76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1902 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1902  DNA integrity scanning protein DisA  100 
 
 
356 aa  702    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.659686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00890  DNA integrity scanning protein DisA  41.62 
 
 
359 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000509025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4467  protein of unknown function DUF147  45.35 
 
 
361 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8362  DNA integrity scanning protein DisA  43.75 
 
 
362 aa  259  4e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4270  DNA integrity scanning protein DisA  46.61 
 
 
391 aa  258  1e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0977721 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1785  DNA integrity scanning protein DisA  41.95 
 
 
360 aa  258  1e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000327916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4700  DNA integrity scanning protein DisA  46.61 
 
 
391 aa  258  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0159  DNA integrity scanning protein DisA  40.17 
 
 
363 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000331383  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4259  DNA integrity scanning protein DisA  43.86 
 
 
359 aa  256  6e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5129  DNA integrity scanning protein DisA  43.06 
 
 
371 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4743  DNA integrity scanning protein DisA  43.06 
 
 
371 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4829  DNA integrity scanning protein DisA  43.06 
 
 
371 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0183  DNA integrity scanning protein DisA  40.8 
 
 
361 aa  252  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.876068  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0602  DNA integrity scanning protein DisA  45.06 
 
 
359 aa  252  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0337  DNA integrity scanning protein DisA  40.58 
 
 
361 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.828831  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0358  DNA integrity scanning protein DisA  43.27 
 
 
359 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0644  DNA integrity scanning, DisA, linker region  44.51 
 
 
361 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0396  protein of unknown function DUF147  44.35 
 
 
361 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0156  hypothetical protein  43.2 
 
 
394 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221237  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0565  DNA integrity scanning, DisA, linker region  42.86 
 
 
358 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336088  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06870  predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)  43.31 
 
 
361 aa  246  3e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5343  DNA integrity scanning protein DisA  41.91 
 
 
373 aa  245  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1441  DNA integrity scanning protein DisA  41.62 
 
 
373 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.310912 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  38.57 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0257  DNA integrity scanning protein DisA  40.29 
 
 
359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169312  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0343  DNA integrity scanning protein DisA  41.69 
 
 
358 aa  241  1e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0183  DNA integrity scanning protein DisA  38.29 
 
 
358 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00396468  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3280  DNA integrity scanning protein DisA  41 
 
 
359 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360002  hitchhiker  0.00479784 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0190  DNA integrity scanning protein DisA  41.57 
 
 
358 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0469  DNA integrity scanning protein DisA  43.11 
 
 
360 aa  235  7e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0469661  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2429  DNA integrity scanning protein DisA  37.25 
 
 
354 aa  235  9e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1686  DNA integrity scanning, DisA, linker region  40 
 
 
372 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9144  DNA integrity scanning protein DisA  41.59 
 
 
361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428686  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0863  DNA integrity scanning protein DisA  41.89 
 
 
362 aa  232  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13619  DNA integrity scanning protein DisA  40.75 
 
 
358 aa  229  7e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391574  normal  0.0991007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2738  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
359 aa  229  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.403042  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0229  DNA integrity scanning protein DisA  40.74 
 
 
368 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.743855 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0966  protein of unknown function DUF147  39 
 
 
359 aa  226  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0492  DNA integrity scanning protein DisA  40.12 
 
 
362 aa  226  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0442874  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1857  DNA integrity scanning protein DisA  37.57 
 
 
362 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.340997  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0598  protein of unknown function DUF147  40.75 
 
 
360 aa  223  4.9999999999999996e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24570  DNA integrity scanning protein DisA  40.86 
 
 
361 aa  220  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2365  DNA integrity scanning protein DisA  37.01 
 
 
356 aa  218  8.999999999999998e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1478  DNA integrity scanning protein DisA  36.95 
 
 
351 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.108423  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0078  DNA integrity scanning protein DisA  37.65 
 
 
357 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0083  DNA integrity scanning protein DisA  37.35 
 
 
357 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0093  DNA integrity scanning protein DisA  37.35 
 
 
357 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0104  DNA integrity scanning protein DisA  37.35 
 
 
357 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0360377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0083  DNA integrity scanning protein DisA  37.35 
 
 
357 aa  209  4e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0080  DNA integrity scanning protein DisA  37.35 
 
 
357 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0079  DNA integrity scanning protein DisA  37.35 
 
 
357 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0082  DNA integrity scanning protein DisA  37.35 
 
 
357 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0078  DNA integrity scanning protein DisA  36.36 
 
 
357 aa  209  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0113  DNA integrity scanning protein DisA  37.06 
 
 
357 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5222  DNA integrity scanning protein DisA  37.06 
 
 
357 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0527052  unclonable  8.74316e-26 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0748  DNA integrity scanning protein DisA  35.92 
 
 
352 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0724  DNA integrity scanning protein DisA  36.29 
 
 
357 aa  192  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0087  DNA integrity scanning protein DisA  32.78 
 
 
354 aa  186  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2177  DNA integrity scanning protein DisA  39.31 
 
 
361 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441332  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0775  protein of unknown function DUF147  32.54 
 
 
349 aa  181  2e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0365  DNA integrity scanning protein DisA  32.29 
 
 
369 aa  179  7e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.864277  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2457  protein of unknown function DUF147  31.38 
 
 
351 aa  176  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1185  DNA integrity scanning protein DisA  39.75 
 
 
359 aa  176  7e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0217461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4183  Tetratricopeptide TPR_4  38.35 
 
 
549 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0361  protein of unknown function DUF147  31.09 
 
 
285 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.566401  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2336  hypothetical protein  38.68 
 
 
296 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1568  hypothetical protein  33.33 
 
 
273 aa  46.2  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0110  protein of unknown function DUF147  31.43 
 
 
275 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1166  hypothetical protein  32.04 
 
 
292 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000552202  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1656  hypothetical protein  31.3 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3550  protein of unknown function DUF147  33.33 
 
 
480 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000131066  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  36.7 
 
 
483 aa  43.9  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1817  protein of unknown function DUF147  33.94 
 
 
266 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0199  conserved hypothetical protein TIGR00159  29.86 
 
 
273 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0148  hypothetical protein  31.53 
 
 
276 aa  42.7  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0552836  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1515  hypothetical protein  31.78 
 
 
249 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.189008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>