  33.94 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.705823  normal  0.898892 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0555  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.73 
 
 
288 aa  140  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000309892  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1480  phosphate binding protein  35.64 
 
 
274 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.373037  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1932  phosphate binding protein  31.25 
 
 
274 aa  138  8.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1951  phosphate binding protein  33.73 
 
 
303 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1556  phosphate binding protein  33.2 
 
 
274 aa  136  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4228  phosphate binding protein  33.09 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28140  phosphate-binding protein  35.14 
 
 
285 aa  135  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.549529  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1507  phosphate binding protein  32.94 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0405  phosphate binding protein  33.07 
 
 
281 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000789455  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2437  OmpA/MotB domain-containing protein  34.96 
 
 
460 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2488  phosphate binding protein  37.63 
 
 
280 aa  132  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3635  phosphate binding protein  33.96 
 
 
692 aa  132  6.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.248757  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0586  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  33.33 
 
 
302 aa  132  9e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0826  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  34.1 
 
 
277 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.92452e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2613  OmpA family protein  33.48 
 
 
482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.429058  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0486  phosphate binding protein  35.06 
 
 
339 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31620  hypothetical protein  32.3 
 
 
464 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.101757 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0427  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  34.9 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000177912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0175  phosphate binding protein  32.52 
 
 
296 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1006  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  30.22 
 
 
291 aa  126  5e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000926603  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0992  phosphate ABC transporter, phosphate-binding protein  32.37 
 
 
286 aa  125  7e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000365841  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0697  phosphate binding protein  36.22 
 
 
278 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2689  hypothetical protein  31.86 
 
 
465 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5179  TonB family protein  27.31 
 
 
558 aa  125  9e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0378  phosphate binding protein  32.59 
 
 
326 aa  124  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0556  ABC-type phosphate transport system, periplasmic component  31.62 
 
 
298 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00147571  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1490  phosphate binding protein  32.47 
 
 
338 aa  124  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.426195  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1829  phosphate binding protein  32.32 
 
 
338 aa  124  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3650  OmpA/MotB  31.86 
 
 
444 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61237  normal  0.0662024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3956  phosphate binding protein  31.68 
 
 
333 aa  122  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.284736 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2396  phosphate binding protein  32.3 
 
 
298 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2588  ABC phosphate transporter periplasmic phosphate-binding protein  30.5 
 
 
288 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.72146  normal  0.887714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>