125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4506 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  100 
 
 		 202 aa  400  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  68.75 
 
 		 207 aa  242  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  51.26 
 
 		 197 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  43.46 
 
 		 201 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  51.58 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  47.89 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  44.1 
 
 		 258 aa  140  9.999999999999999e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.8 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  47.06 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  43 
 
 		 274 aa  136  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  47.46 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  44.33 
 
 		 206 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  42.11 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  41.58 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  37.86 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  47.22 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  41.08 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  41.08 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  41.08 
 
 		 203 aa  129  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  47.22 
 
 		 211 aa  128  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  41.05 
 
 		 191 aa  127  9.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  40.21 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  39.13 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.22 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.13 
 
 		 214 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  41.8 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.57 
 
 		 195 aa  125  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  40 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  40.53 
 
 		 188 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  47.67 
 
 		 186 aa  126  3e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  41.4 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  41.4 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.59 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  41.4 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  41.4 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  41.4 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.08 
 
 		 196 aa  123  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  39.67 
 
 		 203 aa  122  5e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.97 
 
 		 197 aa  121  6e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  39.46 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.46 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  39.46 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  39.46 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  39.46 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  39.46 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  39.46 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  39.46 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  41.67 
 
 		 257 aa  118  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  38.92 
 
 		 188 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.34 
 
 		 183 aa  118  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05226  Acetate permeasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2K4]  40.51 
 
 		 298 aa  117  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.719404  normal  0.707615 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  43.09 
 
 		 189 aa  117  9.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.71 
 
 		 183 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  41.94 
 
 		 200 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  38.95 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1253  GPR1/FUN34/yaaH family protein  45.41 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.284277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.54 
 
 		 187 aa  115  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.54 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.76 
 
 		 187 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.04 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.67 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.67 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.67 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  39.13 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  38.38 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.3 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  36.76 
 
 		 196 aa  111  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.97 
 
 		 197 aa  111  9e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  40.54 
 
 		 186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.92 
 
 		 209 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.04 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.84 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  36.96 
 
 		 197 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  41.85 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01839  conserved hypothetical protein  34.03 
 
 		 293 aa  108  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.009571  normal  0.645979 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.08 
 
 		 196 aa  108  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.13 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  37.1 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.04 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  41.85 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.75 
 
 		 213 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.41 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3283  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.41 
 
 		 187 aa  96.7  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0944573 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.15 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1065  putative regulatory protein  32.35 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03640  membrane protein, putative  34.83 
 
 		 283 aa  90.9  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0291661  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35799  predicted protein  31.53 
 
 		 272 aa  90.9  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0356533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  32.45 
 
 		 200 aa  89.7  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35800  predicted protein  34.01 
 
 		 264 aa  90.1  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  34.48 
 
 		 183 aa  89  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0383  GPR1/FUN34/YaaH family protein  30.43 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7849  predicted protein  33.5 
 
 		 191 aa  82.8  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.161215 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0815  GPR1/FUN34/YaaH family protein  29.95 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33707  predicted protein  31.61 
 
 		 274 aa  82  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373247  hitchhiker  0.000185367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3556  hypothetical protein  31.58 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000310297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3251  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.58 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000382822  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3245  GPR1/FUN34/YaaH family protein  31.58 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000556039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3551  hypothetical protein  31.58 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8351e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3301  GPR1/FUN34/yaaH family protein  31.58 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.83805e-22  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>