234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3178 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3178  ArsC family protein  100 
 
 
116 aa  237  4e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00330614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03182  hypothetical protein  48.21 
 
 
116 aa  124  6e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1733  hypothetical protein  50.44 
 
 
131 aa  122  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002798  glutathione-dependent thiol reductase  47.79 
 
 
117 aa  121  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2442  arsenate reductase  50.89 
 
 
116 aa  117  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.224984  normal  0.0755494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  47.79 
 
 
138 aa  116  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  50.44 
 
 
114 aa  116  7.999999999999999e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1863  arsenate reductase and related  51.79 
 
 
114 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1815  hypothetical protein  48.67 
 
 
116 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.832814  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  46.9 
 
 
113 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02362  hypothetical protein  46.96 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.984011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1199  arsenate reductase  46.96 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1206  hypothetical protein  47.83 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02324  hypothetical protein  46.96 
 
 
118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  45.13 
 
 
119 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  49.09 
 
 
121 aa  111  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2842  hypothetical protein  46.15 
 
 
118 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  44.64 
 
 
116 aa  110  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  44.64 
 
 
116 aa  110  5e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1992  arsenate reductase and related  46.43 
 
 
126 aa  110  5e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.788879  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2750  hypothetical protein  46.15 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  44.64 
 
 
116 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  43.75 
 
 
112 aa  110  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2601  hypothetical protein  46.15 
 
 
118 aa  110  7.000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  42.98 
 
 
116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3692  hypothetical protein  46.96 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  46.15 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  46.15 
 
 
132 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2617  hypothetical protein  45.3 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  46.15 
 
 
132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  42.48 
 
 
116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  44.64 
 
 
114 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1328  arsenate reductase and related  44.74 
 
 
114 aa  107  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381357  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  38.05 
 
 
113 aa  107  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1264  arsenate reductase and related  44.74 
 
 
114 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447038  normal  0.406086 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  47.32 
 
 
114 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  41.28 
 
 
115 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3236  arsenate reductase and related  46.3 
 
 
117 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.249466  normal  0.726187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  44.44 
 
 
118 aa  104  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1894  hypothetical protein  44.25 
 
 
115 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.169993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2191  hypothetical protein  46.02 
 
 
121 aa  104  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  46.55 
 
 
127 aa  103  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  41.07 
 
 
115 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  39.82 
 
 
115 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  40.71 
 
 
116 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  40.71 
 
 
116 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  41.8 
 
 
125 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  42.59 
 
 
121 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  44.35 
 
 
118 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  44.35 
 
 
118 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  44.35 
 
 
118 aa  101  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  44.35 
 
 
118 aa  100  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2741  hypothetical protein  44.35 
 
 
118 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.609617  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1642  arsenate reductase and related  39.13 
 
 
119 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  39.29 
 
 
115 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  42.31 
 
 
118 aa  100  9e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  38.39 
 
 
115 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3161  hypothetical protein  40.5 
 
 
125 aa  99  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000277744  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  41.96 
 
 
118 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  40.71 
 
 
115 aa  97.4  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  41.59 
 
 
116 aa  97.8  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1421  hypothetical protein  41.44 
 
 
115 aa  97.4  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000321646  normal  0.0232654 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  41.28 
 
 
121 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  38.66 
 
 
128 aa  96.7  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  41.07 
 
 
115 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2469  arsenate reductase and related  40.35 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0609366  normal  0.0790586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1246  arsenate reductase and related  40 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520189  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2470  hypothetical protein  39.82 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  41.07 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5340  hypothetical protein  40.87 
 
 
122 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.133474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  41.07 
 
 
118 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1669  hypothetical protein  41.23 
 
 
121 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0611476  normal  0.0189322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  41.88 
 
 
121 aa  95.9  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2468  arsenate reductase and related  41.23 
 
 
121 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.901101  hitchhiker  0.0000933916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1648  hypothetical protein  46.02 
 
 
114 aa  96.7  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.77619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1267  arsenate reductase and related  38.53 
 
 
114 aa  95.9  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.99562 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02543  arsenate reductase  40.54 
 
 
115 aa  95.1  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000565166  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1391  hypothetical protein  44.14 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  40.19 
 
 
115 aa  95.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1932  arsenate reductase and related  40.87 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.466834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2015  ArsC family transcription regulator  39.47 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2063  hypothetical protein  40.87 
 
 
122 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2353  arsenate reductase and related  40.35 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.356753  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2050  arsenate reductase and related  40.87 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6046  hypothetical protein  40.87 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.969141  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2031  hypothetical protein  40.87 
 
 
122 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.593446  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  40.52 
 
 
120 aa  94.4  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1290  hypothetical protein  41.23 
 
 
114 aa  94.7  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  37.82 
 
 
128 aa  94.4  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  40 
 
 
119 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1342  hypothetical protein  39.47 
 
 
124 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.976086  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2595  ArsC family transcription regulator  39.47 
 
 
124 aa  94  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.613021  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  41.38 
 
 
118 aa  94  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3242  hypothetical protein  39.47 
 
 
124 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  38.39 
 
 
115 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2070  hypothetical protein  39.47 
 
 
124 aa  94  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.764259  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2506  ArsC family protein  39.47 
 
 
124 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0559  hypothetical protein  43.75 
 
 
112 aa  93.6  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.401537  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  37.72 
 
 
134 aa  94  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2366  arsenate reductase and related  39.47 
 
 
152 aa  93.6  9e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0297547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>