More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3010 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  100 
 
 
133 aa  269  9e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  82.71 
 
 
132 aa  231  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  80.15 
 
 
130 aa  221  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  64.66 
 
 
132 aa  184  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  63.91 
 
 
132 aa  168  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  61.83 
 
 
134 aa  165  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  62.41 
 
 
132 aa  163  8e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  58.33 
 
 
134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3653  30S ribosomal protein S8  58.96 
 
 
133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00001719  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  57.89 
 
 
132 aa  159  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0641  ribosomal protein S8  56.39 
 
 
132 aa  157  4e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.968083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0121  30S ribosomal protein S8  58.65 
 
 
132 aa  157  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2032  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 
132 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1947  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 
132 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0125  30S ribosomal protein S8  58.65 
 
 
132 aa  156  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  59.54 
 
 
131 aa  155  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1925  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 
132 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.452799 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  56.49 
 
 
131 aa  154  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1932  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  154  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0601  ribosomal protein S8  57.14 
 
 
132 aa  154  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.468226  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0608  SSU ribosomal protein S8P  56.39 
 
 
133 aa  154  3e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.010695  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0209  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 
132 aa  154  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  154  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0576  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 
132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3692  ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  153  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0000284397  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2219  30S ribosomal protein S8  55.22 
 
 
133 aa  153  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.969535  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  51.88 
 
 
132 aa  153  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2632  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 
132 aa  153  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.17852  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0702  30S ribosomal protein S8  57.14 
 
 
132 aa  152  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  54.96 
 
 
131 aa  152  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3891  30S ribosomal protein S8  54.81 
 
 
135 aa  152  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  54.96 
 
 
131 aa  152  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  54.2 
 
 
131 aa  152  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1305  30S ribosomal protein S8  55.22 
 
 
133 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.574405  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  54.89 
 
 
131 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1029  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 
132 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00000138076  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0412  ribosomal protein S8  55.15 
 
 
136 aa  151  2e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0304  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  152  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.2871700000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1058  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 
132 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000455347  normal  0.366439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1046  30S ribosomal protein S8  56.39 
 
 
132 aa  152  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000643761  normal  0.194021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6600  ribosomal protein S8  57.14 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  54.14 
 
 
132 aa  151  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20730  SSU ribosomal protein S8P  56.39 
 
 
132 aa  150  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  55.04 
 
 
130 aa  150  5e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2645  ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2572  30S ribosomal protein S8  53.73 
 
 
133 aa  150  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.675088  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0118  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  150  5.9999999999999996e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000179838  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10732  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  150  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.697308  normal  0.840798 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0704  30S ribosomal protein S8  54.81 
 
 
133 aa  150  8e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000118286  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04120  SSU ribosomal protein S8P  55.64 
 
 
132 aa  149  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17030  SSU ribosomal protein S8P  53.38 
 
 
132 aa  149  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.000000000158451  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4493  ribosomal protein S8  54.41 
 
 
136 aa  149  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  149  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1336  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000316434  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0145  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  149  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000739316  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0436  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  148  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000494107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0124  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  149  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000599604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0124  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000492709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0120  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  149  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.00907e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0118  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0124  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000367768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3403  ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  148  2e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.337748  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5033  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  148  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.0000369377  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0136  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0155  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  149  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000000616269  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2917  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  148  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0246807  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5181  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  149  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000454317  unclonable  1.4651299999999999e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0119  30S ribosomal protein S8  55.64 
 
 
132 aa  148  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000110605  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0072  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  148  3e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00771687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3716  30S ribosomal protein S8  55.22 
 
 
133 aa  148  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1469  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
132 aa  147  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000125434  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0300  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  147  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  normal  0.100936 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1100  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0945  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  147  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.26193  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29600  SSU ribosomal protein S8P  54.14 
 
 
132 aa  147  6e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4676  30S ribosomal protein S8  53.03 
 
 
130 aa  146  8e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000540573  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2962  30S ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  146  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00876753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1137  ribosomal protein S8  53.38 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4307  ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.550875  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2999  30S ribosomal protein S8  54.48 
 
 
133 aa  146  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402588  hitchhiker  0.00660095 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4735  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000117347  normal  0.480985 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2674  30S ribosomal protein S8  52.63 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1664  30S ribosomal protein S8  54.14 
 
 
132 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0768138  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  57.58 
 
 
131 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0468  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
130 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00000537928  hitchhiker  0.00000317372 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1817  30S ribosomal protein S8  50.38 
 
 
132 aa  144  3e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.266254  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0498  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
130 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000149249  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0198  30S ribosomal protein S8  51.52 
 
 
130 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421054  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0320  SSU ribosomal protein S8P  54.89 
 
 
134 aa  144  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00355814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0501  30S ribosomal protein S8  54.89 
 
 
130 aa  144  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000611084  normal  0.097534 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  56.82 
 
 
131 aa  144  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>