45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_00200 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_00200  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  100 
 
 
210 aa  426  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.322798 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20940  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  59.42 
 
 
209 aa  220  9.999999999999999e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24900  methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase  53.37 
 
 
207 aa  199  3.9999999999999996e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.910504  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0622  Formiminotransferase-cyclodeaminase  42.86 
 
 
217 aa  169  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.402773  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0556  Formiminotransferase-cyclodeaminase  38.57 
 
 
212 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0698  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35.64 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2862  Formiminotransferase-cyclodeaminase  39.7 
 
 
203 aa  119  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0694  glutamate formiminotransferase  31.84 
 
 
518 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1135  glutamate formiminotransferase  28.99 
 
 
555 aa  104  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.000000259237  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0059  Formiminotransferase-cyclodeaminase  31.46 
 
 
212 aa  103  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.279753 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4470  formiminotransferase-cyclodeaminase  32.69 
 
 
210 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0428  Formiminotransferase-cyclodeaminase  28.65 
 
 
212 aa  100  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0400  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.43 
 
 
212 aa  99.8  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3258  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  35.86 
 
 
210 aa  97.1  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1415  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.46 
 
 
207 aa  95.5  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000124599  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2588  Formiminotransferase-cyclodeaminase  31.46 
 
 
210 aa  95.1  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169929  normal  0.818165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3495  Formiminotransferase-cyclodeaminase  29.63 
 
 
211 aa  94.7  8e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501957  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0325  hypothetical protein  30.48 
 
 
209 aa  94  1e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0913  Formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  33.15 
 
 
210 aa  91.3  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1277  Methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  33.15 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.490146  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7115  Formiminotransferase-cyclodeaminase  35.64 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0712261  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6555  formiminotransferase-cyclodeaminase  35.29 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.911075  normal  0.092837 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3667  formiminotransferase-cyclodeaminase  35.42 
 
 
213 aa  84.7  8e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.245003  normal  0.363416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1798  formiminotransferase-cyclodeaminase  33.69 
 
 
208 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2134  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.69 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384127 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1750  Formiminotransferase-cyclodeaminase  32.47 
 
 
220 aa  80.9  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0046  formiminotransferase-cyclodeaminase family protein  27.36 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1223  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.55 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0507  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  32.84 
 
 
207 aa  77  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1232  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.55 
 
 
202 aa  77  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1031  formiminotransferase-cyclodeaminase  31.22 
 
 
205 aa  77.4  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2569  Formiminotransferase-cyclodeaminase  21.15 
 
 
214 aa  73.6  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.804343  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0902  formiminotransferase-cyclodeaminase  26.24 
 
 
208 aa  68.9  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000136254  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4575  formiminotransferase-cyclodeaminase  28.65 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5039  Formiminotransferase-cyclodeaminase  31.98 
 
 
207 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.402741  normal  0.343304 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1074  formiminotransferase-cyclodeaminase  24.88 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00274886  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1023  formiminotransferase-cyclodeaminase  28.77 
 
 
218 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.866401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0263  glutamate formiminotransferase  27.4 
 
 
495 aa  55.5  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0569087  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0122  formiminotransferase-cyclodeaminase  28.57 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0347  formimidoyltetrahydrofolate cyclodeaminase  30.64 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2878  Formiminotransferase-cyclodeaminase  33.96 
 
 
206 aa  48.9  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210115  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1837  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  22.37 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0022592  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0398  Methenyl tetrahydrofolate cyclohydrolase-like protein  29.85 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0321  Formiminotransferase-cyclodeaminase  24.71 
 
 
179 aa  42.7  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2123  methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase  22.37 
 
 
211 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>