39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1300 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1300  protein of unknown function DUF88  100 
 
 		 208 aa  438  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000638541  normal  0.142561 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3445  protein of unknown function DUF88  30.14 
 
 		 338 aa  86.7  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1614  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 305 aa  85.9  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4306  protein of unknown function DUF88  27.49 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.122513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4244  protein of unknown function DUF88  27.49 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1985  cold shock protein  30.85 
 
 		 310 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4302  protein of unknown function DUF88  30.06 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3333  protein of unknown function DUF88  27.18 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.258648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1805  hypothetical protein  26.53 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000048787 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1151  hypothetical protein  34.29 
 
 		 388 aa  49.3  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.111113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1143  hypothetical protein  26.94 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0096  protein of unknown function DUF88  29.11 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.263134 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2722  hypothetical protein  30.38 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353362  normal  0.105632 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4859  hypothetical protein  30.38 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0181079  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3991  protein of unknown function DUF88  29.75 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4033  protein of unknown function DUF88  29.75 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.424874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0326  hypothetical protein  29.66 
 
 		 194 aa  48.5  0.00008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000700026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0347  hypothetical protein  27.78 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000102624  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_287  hypothetical protein  27.78 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000717319  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2661  protein of unknown function DUF88  37.29 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1655  hypothetical protein  30.7 
 
 		 432 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0379  protein of unknown function DUF88  45.45 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.31368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2568  hypothetical protein  40.62 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1180  hypothetical protein  25.6 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0191  protein of unknown function DUF88  47.83 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.656329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0029  hypothetical protein  32.61 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232247  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0300  hypothetical protein  43.48 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.793071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0302  protein of unknown function DUF88  30.14 
 
 		 408 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1667  hypothetical protein  43.48 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.225518  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0443  hypothetical protein  28.4 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.220081  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2579  hypothetical protein  43.48 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00308857 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1654  protein of unknown function DUF88  26.58 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0466931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1403  hypothetical protein  43.48 
 
 		 183 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.175354 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1835  hypothetical protein  25.79 
 
 		 194 aa  42  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2568  hypothetical protein  43.48 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000000124155  unclonable  0.0000000364355 
 
 
 
NC_008541  Arth_3359  hypothetical protein  24.68 
 
 		 404 aa  41.6  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0791  hypothetical protein  36.36 
 
 		 335 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.13215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2418  hypothetical protein  21.33 
 
 		 247 aa  41.6  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253809 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1195  protein of unknown function DUF88  23.6 
 
 		 176 aa  41.6  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>