37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0730 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0730  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  642    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000190303  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0874  hypothetical protein  33.08 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000276029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1101  hypothetical protein  35.82 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000156982  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0141  putative dynein heavy chain  28.74 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000369337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1587  hypothetical protein  27.18 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1420  hypothetical protein  33.83 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2611  hypothetical protein  31.58 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2297  hypothetical protein  29.82 
 
 
236 aa  59.3  0.00000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0466  hypothetical protein  30.47 
 
 
251 aa  56.2  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0098  hypothetical protein  29.37 
 
 
239 aa  55.1  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.51381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2924  hypothetical protein  29.66 
 
 
272 aa  54.3  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.512555  hitchhiker  0.0000388808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1146  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  52.8  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0186  hypothetical protein  26.67 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3527  hypothetical protein  27.42 
 
 
247 aa  51.6  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5055  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.252391  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2032  hypothetical protein  28.9 
 
 
233 aa  50.4  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00838338  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5048  hypothetical protein  25.83 
 
 
247 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4738  hypothetical protein  26.67 
 
 
247 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5060  hypothetical protein  26.02 
 
 
247 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1249  hypothetical protein  25.74 
 
 
315 aa  49.3  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4786  hypothetical protein  26.02 
 
 
247 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000447454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5149  hypothetical protein  26.02 
 
 
247 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.847159  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4626  hypothetical protein  26.02 
 
 
247 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000207818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4648  hypothetical protein  26.02 
 
 
247 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000237488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5027  hypothetical protein  26.02 
 
 
247 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1308  hypothetical protein  26.09 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1942  copper amine oxidase domain protein  26.06 
 
 
480 aa  47.8  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0885  hypothetical protein  26.55 
 
 
361 aa  47.8  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3509  hypothetical protein  26.19 
 
 
380 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00457294 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2831  hypothetical protein  28.8 
 
 
452 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3184  hypothetical protein  25.42 
 
 
380 aa  47.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1762  hypothetical protein  24.72 
 
 
253 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3314  hypothetical protein  24.8 
 
 
380 aa  46.2  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0511788  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0761  hypothetical protein  29.77 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1278  hypothetical protein  28.85 
 
 
227 aa  43.9  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00544621  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1184  hypothetical protein  23.87 
 
 
262 aa  43.5  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00691136  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0717  hypothetical protein  30.58 
 
 
418 aa  42.4  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>