More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0097 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0097  ATP phosphoribosyltransferase  100 
 
 
299 aa  603  1e-172  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.83123e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1950  ATP phosphoribosyltransferase  75.17 
 
 
299 aa  470  1e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0337651  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1584  ATP phosphoribosyltransferase  76.51 
 
 
299 aa  449  1e-125  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1769  ATP phosphoribosyltransferase  76.17 
 
 
299 aa  447  1e-125  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1745  ATP phosphoribosyltransferase  64.43 
 
 
299 aa  412  1e-114  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0448433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2329  ATP phosphoribosyltransferase  65.1 
 
 
299 aa  412  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.132013  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2177  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1041  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  409  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.175546 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2250  ATP phosphoribosyltransferase  64.43 
 
 
299 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.203348  normal  0.235977 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2409  ATP phosphoribosyltransferase  64.43 
 
 
299 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.390234  hitchhiker  0.00326184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01907  hypothetical protein  65.1 
 
 
299 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1800  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
332 aa  407  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2158  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2952  ATP phosphoribosyltransferase  64.43 
 
 
299 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837237  hitchhiker  4.91094e-09 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2196  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01921  ATP phosphoribosyltransferase  65.1 
 
 
299 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1638  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0528843  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1213  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  409  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2310  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.326515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1623  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.412547 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2297  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0642923 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2299  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0632699 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2012  ATP phosphoribosyltransferase  64.43 
 
 
299 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2536  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2227  ATP phosphoribosyltransferase  64.43 
 
 
299 aa  407  1e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.446391  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2525  ATP phosphoribosyltransferase  62.75 
 
 
299 aa  404  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2428  ATP phosphoribosyltransferase  62.75 
 
 
299 aa  404  1e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3169  ATP phosphoribosyltransferase  62.75 
 
 
299 aa  404  1e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1933  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.329201 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2425  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2418  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  405  1e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2631  ATP phosphoribosyltransferase  63.76 
 
 
299 aa  406  1e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.270449  normal  0.97074 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1854  ATP phosphoribosyltransferase  64.09 
 
 
299 aa  407  1e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2074  ATP phosphoribosyltransferase  64.43 
 
 
324 aa  406  1e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2456  ATP phosphoribosyltransferase  65.1 
 
 
299 aa  403  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2197  ATP phosphoribosyltransferase  64.09 
 
 
299 aa  402  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0109054 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2178  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
331 aa  403  1e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1616  ATP phosphoribosyltransferase  63.76 
 
 
299 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.120755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1618  ATP phosphoribosyltransferase  64.77 
 
 
299 aa  400  1e-110  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1720  ATP phosphoribosyltransferase  64.43 
 
 
299 aa  399  1e-110  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2092  ATP phosphoribosyltransferase  65.77 
 
 
299 aa  400  1e-110  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.388079  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0405  ATP phosphoribosyltransferase  62.08 
 
 
299 aa  391  1e-108  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2541  ATP phosphoribosyltransferase  63.76 
 
 
299 aa  390  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0702  ATP phosphoribosyltransferase  62.84 
 
 
304 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003849  ATP phosphoribosyltransferase  63.51 
 
 
298 aa  387  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01830  ATP phosphoribosyltransferase  63.51 
 
 
298 aa  387  1e-106  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1941  ATP phosphoribosyltransferase  62.71 
 
 
297 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1657  ATP phosphoribosyltransferase  62.12 
 
 
298 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.22344  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2880  ATP phosphoribosyltransferase  61.2 
 
 
299 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00937418  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1133  ATP phosphoribosyltransferase  62.12 
 
 
298 aa  372  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01118  ATP phosphoribosyltransferase  58.67 
 
 
300 aa  364  1e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3889  ATP phosphoribosyltransferase  57.14 
 
 
300 aa  344  1e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255527  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0714  ATP phosphoribosyltransferase  51.02 
 
 
295 aa  283  2e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50468e-08 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1202  ATP phosphoribosyltransferase  51.36 
 
 
293 aa  281  8e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1208  ATP phosphoribosyltransferase  50.68 
 
