More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0322 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  100 
 
 		 411 aa  833    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  59.95 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  56.72 
 
 		 422 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  55.67 
 
 		 428 aa  415  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  53.06 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000520472  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  51.49 
 
 		 436 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  50.62 
 
 		 422 aa  372  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000576883  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  39.07 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.000000091683  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  34.46 
 
 		 429 aa  225  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  34.63 
 
 		 428 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  33.42 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  33.73 
 
 		 429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  35.05 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  34.07 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2329  FolC bifunctional protein  35.78 
 
 		 426 aa  207  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  37.13 
 
 		 424 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  33.74 
 
 		 459 aa  206  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  34.7 
 
 		 431 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  31.95 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  34.46 
 
 		 433 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  36.14 
 
 		 434 aa  202  8e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000374021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  37.35 
 
 		 428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.35 
 
 		 466 aa  196  6e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 		 424 aa  196  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  35.84 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  35.66 
 
 		 424 aa  193  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  31.53 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  36.67 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  35.37 
 
 		 440 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  33.09 
 
 		 422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  31.31 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000137038  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  36.04 
 
 		 424 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  29.41 
 
 		 404 aa  190  5e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.4 
 
 		 433 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0075  FolC bifunctional protein  34.75 
 
 		 442 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0673465  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  29.16 
 
 		 433 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.16 
 
 		 433 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  29.16 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  29.16 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  29.16 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  35.21 
 
 		 425 aa  186  8e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  31.75 
 
 		 428 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.4 
 
 		 433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  29.26 
 
 		 433 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1468  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.17 
 
 		 422 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0353  folylpolyglutamate synthetase  32.62 
 
 		 434 aa  182  8.000000000000001e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  32.06 
 
 		 424 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0632  FolC bifunctional protein  35.1 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.423078 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  28.33 
 
 		 433 aa  180  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  31.58 
 
 		 431 aa  180  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  30.19 
 
 		 433 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0702  folylpolyglutamate synthase  32.54 
 
 		 435 aa  179  7e-44  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  29.02 
 
 		 433 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  29.48 
 
 		 424 aa  177  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2573  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  33.17 
 
 		 422 aa  176  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  33.01 
 
 		 423 aa  176  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.17 
 
 		 470 aa  176  7e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  29.21 
 
 		 404 aa  175  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  30.41 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2507  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.51 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0200  FolC bifunctional protein  34.45 
 
 		 448 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1986  FolC bifunctional protein  34.38 
 
 		 438 aa  172  7.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0400217 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2368  folC bifunctional protein  34.02 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.183429  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2492  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.43 
 
 		 431 aa  171  1e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1697  FolC bifunctional protein  34.46 
 
 		 447 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000041019 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2985  FolC bifunctional protein  33.58 
 
 		 412 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.110544 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2553  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.42 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  30.99 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2595  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.42 
 
 		 422 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.538955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  33.01 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0094  putative folC protein  32.48 
 
 		 447 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2154  bifunctional protein: folylpolyglutamate synthase and dihydrofolate synthase  32.86 
 
 		 440 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.10427  normal  0.190806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1685  FolC bifunctional protein  33.17 
 
 		 437 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2607  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.17 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0948083  normal  0.269404 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2797  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.41 
 
 		 422 aa  170  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  29.55 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2149  FolC bifunctional protein  32.49 
 
 		 421 aa  170  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.341709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4772  FolC bifunctional protein  33.81 
 
 		 440 aa  169  6e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.16317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2716  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.17 
 
 		 422 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2076  dihydrofolate synthase  31.73 
 
 		 427 aa  169  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  27.19 
 
 		 441 aa  169  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4979  FolC bifunctional protein  34.38 
 
 		 437 aa  169  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  29.09 
 
 		 443 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  34.4 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  30.15 
 
 		 437 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  26.95 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  30.15 
 
 		 435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0052  folylpolyglutamate synthetase  33.57 
 
 		 442 aa  167  4e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  28.75 
 
 		 432 aa  167  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  30.14 
 
 		 431 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3455  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.51 
 
 		 422 aa  166  5e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  32.09 
 
 		 463 aa  166  5e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  33.6 
 
 		 468 aa  166  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2471  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.51 
 
 		 422 aa  166  5e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1988  FolC bifunctional protein  31.58 
 
 		 422 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.362806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  33.57 
 
 		 452 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0844  FolC bifunctional protein  31.23 
 
 		 437 aa  166  9e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1341  FolC bifunctional protein  32.51 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.420522  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  29.85 
 
 		 432 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1337  bifunctional folylpolyglutamate synthase/ dihydrofolate synthase  32.51 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.887259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>