72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0337 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0337  DNA integrity scanning protein DisA  100 
 
 
361 aa  726    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.828831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1785  DNA integrity scanning protein DisA  59.78 
 
 
360 aa  449  1e-125  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2738  DNA integrity scanning protein DisA  54.49 
 
 
359 aa  390  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2429  DNA integrity scanning protein DisA  53.69 
 
 
354 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0257  DNA integrity scanning protein DisA  53.52 
 
 
359 aa  385  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169312  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0183  DNA integrity scanning protein DisA  54.29 
 
 
361 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.876068  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  52.57 
 
 
352 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0159  DNA integrity scanning protein DisA  51.52 
 
 
363 aa  378  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000331383  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00890  DNA integrity scanning protein DisA  52.68 
 
 
359 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000509025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0104  DNA integrity scanning protein DisA  51.43 
 
 
357 aa  364  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0360377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5222  DNA integrity scanning protein DisA  51.14 
 
 
357 aa  363  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0527052  unclonable  8.74316e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0078  DNA integrity scanning protein DisA  51.14 
 
 
357 aa  364  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0078  DNA integrity scanning protein DisA  51.71 
 
 
357 aa  363  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0183  DNA integrity scanning protein DisA  49.28 
 
 
358 aa  362  6e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00396468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0083  DNA integrity scanning protein DisA  51.14 
 
 
357 aa  361  8e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0093  DNA integrity scanning protein DisA  51.14 
 
 
357 aa  361  8e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0082  DNA integrity scanning protein DisA  51.14 
 
 
357 aa  361  8e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0079  DNA integrity scanning protein DisA  51.14 
 
 
357 aa  361  8e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0080  DNA integrity scanning protein DisA  51.14 
 
 
357 aa  361  8e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0083  DNA integrity scanning protein DisA  51.14 
 
 
357 aa  361  8e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0113  DNA integrity scanning protein DisA  50.86 
 
 
357 aa  360  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2365  DNA integrity scanning protein DisA  48.02 
 
 
356 aa  347  1e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4467  protein of unknown function DUF147  47.67 
 
 
361 aa  331  9e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0358  DNA integrity scanning protein DisA  45.3 
 
 
359 aa  326  5e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0602  DNA integrity scanning protein DisA  45.22 
 
 
359 aa  321  9.999999999999999e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06870  predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)  45.66 
 
 
361 aa  321  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4259  DNA integrity scanning protein DisA  44.73 
 
 
359 aa  317  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3280  DNA integrity scanning protein DisA  45.22 
 
 
359 aa  316  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360002  hitchhiker  0.00479784 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0469  DNA integrity scanning protein DisA  46.8 
 
 
360 aa  314  9.999999999999999e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0469661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0644  DNA integrity scanning, DisA, linker region  45.56 
 
 
361 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0565  DNA integrity scanning, DisA, linker region  44.44 
 
 
358 aa  311  1e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336088  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0156  hypothetical protein  41.93 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221237  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1686  DNA integrity scanning, DisA, linker region  44.38 
 
 
372 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4270  DNA integrity scanning protein DisA  43.3 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0977721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4700  DNA integrity scanning protein DisA  43.06 
 
 
391 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1478  DNA integrity scanning protein DisA  45.51 
 
 
351 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.108423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8362  DNA integrity scanning protein DisA  43.8 
 
 
362 aa  303  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24570  DNA integrity scanning protein DisA  43.73 
 
 
361 aa  302  6.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0492  DNA integrity scanning protein DisA  43.06 
 
 
362 aa  302  6.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0442874  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0396  protein of unknown function DUF147  43.35 
 
 
361 aa  302  8.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0229  DNA integrity scanning protein DisA  44.01 
 
 
368 aa  297  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.743855 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0863  DNA integrity scanning protein DisA  43.19 
 
 
362 aa  296  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0190  DNA integrity scanning protein DisA  43.61 
 
 
358 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5129  DNA integrity scanning protein DisA  42.7 
 
 
371 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4743  DNA integrity scanning protein DisA  42.7 
 
 
371 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4829  DNA integrity scanning protein DisA  42.7 
 
 
371 aa  292  5e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0343  DNA integrity scanning protein DisA  43.3 
 
 
358 aa  291  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5343  DNA integrity scanning protein DisA  41.95 
 
 
373 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9144  DNA integrity scanning protein DisA  44.25 
 
 
361 aa  287  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428686  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13619  DNA integrity scanning protein DisA  42.24 
 
 
358 aa  286  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391574  normal  0.0991007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1441  DNA integrity scanning protein DisA  41.09 
 
 
373 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.310912 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2177  DNA integrity scanning protein DisA  43.66 
 
 
361 aa  282  7.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441332  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2457  protein of unknown function DUF147  40.7 
 
 
351 aa  280  2e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0966  protein of unknown function DUF147  42.73 
 
 
359 aa  265  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0748  DNA integrity scanning protein DisA  41.79 
 
 
352 aa  262  8e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0598  protein of unknown function DUF147  39.24 
 
 
360 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0724  DNA integrity scanning protein DisA  41.9 
 
 
357 aa  258  1e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1857  DNA integrity scanning protein DisA  42.77 
 
 
362 aa  256  6e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.340997  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1902  DNA integrity scanning protein DisA  40.58 
 
 
356 aa  252  9.000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.659686  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0775  protein of unknown function DUF147  38.64 
 
 
349 aa  235  9e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0087  DNA integrity scanning protein DisA  38.14 
 
 
354 aa  231  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1185  DNA integrity scanning protein DisA  34.9 
 
 
359 aa  210  3e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0217461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0365  DNA integrity scanning protein DisA  33.33 
 
 
369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.864277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4183  Tetratricopeptide TPR_4  31.58 
 
 
549 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  26.67 
 
 
456 aa  45.1  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  28.21 
 
 
212 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1656  hypothetical protein  27.41 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  30.66 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  26.28 
 
 
212 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  25 
 
 
288 aa  43.1  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0131  Hef nuclease  34.33 
 
 
808 aa  42.7  0.009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00335055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  22.84 
 
 
483 aa  42.7  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>