67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_06870  predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)  100 
 
 		 361 aa  698    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0492  DNA integrity scanning protein DisA  81.22 
 
 		 362 aa  579  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0442874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0396  protein of unknown function DUF147  83.38 
 
 		 361 aa  568  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0565  DNA integrity scanning, DisA, linker region  80.95 
 
 		 358 aa  544  1e-154  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336088  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0602  DNA integrity scanning protein DisA  74.79 
 
 		 359 aa  523  1e-147  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3280  DNA integrity scanning protein DisA  75.71 
 
 		 359 aa  499  1e-140  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360002  hitchhiker  0.00479784 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4467  protein of unknown function DUF147  73.09 
 
 		 361 aa  492  9.999999999999999e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0358  DNA integrity scanning protein DisA  69.81 
 
 		 359 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4270  DNA integrity scanning protein DisA  72 
 
 		 391 aa  479  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0977721 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4700  DNA integrity scanning protein DisA  72 
 
 		 391 aa  479  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4259  DNA integrity scanning protein DisA  69.25 
 
 		 359 aa  479  1e-134  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0469  DNA integrity scanning protein DisA  71.71 
 
 		 360 aa  471  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0469661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0644  DNA integrity scanning, DisA, linker region  67.97 
 
 		 361 aa  473  1e-132  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0229  DNA integrity scanning protein DisA  70.42 
 
 		 368 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.743855 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8362  DNA integrity scanning protein DisA  69.03 
 
 		 362 aa  467  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0156  hypothetical protein  67.42 
 
 		 394 aa  463  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9144  DNA integrity scanning protein DisA  70.14 
 
 		 361 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0343  DNA integrity scanning protein DisA  62.88 
 
 		 358 aa  435  1e-121  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0190  DNA integrity scanning protein DisA  62.05 
 
 		 358 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0863  DNA integrity scanning protein DisA  62.64 
 
 		 362 aa  425  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24570  DNA integrity scanning protein DisA  61.41 
 
 		 361 aa  417  9.999999999999999e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5343  DNA integrity scanning protein DisA  60.68 
 
 		 373 aa  397  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1441  DNA integrity scanning protein DisA  60.11 
 
 		 373 aa  392  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.310912 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5129  DNA integrity scanning protein DisA  60.4 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4829  DNA integrity scanning protein DisA  60.4 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4743  DNA integrity scanning protein DisA  60.4 
 
 		 371 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557904  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13619  DNA integrity scanning protein DisA  60.06 
 
 		 358 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391574  normal  0.0991007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0598  protein of unknown function DUF147  58.45 
 
 		 360 aa  362  8e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0966  protein of unknown function DUF147  57.63 
 
 		 359 aa  359  5e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00890  DNA integrity scanning protein DisA  49.43 
 
 		 359 aa  333  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000509025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  45.89 
 
 		 352 aa  321  9.999999999999999e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0337  DNA integrity scanning protein DisA  45.66 
 
 		 361 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.828831  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0257  DNA integrity scanning protein DisA  49.13 
 
 		 359 aa  318  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169312  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0183  DNA integrity scanning protein DisA  45.63 
 
 		 361 aa  315  9e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.876068  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0183  DNA integrity scanning protein DisA  47.73 
 
 		 358 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00396468  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2429  DNA integrity scanning protein DisA  46.18 
 
 		 354 aa  315  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1686  DNA integrity scanning, DisA, linker region  47.29 
 
 		 372 aa  314  1.9999999999999998e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0159  DNA integrity scanning protein DisA  45.25 
 
 		 363 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000331383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1785  DNA integrity scanning protein DisA  46 
 
 		 360 aa  309  5e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2738  DNA integrity scanning protein DisA  44.72 
 
 		 359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.403042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0078  DNA integrity scanning protein DisA  44.06 
 
 		 357 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0104  DNA integrity scanning protein DisA  44.06 
 
 		 357 aa  300  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0360377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0083  DNA integrity scanning protein DisA  43.77 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0083  DNA integrity scanning protein DisA  43.77 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0080  DNA integrity scanning protein DisA  43.77 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0079  DNA integrity scanning protein DisA  43.77 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0082  DNA integrity scanning protein DisA  43.77 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0093  DNA integrity scanning protein DisA  43.77 
 
 		 357 aa  299  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5222  DNA integrity scanning protein DisA  43.77 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0527052  unclonable  8.74316e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0113  DNA integrity scanning protein DisA  43.48 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0078  DNA integrity scanning protein DisA  43.48 
 
 		 357 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2365  DNA integrity scanning protein DisA  43.8 
 
 		 356 aa  281  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427921  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1478  DNA integrity scanning protein DisA  41.55 
 
 		 351 aa  276  4e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.108423  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2457  protein of unknown function DUF147  38.86 
 
 		 351 aa  256  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2177  DNA integrity scanning protein DisA  43.75 
 
 		 361 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441332  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1902  DNA integrity scanning protein DisA  43.31 
 
 		 356 aa  246  3e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.659686  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0748  DNA integrity scanning protein DisA  41.21 
 
 		 352 aa  231  2e-59  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0724  DNA integrity scanning protein DisA  40.63 
 
 		 357 aa  225  8e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1857  DNA integrity scanning protein DisA  38.24 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.340997  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0087  DNA integrity scanning protein DisA  35.53 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0775  protein of unknown function DUF147  32.85 
 
 		 349 aa  194  1e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1185  DNA integrity scanning protein DisA  35.78 
 
 		 359 aa  191  1e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0217461 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0365  DNA integrity scanning protein DisA  30.21 
 
 		 369 aa  162  9e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.864277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4183  Tetratricopeptide TPR_4  36.09 
 
 		 549 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0374  ERCC4 domain-containing protein  32.69 
 
 		 212 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000467735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3619  ERCC4 domain-containing protein  32.08 
 
 		 212 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2078  excinuclease ABC, C subunit  42.31 
 
 		 604 aa  42.7  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>