242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1793 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1793  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1317  hypothetical protein  63.61 
 
 
294 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.269981  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1721  hypothetical protein  50 
 
 
294 aa  293  3e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2003  hypothetical protein  49.66 
 
 
294 aa  291  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1698  hypothetical protein  44.37 
 
 
292 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.466508  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2320  hypothetical protein  43.34 
 
 
292 aa  256  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000274769  hitchhiker  0.00243432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2881  hypothetical protein  41.64 
 
 
292 aa  255  8e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000426445  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1239  hypothetical protein  43 
 
 
292 aa  241  7e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.369152  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1599  hypothetical protein  43 
 
 
292 aa  239  5e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000017463  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2328  hypothetical protein  41.64 
 
 
292 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0372766  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1284  hypothetical protein  39.25 
 
 
292 aa  235  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00734721  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3163  hypothetical protein  41.3 
 
 
292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0449219  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3972  hypothetical protein  41.64 
 
 
291 aa  233  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00569731  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1049  hypothetical protein  42.09 
 
 
292 aa  232  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120663 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1271  hypothetical protein  41.3 
 
 
291 aa  232  6e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00975001  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2402  hypothetical protein  42.03 
 
 
293 aa  231  9e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0682346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3214  hypothetical protein  42.09 
 
 
292 aa  231  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000193402  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3632  hypothetical protein  41.3 
 
 
291 aa  230  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2287  hypothetical protein  42.66 
 
 
291 aa  231  2e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3921  hypothetical protein  41.3 
 
 
291 aa  229  3e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.831608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0890  hypothetical protein  41.3 
 
 
292 aa  230  3e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000147276  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3916  hypothetical protein  41.3 
 
 
291 aa  229  4e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3724  hypothetical protein  41.3 
 
 
291 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3614  hypothetical protein  41.3 
 
 
291 aa  229  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4011  hypothetical protein  41.3 
 
 
291 aa  229  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3887  hypothetical protein  41.3 
 
 
291 aa  229  4e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000222822 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1763  hypothetical protein  43.2 
 
 
290 aa  228  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3896  hypothetical protein  40.34 
 
 
289 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000579804  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2239  hypothetical protein  41.98 
 
 
292 aa  225  8e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3696  hypothetical protein  40.27 
 
 
291 aa  223  4e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2525  hypothetical protein  39.25 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1033  domain of unknown function DUF1732  39.12 
 
 
293 aa  217  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2607  hypothetical protein  37.2 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.034124  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1327  protein of unknown function DUF1732  38.28 
 
 
291 aa  209  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0133754  normal  0.451646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2788  hypothetical protein  37.2 
 
 
291 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2693  hypothetical protein  37.2 
 
 
291 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1316  domain of unknown function DUF1732  38.57 
 
 
292 aa  199  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3632  hypothetical protein  37.88 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.101055 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1056  hypothetical protein  39.59 
 
 
291 aa  199  5e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000165495  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2574  hypothetical protein  38.31 
 
 
291 aa  192  5e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0448816 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1946  hypothetical protein  37.2 
 
 
291 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0011  YicC domain protein  35.84 
 
 
292 aa  186  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.272506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1912  hypothetical protein  34.69 
 
 
294 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0397702  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0838  YicC domain protein  36.52 
 
 
293 aa  176  5e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.422723  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0956  hypothetical protein  33.67 
 
 
288 aa  175  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.253768  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2959  hypothetical protein  35.49 
 
 
288 aa  175  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2475  domain of unknown function DUF1732  38.85 
 
 
287 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2690  hypothetical protein  34.59 
 
 
290 aa  169  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.886781  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2445  hypothetical protein  35.03 
 
 
288 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.465243 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1488  domain of unknown function DUF1732  33.79 
 
 
291 aa  163  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.283341 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5843  domain of unknown function DUF1732  33.23 
 
 
326 aa  161  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3780  hypothetical protein  32.44 
 
 
296 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0046  hypothetical protein  33.11 
 
 
288 aa  159  6e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0716  domain of unknown function DUF1732  32.65 
 
 
287 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.637431  hitchhiker  0.00000131074 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0562  yicC family protein  32.65 
 
 
287 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4021  hypothetical protein  32.66 
 
 
288 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3026  hypothetical protein  32.43 
 
 
289 aa  156  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0319  hypothetical protein  33.45 
 
 
309 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3684  hypothetical protein  33.45 
 
 
288 aa  155  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0517661 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0318  hypothetical protein  33.79 
 
 
287 aa  155  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0305  hypothetical protein  31.86 
 
 
295 aa  154  2e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000735483  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0741  hypothetical protein  34.47 
 
 
286 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3996  hypothetical protein  33.79 
 
 
287 aa  153  4e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0417  hypothetical protein  30.3 
 
 
295 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0474  hypothetical protein  32.09 
 
 
288 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0380  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0394  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000359441 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0367  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0369  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0455  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  152  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0975  hypothetical protein  33.22 
 
 
293 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.538355  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2051  YicC domain protein  34.01 
 
 
293 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.974794  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3837  hypothetical protein  33.11 
 
 
287 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0322  domain of unknown function DUF1732  31.54 
 
 
295 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.563369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4387  hypothetical protein  33.11 
 
 
287 aa  150  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.113802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4116  hypothetical protein  32.42 
 
 
287 aa  150  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.124592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0055  hypothetical protein  33.11 
 
 
287 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.926553  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0048  hypothetical protein  33.11 
 
 
287 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3605  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4161  hypothetical protein  33.11 
 
 
287 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.226862  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0549  hypothetical protein  31.88 
 
 
289 aa  149  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.829174  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04050  hypothetical protein  31.74 
 
 
287 aa  149  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3778  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  149  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4405  hypothetical protein  32.76 
 
 
287 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4848  hypothetical protein  33.11 
 
 
287 aa  149  7e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0744075  hitchhiker  0.0000405788 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3489  hypothetical protein  31.74 
 
 
287 aa  148  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1457  hypothetical protein  32.54 
 
 
295 aa  148  9e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500736  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1993  hypothetical protein  33.11 
 
 
288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1774  hypothetical protein  31.86 
 
 
295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.593354  normal  0.167904 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3269  hypothetical protein  31.86 
 
 
286 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0757  hypothetical protein  31.76 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2900  hypothetical protein  32.11 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0844  hypothetical protein  31.42 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1291  hypothetical protein  33.45 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40526  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1988  hypothetical protein  32.77 
 
 
288 aa  147  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0095  hypothetical protein  32.42 
 
 
287 aa  147  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.403752  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5295  hypothetical protein  32.42 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.10654  normal  0.478685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0131  hypothetical protein  32.08 
 
 
287 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1684  hypothetical protein  35.14 
 
 
295 aa  145  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0351  hypothetical protein  33.11 
 
 
287 aa  146  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>