More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03970 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03970  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 		 321 aa  659    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.579813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  77.19 
 
 		 321 aa  525  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21930  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.48 
 
 		 319 aa  524  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246187 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.67 
 
 		 331 aa  345  4e-94  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.08 
 
 		 325 aa  328  9e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 		 323 aa  325  5e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338199  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.27 
 
 		 319 aa  323  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 		 319 aa  320  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0895  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.47 
 
 		 331 aa  318  7e-86  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0441838  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.28 
 
 		 322 aa  316  3e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.72 
 
 		 316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 		 313 aa  312  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1439  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.2 
 
 		 325 aa  311  6.999999999999999e-84  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.53 
 
 		 315 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  48.41 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.21 
 
 		 315 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3989  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.47 
 
 		 322 aa  306  3e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.88 
 
 		 330 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.28 
 
 		 315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0522  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.02 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00402651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0535  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.02 
 
 		 321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0143488  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.98 
 
 		 317 aa  302  4.0000000000000003e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.24 
 
 		 318 aa  302  5.000000000000001e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0911  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.89 
 
 		 326 aa  302  6.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1946  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 		 325 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0169  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.24 
 
 		 326 aa  301  8.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.45 
 
 		 314 aa  301  9e-81  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1052  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.48 
 
 		 325 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.89 
 
 		 314 aa  299  4e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.91 
 
 		 314 aa  299  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0138  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.09 
 
 		 321 aa  299  5e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.056526  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0415  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.15 
 
 		 322 aa  298  9e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00469729  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.28 
 
 		 338 aa  298  9e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.94 
 
 		 314 aa  297  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8607  Ribose-phosphate diphosphokinase  45.57 
 
 		 325 aa  297  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.09 
 
 		 312 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03490  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.68 
 
 		 334 aa  296  5e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.489296  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3154  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.89 
 
 		 326 aa  295  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.911142  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.42 
 
 		 316 aa  295  7e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0998  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.03 
 
 		 325 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0909  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.63 
 
 		 347 aa  294  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.44 
 
 		 319 aa  293  4e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.13 
 
 		 312 aa  292  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.82 
 
 		 312 aa  292  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3195  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.25 
 
 		 325 aa  291  7e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.74 
 
 		 323 aa  291  7e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.92 
 
 		 330 aa  291  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.37 
 
 		 316 aa  291  9e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.37 
 
 		 340 aa  291  9e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0702588  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1075  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.32 
 
 		 327 aa  291  1e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0126613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0769  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.65 
 
 		 324 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0793268  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.82 
 
 		 331 aa  291  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.96 
 
 		 338 aa  291  1e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.67 
 
 		 331 aa  290  2e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0221  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.96 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000342806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.45 
 
 		 330 aa  290  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.05 
 
 		 316 aa  290  3e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32370  ribose-phosphate pyrophosphokinase  44.48 
 
 		 326 aa  289  5.0000000000000004e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.531624  normal  0.459993 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1541  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.96 
 
 		 327 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0640  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.4 
 
 		 318 aa  289  6e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00660234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.13 
 
 		 312 aa  288  6e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1270  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.87 
 
 		 309 aa  288  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0133436  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.13 
 
 		 331 aa  288  7e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.59 
 
 		 324 aa  288  7e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30170  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.43 
 
 		 327 aa  288  8e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.35865  normal  0.215042 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11091  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.43 
 
 		 331 aa  288  8e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.147095  normal  0.740679 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  46.52 
 
 		 327 aa  288  9e-77  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0820  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.78 
 
 		 315 aa  288  9e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0240183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.91 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  49.68 
 
 		 312 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.47 
 
 		 314 aa  288  1e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0899  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.59 
 
 		 324 aa  288  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.27 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0307  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.39 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.918252  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05480  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.96 
 
 		 326 aa  287  2e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.73 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3962  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.34 
 
 		 324 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2416  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 		 316 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0715915  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0783  ribose-phosphate pyrophosphokinase  45.83 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09761  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.82 
 
 		 337 aa  286  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13390  ribose-phosphate pyrophosphokinase  46.25 
 
 		 326 aa  285  5.999999999999999e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.271989  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0824  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.76 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 321 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1341  ribose-phosphate pyrophosphokinase  48.25 
 
 		 323 aa  285  7e-76  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0161  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.6 
 
 		 316 aa  285  7e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>