39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4174 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  218  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  69.44 
 
 		 109 aa  160  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  63.89 
 
 		 110 aa  150  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.19 
 
 		 111 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  62.04 
 
 		 110 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  62.04 
 
 		 111 aa  140  8e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.39 
 
 		 132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.11 
 
 		 112 aa  138  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  63.89 
 
 		 277 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  58.49 
 
 		 130 aa  132  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  57.8 
 
 		 112 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.15 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  61.47 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  51.82 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  51.82 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  51.82 
 
 		 114 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  49.06 
 
 		 110 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  43.64 
 
 		 117 aa  104  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  46.23 
 
 		 110 aa  103  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  47.27 
 
 		 110 aa  99  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  48.15 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  43.27 
 
 		 122 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  42.31 
 
 		 127 aa  87  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  42.86 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  40.78 
 
 		 107 aa  65.5  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  35.96 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  38.61 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31480  hypothetical protein  35.87 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  45.07 
 
 		 115 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1699  hypothetical protein  39.13 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.275263  normal  0.0722973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06690  hypothetical protein  42.03 
 
 		 120 aa  44.3  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0982  cupin 2 domain-containing protein  32.14 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.443195 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5772  hypothetical protein  31.4 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.86031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0238  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.58 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.519233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0361  hypothetical protein  34.67 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.642928  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4552  cupin region  27.27 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  28.38 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>