67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1185 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1185  DNA integrity scanning protein DisA  100 
 
 		 359 aa  729    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0217461 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0337  DNA integrity scanning protein DisA  34.9 
 
 		 361 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.828831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1785  DNA integrity scanning protein DisA  35.26 
 
 		 360 aa  209  4e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000327916  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4467  protein of unknown function DUF147  35.16 
 
 		 361 aa  206  4e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0469  DNA integrity scanning protein DisA  37.42 
 
 		 360 aa  203  3e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0469661  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0644  DNA integrity scanning, DisA, linker region  36.75 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00890  DNA integrity scanning protein DisA  34.22 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000509025  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0358  DNA integrity scanning protein DisA  35.06 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2738  DNA integrity scanning protein DisA  31.88 
 
 		 359 aa  196  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.403042  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  33.14 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0156  hypothetical protein  36.18 
 
 		 394 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0602  DNA integrity scanning protein DisA  35.59 
 
 		 359 aa  195  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0863  DNA integrity scanning protein DisA  36.36 
 
 		 362 aa  195  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4259  DNA integrity scanning protein DisA  34.2 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0183  DNA integrity scanning protein DisA  30.72 
 
 		 358 aa  192  8e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00396468  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0159  DNA integrity scanning protein DisA  30.55 
 
 		 363 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000331383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06870  predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)  35.78 
 
 		 361 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4829  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5129  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13619  DNA integrity scanning protein DisA  35.69 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391574  normal  0.0991007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4743  DNA integrity scanning protein DisA  35.71 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557904  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4270  DNA integrity scanning protein DisA  37.27 
 
 		 391 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0977721 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1857  DNA integrity scanning protein DisA  33.62 
 
 		 362 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.340997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1686  DNA integrity scanning, DisA, linker region  32.36 
 
 		 372 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0565  DNA integrity scanning, DisA, linker region  34.28 
 
 		 358 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336088  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4700  DNA integrity scanning protein DisA  37.27 
 
 		 391 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2457  protein of unknown function DUF147  33.04 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0190  DNA integrity scanning protein DisA  34.11 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8362  DNA integrity scanning protein DisA  33.33 
 
 		 362 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9144  DNA integrity scanning protein DisA  33.64 
 
 		 361 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0229  DNA integrity scanning protein DisA  32.47 
 
 		 368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.743855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0257  DNA integrity scanning protein DisA  32.62 
 
 		 359 aa  184  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169312  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24570  DNA integrity scanning protein DisA  34.29 
 
 		 361 aa  183  4.0000000000000006e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0492  DNA integrity scanning protein DisA  35.67 
 
 		 362 aa  182  6e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0442874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1478  DNA integrity scanning protein DisA  33.91 
 
 		 351 aa  182  1e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.108423  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0343  DNA integrity scanning protein DisA  33.82 
 
 		 358 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0087  DNA integrity scanning protein DisA  31.86 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2429  DNA integrity scanning protein DisA  31.58 
 
 		 354 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0396  protein of unknown function DUF147  34.71 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5343  DNA integrity scanning protein DisA  34.47 
 
 		 373 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1441  DNA integrity scanning protein DisA  34.16 
 
 		 373 aa  179  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.310912 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0183  DNA integrity scanning protein DisA  31.09 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.876068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3280  DNA integrity scanning protein DisA  33.63 
 
 		 359 aa  177  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360002  hitchhiker  0.00479784 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2177  DNA integrity scanning protein DisA  31.44 
 
 		 361 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441332  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1902  DNA integrity scanning protein DisA  39.75 
 
 		 356 aa  176  7e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.659686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0104  DNA integrity scanning protein DisA  28.16 
 
 		 357 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0360377  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0748  DNA integrity scanning protein DisA  34.81 
 
 		 352 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0083  DNA integrity scanning protein DisA  28.16 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0093  DNA integrity scanning protein DisA  28.16 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0083  DNA integrity scanning protein DisA  28.16 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0080  DNA integrity scanning protein DisA  28.16 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0079  DNA integrity scanning protein DisA  28.16 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0082  DNA integrity scanning protein DisA  28.16 
 
 		 357 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0078  DNA integrity scanning protein DisA  28.16 
 
 		 357 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0113  DNA integrity scanning protein DisA  27.87 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0966  protein of unknown function DUF147  34.26 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0598  protein of unknown function DUF147  35.2 
 
 		 360 aa  170  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2365  DNA integrity scanning protein DisA  30.18 
 
 		 356 aa  170  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5222  DNA integrity scanning protein DisA  27.87 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0527052  unclonable  8.74316e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0078  DNA integrity scanning protein DisA  27.87 
 
 		 357 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0724  DNA integrity scanning protein DisA  34.22 
 
 		 357 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0775  protein of unknown function DUF147  29.64 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0365  DNA integrity scanning protein DisA  29.38 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.864277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4183  Tetratricopeptide TPR_4  31.06 
 
 		 549 aa  49.7  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1579  hypothetical protein  29.7 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  29.63 
 
 		 288 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  29.79 
 
 		 456 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>