79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1122 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1122  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  764  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.003942  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1304  hypothetical protein  98.97 
 
 
388 aa  760  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00427648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3723  hypothetical protein  42.5 
 
 
411 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0216  hypothetical protein  41.03 
 
 
411 aa  273  5e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.380044  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2883  hypothetical protein  34.97 
 
 
400 aa  233  5e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3162  SAM dependent methyltransferase  41.35 
 
 
389 aa  213  5e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0312  hypothetical protein  30.4 
 
 
388 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0938935  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0449  hypothetical protein  30.82 
 
 
392 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.114768  decreased coverage  4.34601e-06 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0378  hypothetical protein  28.24 
 
 
401 aa  197  2e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0726  hypothetical protein  24.51 
 
 
407 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0414  SAM-dependent methyltransferase  33.23 
 
 
394 aa  189  6e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.675076  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4406  hypothetical protein  30.52 
 
 
404 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.460702  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1046  hypothetical protein  29.69 
 
 
409 aa  185  1e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4318  hypothetical protein  30.06 
 
 
404 aa  185  1e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234273  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3988  hypothetical protein  30.57 
 
 
406 aa  184  2e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2170  SAM dependent methyltransferase  35.14 
 
 
389 aa  179  7e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000185773  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3589  hypothetical protein  25.72 
 
 
401 aa  178  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.2704 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87131  predicted protein  25.06 
 
 
453 aa  176  6e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00012796  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3246  hypothetical protein  27.49 
 
 
444 aa  175  1e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0143918  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1301  hypothetical protein  30.59 
 
 
410 aa  174  2e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.206283  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4286  hypothetical protein  30.55 
 
 
406 aa  174  2e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3286  SAM-dependent methyltransferase  32.85 
 
 
378 aa  171  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0632  hypothetical protein  31.44 
 
 
404 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.95994 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3377  hypothetical protein  29.44 
 
 
399 aa  168  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3894  hypothetical protein  30.17 
 
 
399 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2392  hypothetical protein  34.18 
 
 
423 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0440  hypothetical protein  30.17 
 
 
399 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5884  hypothetical protein  26.9 
 
 
376 aa  167  3e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4017  hypothetical protein  30.17 
 
 
399 aa  167  3e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1010  hypothetical protein  35.89 
 
 
420 aa  166  5e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.75207  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3821  hypothetical protein  30.17 
 
 
401 aa  166  6e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3564  hypothetical protein  27.96 
 
 
413 aa  159  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0616674  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46056  predicted protein  31.38 
 
 
612 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.268711  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1797  hypothetical protein  32.06 
 
 
273 aa  127  4e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.534561 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1388  hypothetical protein  27.21 
 
 
316 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.580815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2734  hypothetical protein  30.08 
 
 
276 aa  119  8e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4096  hypothetical protein  29.13 
 
 
283 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0436  hypothetical protein  30.97 
 
 
277 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4127  hypothetical protein  29.53 
 
 
283 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3984  hypothetical protein  29.13 
 
 
280 aa  117  4e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1006  hypothetical protein  27.34 
 
 
320 aa  115  1e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.945095  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2900  hypothetical protein  27.72 
 
 
296 aa  114  2e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.320076  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0707  hypothetical protein  28.36 
 
 
309 aa  114  4e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2942  hypothetical protein  28.63 
 
 
298 aa  113  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0402  hypothetical protein  28.31 
 
 
303 aa  113  7e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2930  hypothetical protein  28.21 
 
 
286 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.778449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0428  hypothetical protein  28.31 
 
 
303 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1150  hypothetical protein  26.14 
 
 
294 aa  112  1e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0497  hypothetical protein  28.24 
 
 
296 aa  112  2e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3581  hypothetical protein  27.97 
 
 
323 aa  111  2e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2608  hypothetical protein  28.24 
 
 
296 aa  112  2e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3585  hypothetical protein  27.82 
 
 
295 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3167  hypothetical protein  28.63 
 
 
298 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0033  hypothetical protein  28.63 
 
 
298 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1733  hypothetical protein  28.63 
 
 
298 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3617  hypothetical protein  28.63 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2810  hypothetical protein  28.63 
 
 
298 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3605  hypothetical protein  28.63 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3630  hypothetical protein  28.63 
 
 
300 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0682  hypothetical protein  28.1 
 
 
294 aa  110  4e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.189745  normal  0.58708 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3535  hypothetical protein  29.6 
 
 
280 aa  110  4e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0781618  normal  0.194913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2456  hypothetical protein  28.74 
 
 
277 aa  109  7e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5571  hypothetical protein  28.42 
 
 
290 aa  109  8e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0470  hypothetical protein  27.86 
 
 
296 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.552825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0423  hypothetical protein  28.8 
 
 
280 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0625  hypothetical protein  27.6 
 
 
316 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629382  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3601  hypothetical protein  28.06 
 
 
278 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.11991  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4678  hypothetical protein  28.06 
 
 
278 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.998314 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3157  hypothetical protein  30.12 
 
 
278 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0871  hypothetical protein  26.56 
 
 
285 aa  106  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215269  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0532  hypothetical protein  27.14 
 
 
307 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1208  hypothetical protein  26.85 
 
 
273 aa  100  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3560  hypothetical protein  27.97 
 
 
277 aa  99.8  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.215657  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_93465  predicted protein  29.81 
 
 
278 aa  52  2e-05  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  27.16 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.40908e-07  hitchhiker  4.3462e-08 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  27.85 
 
 
283 aa  44.3  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  29.07 
 
 
248 aa  43.9  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49556  predicted protein  26.72 
 
 
541 aa  43.5  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  25.56 
 
 
360 aa  42.7  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>