67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1857 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1857  DNA integrity scanning protein DisA  100 
 
 
362 aa  727    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.340997  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0748  DNA integrity scanning protein DisA  57.55 
 
 
352 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0724  DNA integrity scanning protein DisA  56.7 
 
 
357 aa  387  1e-106  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0087  DNA integrity scanning protein DisA  49.71 
 
 
354 aa  351  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00890  DNA integrity scanning protein DisA  42.82 
 
 
359 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000509025  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0159  DNA integrity scanning protein DisA  42 
 
 
363 aa  274  2.0000000000000002e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000331383  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0083  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
357 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0093  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
357 aa  263  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0080  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
357 aa  263  2e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0082  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
357 aa  263  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0079  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
357 aa  263  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0083  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
357 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5222  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
357 aa  263  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0527052  unclonable  8.74316e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0104  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
357 aa  263  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0360377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0113  DNA integrity scanning protein DisA  39.43 
 
 
357 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0078  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
357 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0078  DNA integrity scanning protein DisA  40.7 
 
 
357 aa  261  2e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1785  DNA integrity scanning protein DisA  40.74 
 
 
360 aa  260  3e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000327916  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0337  DNA integrity scanning protein DisA  42.77 
 
 
361 aa  256  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.828831  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0183  DNA integrity scanning protein DisA  39.09 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00396468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2738  DNA integrity scanning protein DisA  39.77 
 
 
359 aa  253  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.403042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  37.78 
 
 
352 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0183  DNA integrity scanning protein DisA  40.57 
 
 
361 aa  252  6e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.876068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1478  DNA integrity scanning protein DisA  39.6 
 
 
351 aa  252  7e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.108423  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0365  DNA integrity scanning protein DisA  40.87 
 
 
369 aa  251  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.864277  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0257  DNA integrity scanning protein DisA  39.77 
 
 
359 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169312  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2177  DNA integrity scanning protein DisA  39.71 
 
 
361 aa  243  5e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441332  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1686  DNA integrity scanning, DisA, linker region  41.16 
 
 
372 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2365  DNA integrity scanning protein DisA  37.28 
 
 
356 aa  238  9e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427921  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2429  DNA integrity scanning protein DisA  40 
 
 
354 aa  236  4e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0602  DNA integrity scanning protein DisA  39.6 
 
 
359 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4467  protein of unknown function DUF147  38.62 
 
 
361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0156  hypothetical protein  37.39 
 
 
394 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221237  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0358  DNA integrity scanning protein DisA  37.1 
 
 
359 aa  230  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0469  DNA integrity scanning protein DisA  37.75 
 
 
360 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0469661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2457  protein of unknown function DUF147  38.7 
 
 
351 aa  229  5e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4700  DNA integrity scanning protein DisA  37.64 
 
 
391 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4270  DNA integrity scanning protein DisA  37.39 
 
 
391 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0977721 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4259  DNA integrity scanning protein DisA  37.1 
 
 
359 aa  228  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1902  DNA integrity scanning protein DisA  37.57 
 
 
356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0190  DNA integrity scanning protein DisA  38.66 
 
 
358 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0863  DNA integrity scanning protein DisA  35.88 
 
 
362 aa  226  6e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8362  DNA integrity scanning protein DisA  37.04 
 
 
362 aa  225  9e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0644  DNA integrity scanning, DisA, linker region  36.93 
 
 
361 aa  225  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0343  DNA integrity scanning protein DisA  38.22 
 
 
358 aa  225  1e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06870  predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)  38.24 
 
 
361 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0565  DNA integrity scanning, DisA, linker region  38.51 
 
 
358 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336088  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0396  protein of unknown function DUF147  38.18 
 
 
361 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24570  DNA integrity scanning protein DisA  36.94 
 
 
361 aa  218  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0229  DNA integrity scanning protein DisA  36.26 
 
 
368 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.743855 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4743  DNA integrity scanning protein DisA  36.55 
 
 
371 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557904  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4829  DNA integrity scanning protein DisA  36.55 
 
 
371 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5129  DNA integrity scanning protein DisA  36.55 
 
 
371 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5343  DNA integrity scanning protein DisA  35.26 
 
 
373 aa  209  8e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9144  DNA integrity scanning protein DisA  35.88 
 
 
361 aa  209  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428686  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0492  DNA integrity scanning protein DisA  35.28 
 
 
362 aa  208  1e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0442874  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3280  DNA integrity scanning protein DisA  34.29 
 
 
359 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360002  hitchhiker  0.00479784 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1441  DNA integrity scanning protein DisA  35.16 
 
 
373 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.310912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0966  protein of unknown function DUF147  36.73 
 
 
359 aa  205  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0775  protein of unknown function DUF147  34.93 
 
 
349 aa  199  7e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13619  DNA integrity scanning protein DisA  34.86 
 
 
358 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391574  normal  0.0991007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0598  protein of unknown function DUF147  33.73 
 
 
360 aa  194  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1185  DNA integrity scanning protein DisA  33.62 
 
 
359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0217461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4183  Tetratricopeptide TPR_4  27.01 
 
 
549 aa  58.9  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1145  hypothetical protein  28.57 
 
 
279 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586351 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3986  hypothetical protein  28.57 
 
 
294 aa  43.9  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.930467  normal  0.0331193 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0895  protein of unknown function DUF147  30.56 
 
 
388 aa  42.7  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000136651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>