More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0092 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0092  30S ribosomal protein S13  100 
 
 
121 aa  242  1e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0157087  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1764  30S ribosomal protein S13  98.35 
 
 
121 aa  237  3e-62  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1945  30S ribosomal protein S13  98.35 
 
 
121 aa  237  3e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.260742  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1579  30S ribosomal protein S13  97.52 
 
 
121 aa  236  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  90.08 
 
 
122 aa  221  3e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1754  30S ribosomal protein S13  88.43 
 
 
122 aa  216  6e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0137496  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1011  30S ribosomal protein S13  88.43 
 
 
122 aa  216  1e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.452762  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0208  30S ribosomal protein S13  87.6 
 
 
127 aa  214  5e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.681731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1945  30S ribosomal protein S13  83.47 
 
 
122 aa  208  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  84.03 
 
 
120 aa  205  1e-52  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  68.33 
 
 
122 aa  171  4e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  68.33 
 
 
125 aa  171  4e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  3.4359e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  63.33 
 
 
123 aa  168  3e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  64.17 
 
 
126 aa  163  6e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  65.83 
 
 
122 aa  163  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
124 aa  162  1e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  3.43576e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  64.17 
 
 
123 aa  162  2e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  65.83 
 
 
122 aa  160  4e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  64.17 
 
 
121 aa  160  5e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  64.17 
 
 
121 aa  160  5e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  65.83 
 
 
122 aa  160  5e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  4.84055e-06 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  61.67 
 
 
121 aa  160  5e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 
123 aa  160  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  61.67 
 
 
124 aa  159  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 
122 aa  157  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.37976e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
123 aa  157  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
122 aa  157  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.95969e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
123 aa  157  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  61.98 
 
 
122 aa  157  6e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  64.17 
 
 
122 aa  156  7e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.43035e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
122 aa  155  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0730  30S ribosomal protein S13  63.79 
 
 
127 aa  155  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.75069e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  61.67 
 
 
126 aa  155  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  65.22 
 
 
127 aa  155  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
123 aa  155  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.41788e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
122 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  63.33 
 
 
125 aa  154  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  60.83 
 
 
122 aa  154  3e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  61.16 
 
 
122 aa  154  5e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  61.67 
 
 
122 aa  154  5e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  3.34253e-09  hitchhiker  4.78637e-09 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  62.5 
 
 
122 aa  153  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  65 
 
 
122 aa  153  8e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
122 aa  153  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  8.85174e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  61.34 
 
 
124 aa  152  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.24945e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  60 
 
 
125 aa  152  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  63.33 
 
 
122 aa  152  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 
122 aa  151  3e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
122 aa  150  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0266  30S ribosomal protein S13  64.35 
 
 
116 aa  150  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3139  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
125 aa  150  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111016  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1865  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
122 aa  150  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  61.67 
 
 
122 aa  150  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
124 aa  150  6e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
122 aa  149  9e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
122 aa  149  9e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl148  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
121 aa  149  1e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  1.42424e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0430  30S ribosomal protein S13  60.33 
 
 
123 aa  148  3e-35  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
122 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  59.17 
 
 
123 aa  147  3e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  60.53 
 
 
127 aa  147  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  1.15792e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 
122 aa  147  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  55 
 
 
123 aa  147  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.27618e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0591  30S ribosomal protein S13  59.5 
 
 
123 aa  147  5e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.000407723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
126 aa  147  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1656  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 
122 aa  147  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.819734  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  56.67 
 
 
125 aa  146  8e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  146  9e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  9.57458e-06  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 
123 aa  146  1e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
123 aa  145  1e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1354  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  146  1e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0146999  normal  0.399807 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
121 aa  145  1e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
121 aa  145  1e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1452  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  145  1e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0642708  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1008  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 
122 aa  146  1e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.836667  normal  0.0493097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 
126 aa  146  1e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3878  30S ribosomal protein S13  55.83 
 
 
124 aa  146  1e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1883  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
121 aa  145  2e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  5.66138e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1211  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  145  2e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.304522  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1174  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  145  2e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.119406  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0082  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
121 aa  145  2e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  7.02281e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
125 aa  145  2e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0720  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  145  2e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.401773  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  58.33 
 
 
122 aa  145  2e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  60.83 
 
 
121 aa  145  2e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 
128 aa  145  2e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2529  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
122 aa  145  2e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.186837  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0130  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
121 aa  144  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  5.56039e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 
128 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  145  3e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  56.67 
 
 
122 aa  144  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  2.16682e-06 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0219  30S ribosomal protein S13  57.85 
 
 
123 aa  144  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0440156  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  59.13 
 
 
128 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  56.67 
 
 
122 aa  144  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  1.82214e-11  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0567  30S ribosomal protein S13  60 
 
 
122 aa  144  4e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.625639 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1978  30S ribosomal protein S13  57.5 
 
 
122 aa  144  4e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.234  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
121 aa  144  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  1.11603e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
121 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  5.25555e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
121 aa  144  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  3.80498e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
121 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  59.17 
 
 
121 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  2.70668e-11  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>