80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2429 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_2429  DNA integrity scanning protein DisA  100 
 
 
354 aa  707    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0257  DNA integrity scanning protein DisA  60.69 
 
 
359 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000169312  normal  0.123305 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00890  DNA integrity scanning protein DisA  58.29 
 
 
359 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000509025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0397  DNA integrity scanning protein DisA  58.38 
 
 
352 aa  401  1e-111  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.265601  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0183  DNA integrity scanning protein DisA  58.65 
 
 
361 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.876068  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1785  DNA integrity scanning protein DisA  56.61 
 
 
360 aa  396  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000327916  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0159  DNA integrity scanning protein DisA  55.9 
 
 
363 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000331383  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0337  DNA integrity scanning protein DisA  53.69 
 
 
361 aa  391  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.828831  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0183  DNA integrity scanning protein DisA  54.05 
 
 
358 aa  379  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00396468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2738  DNA integrity scanning protein DisA  53.3 
 
 
359 aa  378  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.403042  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0083  DNA integrity scanning protein DisA  53.64 
 
 
357 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0113  DNA integrity scanning protein DisA  53.35 
 
 
357 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.666002  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0104  DNA integrity scanning protein DisA  53.35 
 
 
357 aa  370  1e-101  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0360377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5222  DNA integrity scanning protein DisA  53.35 
 
 
357 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0527052  unclonable  8.74316e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0093  DNA integrity scanning protein DisA  53.64 
 
 
357 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0082  DNA integrity scanning protein DisA  53.64 
 
 
357 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0083  DNA integrity scanning protein DisA  53.64 
 
 
357 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0079  DNA integrity scanning protein DisA  53.64 
 
 
357 aa  370  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0080  DNA integrity scanning protein DisA  53.64 
 
 
357 aa  370  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0078  DNA integrity scanning protein DisA  53.35 
 
 
357 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0078  DNA integrity scanning protein DisA  53.64 
 
 
357 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4467  protein of unknown function DUF147  47.86 
 
 
361 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2365  DNA integrity scanning protein DisA  48.6 
 
 
356 aa  330  2e-89  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000427921  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0156  hypothetical protein  45.3 
 
 
394 aa  326  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221237  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0565  DNA integrity scanning, DisA, linker region  47.71 
 
 
358 aa  322  8e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.336088  hitchhiker  0.00662065 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1686  DNA integrity scanning, DisA, linker region  47.69 
 
 
372 aa  320  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0602  DNA integrity scanning protein DisA  47.16 
 
 
359 aa  317  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.594606  normal  0.0932297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4259  DNA integrity scanning protein DisA  45.87 
 
 
359 aa  316  3e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.321081  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06870  predicted nucleic-acid-binding protein (contains the HHH domain)  46.18 
 
 
361 aa  315  9.999999999999999e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0358  DNA integrity scanning protein DisA  45.87 
 
 
359 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.121799  normal  0.0150452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4700  DNA integrity scanning protein DisA  45.33 
 
 
391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4270  DNA integrity scanning protein DisA  45.43 
 
 
391 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0977721 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8362  DNA integrity scanning protein DisA  45.71 
 
 
362 aa  309  5e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9144  DNA integrity scanning protein DisA  46.44 
 
 
361 aa  302  7.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.428686  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0644  DNA integrity scanning, DisA, linker region  43.55 
 
 
361 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3280  DNA integrity scanning protein DisA  44.76 
 
 
359 aa  300  3e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.360002  hitchhiker  0.00479784 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24570  DNA integrity scanning protein DisA  42.62 
 
 
361 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0469  DNA integrity scanning protein DisA  43.8 
 
 
360 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0469661  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0492  DNA integrity scanning protein DisA  44.03 
 
 
362 aa  295  8e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0442874  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0396  protein of unknown function DUF147  43.7 
 
 
361 aa  295  1e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0229  DNA integrity scanning protein DisA  44.6 
 
 
368 aa  293  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.743855 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1478  DNA integrity scanning protein DisA  44.64 
 
 
351 aa  291  8e-78  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.108423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0863  DNA integrity scanning protein DisA  43.97 
 
 
362 aa  291  1e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.51042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2177  DNA integrity scanning protein DisA  44.77 
 
 
361 aa  289  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.441332  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0190  DNA integrity scanning protein DisA  43.02 
 
 
358 aa  287  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0343  DNA integrity scanning protein DisA  42.18 
 
 
358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2457  protein of unknown function DUF147  43.06 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5343  DNA integrity scanning protein DisA  42.29 
 
 
373 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357993  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4829  DNA integrity scanning protein DisA  42 
 
 
371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.832483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4743  DNA integrity scanning protein DisA  42 
 
 
371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.557904  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5129  DNA integrity scanning protein DisA  42 
 
 
371 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1441  DNA integrity scanning protein DisA  41.43 
 
 
373 aa  269  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69371  normal  0.310912 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13619  DNA integrity scanning protein DisA  42.61 
 
 
358 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.391574  normal  0.0991007 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0598  protein of unknown function DUF147  40.41 
 
 
360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198983  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0748  DNA integrity scanning protein DisA  43.31 
 
 
352 aa  252  7e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0724  DNA integrity scanning protein DisA  41.67 
 
 
357 aa  241  1e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0966  protein of unknown function DUF147  42.57 
 
 
359 aa  240  2.9999999999999997e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.105667  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1857  DNA integrity scanning protein DisA  40 
 
 
362 aa  236  4e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.340997  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1902  DNA integrity scanning protein DisA  37.25 
 
 
356 aa  235  9e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.659686  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0775  protein of unknown function DUF147  38.05 
 
 
349 aa  231  1e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0087  DNA integrity scanning protein DisA  37.57 
 
 
354 aa  219  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0365  DNA integrity scanning protein DisA  35.09 
 
 
369 aa  205  9e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.864277  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1185  DNA integrity scanning protein DisA  31.58 
 
 
359 aa  181  2e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0217461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4183  Tetratricopeptide TPR_4  31.58 
 
 
549 aa  73.6  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0110  protein of unknown function DUF147  29.41 
 
 
275 aa  52.4  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0057  protein of unknown function DUF147  25.9 
 
 
247 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1656  hypothetical protein  29.73 
 
 
297 aa  47.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0361  protein of unknown function DUF147  30.97 
 
 
285 aa  47  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.566401  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0255  protein of unknown function DUF147  28.81 
 
 
251 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000845039  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1785  hypothetical protein  26.61 
 
 
248 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.334778 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1190  protein of unknown function DUF147  28.07 
 
 
456 aa  44.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0934  hypothetical protein  30 
 
 
277 aa  45.4  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0604  protein of unknown function DUF147  32.46 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000675285  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0370  protein of unknown function DUF147  27.12 
 
 
275 aa  44.3  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2336  hypothetical protein  25.93 
 
 
296 aa  43.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3550  protein of unknown function DUF147  29.2 
 
 
480 aa  43.5  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.000131066  normal  0.0716856 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0006  protein of unknown function DUF147  27.83 
 
 
248 aa  43.5  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000163488  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1817  protein of unknown function DUF147  27.78 
 
 
266 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0310  hypothetical protein  26.95 
 
 
288 aa  42.7  0.01  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1515  hypothetical protein  26.61 
 
 
249 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.189008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>