 
293 aa  279  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1817  ATP phosphoribosyltransferase  48.46 
 
 
284 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1783  ATP phosphoribosyltransferase  46.78 
 
 
286 aa  265  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.325419  normal  0.906208 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1862  ATP phosphoribosyltransferase  45.76 
 
 
286 aa  261  1e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1142  ATP phosphoribosyltransferase  46.23 
 
 
287 aa  259  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.831678  normal  0.018693 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1615  ATP phosphoribosyltransferase (homohexameric)  43.92 
 
 
294 aa  254  1e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.474325  normal  0.765723 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09660  ATP phosphoribosyltransferase  42.05 
 
 
305 aa  248  8e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0240828  normal  0.0336917 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09016  ATP phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 
285 aa  240  2e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3191  ATP phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
283 aa  239  6e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.468969  normal  0.668465 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00832  ATP phosphoribosyltransferase  41.5 
 
 
304 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000340807  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0658  ATP phosphoribosyltransferase  40.4 
 
 
292 aa  222  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1420  ATP phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 
304 aa  219  4e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1756  ATP phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 
303 aa  217  2e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.20301  normal  0.0310236 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2878  ATP phosphoribosyltransferase  40.82 
 
 
285 aa  217  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1353  ATP phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
304 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0242  ATP phosphoribosyltransferase  36.64 
 
 
306 aa  185  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.753965  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0754  ATP phosphoribosyltransferase  35.62 
 
 
288 aa  179  4e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1708  ATP phosphoribosyltransferase  34.93 
 
 
288 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0194  ATP phosphoribosyltransferase  35.27 
 
 
288 aa  175  1e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.711909 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0491  ATP phosphoribosyltransferase  36.27 
 
 
286 aa  168  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1331  ATP phosphoribosyltransferase  32.42 
 
 
284 aa  164  2e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  6.81553e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0752  ATP phosphoribosyltransferase  33.11 
 
 
282 aa  162  9e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0137  ATP phosphoribosyltransferase  34.13 
 
 
288 aa  159  7e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.74321  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1857  ATP phosphoribosyltransferase  31.63 
 
 
284 aa  158  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.294711  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1312  ATP phosphoribosyltransferase  31.21 
 
 
289 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.289688 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0135  ATP phosphoribosyltransferase  31.91 
 
 
294 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1520  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
282 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.401235  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1065  ATP phosphoribosyltransferase  31.06 
 
 
285 aa  150  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0523334 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1943  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
285 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.919043 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0837  ATP phosphoribosyltransferase  30.27 
 
 
300 aa  143  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.882205  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03748  conserved hypothetical protein:ATP-phosphoribosyltransferase (Eurofung)  31.46 
 
 
307 aa  142  6e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1657  ATP phosphoribosyltransferase  30.85 
 
 
286 aa  141  1e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.218211  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1745  ATP phosphoribosyltransferase  31.08 
 
 
293 aa  140  2e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.695533  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0922  ATP phosphoribosyltransferase  30.61 
 
 
300 aa  140  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3108  ATP phosphoribosyltransferase  32.88 
 
 
288 aa  139  5e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1400  ATP phosphoribosyltransferase  30.48 
 
 
283 aa  139  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.135087  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2637  ATP phosphoribosyltransferase  29.43 
 
 
296 aa  136  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.269826  normal  0.944826 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0134  ATP phosphoribosyltransferase  31.4 
 
 
282 aa  136  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_10025  predicted protein  33.22 
 
 
295 aa  135  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0151  ATP phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 
282 aa  134  2e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.182471  normal  0.40179 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67165  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase) (ATP-PRT)  30.33 
 
 
304 aa  128  1e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0160  ATP phosphoribosyltransferase  30.03 
 
 
294 aa  127  2e-28  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1675  ATP phosphoribosyltransferase  32.19 
 
 
284 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  5.40351e-17 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1213  ATP phosphoribosyltransferase  28.33 
 
 
282 aa  122  7e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1680  ATP phosphoribosyltransferase  32.31 
 
 
286 aa  119  6e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2601  ATP phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
281 aa  118  1e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.155316  normal  0.724909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>