More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0172 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0175  ABC transporter, ATP-binding protein  98.83 
 
 		 341 aa  668    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0172  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 341 aa  675    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0659  ABC transporter, ATP-binding protein  50.15 
 
 		 330 aa  343  2e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2522  ABC transporter related  49.42 
 
 		 336 aa  342  5e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0434  ABC transporter related  46.47 
 
 		 336 aa  335  7e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0486  ABC transporter related  48.4 
 
 		 334 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1358  ABC transporter related protein  46.63 
 
 		 334 aa  322  4e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0454  ABC transporter-related protein  45.7 
 
 		 337 aa  320  3e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0526  ABC transporter related protein  43.92 
 
 		 328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0588  ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 		 337 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1832  ABC transporter related  43.03 
 
 		 335 aa  317  2e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.476025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4789  ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 337 aa  316  4e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0670413  hitchhiker  0.00137355 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0515  ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00155864 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0587  ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0537  ABC transporter, ATP-binding protein  44.44 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0500  ABC transporter ATP-binding protein  45.43 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0443  ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0439  ABC transporter, ATP-binding protein  45.43 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0532  ABC transporter ATP-binding protein  45.43 
 
 		 337 aa  315  6e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0448  ABC transporter related  44.74 
 
 		 337 aa  315  7e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2673  ABC transporter related  43.49 
 
 		 324 aa  299  5e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0190306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2519  ABC transporter related  45 
 
 		 333 aa  296  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.791521  normal  0.562041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2220  ABC transporter related  44.57 
 
 		 333 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.580066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0978  ABC transporter related  44.57 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3780  ABC transporter related  55.56 
 
 		 265 aa  287  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000137492  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0444  ABC transporter related  43.49 
 
 		 324 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.060153 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2385  ABC transporter related  40.95 
 
 		 320 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0425  ABC transporter related protein  44.38 
 
 		 339 aa  274  2.0000000000000002e-72  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0487  ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 		 261 aa  272  6e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.139587  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4151  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0325933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1920  ABC transporter related  38.28 
 
 		 324 aa  267  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.567782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4781  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 330 aa  266  5e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.975884 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2493  ABC transporter related protein  44.37 
 
 		 318 aa  264  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000144687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1069  ABC transporter related  48.36 
 
 		 285 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.670352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1128  ABC transporter related  50.19 
 
 		 328 aa  261  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0395401  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4689  ABC transporter related  37.98 
 
 		 331 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2073  ABC transporter-related protein  46.72 
 
 		 276 aa  259  7e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111987  normal  0.868445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3436  ABC transporter, ATP-binding protein  47.83 
 
 		 254 aa  257  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6487  ABC transporter related  40.76 
 
 		 317 aa  256  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112869  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1284  ABC transporter related  35.48 
 
 		 329 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.980121 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12840  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.84 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.906732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09750  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.23 
 
 		 342 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1441  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 326 aa  252  7e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0911  ABC transporter related protein  39.05 
 
 		 329 aa  252  8.000000000000001e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5809  ABC transporter related  45.49 
 
 		 292 aa  251  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.186512 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2031  ABC transporter related  36.31 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3153  ABC transporter related  36.76 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3863  ABC transporter related  39.59 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1189  ABC transporter related protein  39.71 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2057  ABC transporter related  35.48 
 
 		 329 aa  250  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2682  ABC transporter-like  35.48 
 
 		 326 aa  250  3e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.241225  normal  0.53563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2410  ABC transporter related  36.76 
 
 		 332 aa  247  2e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0550  ABC transporter-like protein  33.53 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.136091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0536  ABC transporter related protein  33.53 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0404  ABC transporter, ATPase subunit  33.82 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3395  ABC transporter, ATP-binding protein  36.9 
 
 		 338 aa  246  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109056  hitchhiker  0.000000258754 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2350  ABC transporter related  46.06 
 
 		 324 aa  245  8e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0432  ABC transporter-related protein  33.82 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.402664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0433  ABC transporter related  33.82 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2557  ATPase  33.63 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2497  ABC transporter related  34.6 
 
 		 328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.946851  normal  0.620619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4137  ABC transporter related  37.98 
 
 		 326 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.055455  normal  0.659837 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2319  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2515  ABC transporter related  34.69 
 
 		 324 aa  240  2e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3407  ABC transporter related  36.23 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.205192 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3919  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08570  ABC transporter related  45.15 
 
 		 262 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2211  ATPase  33.04 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4166  ABC transporter related  34.62 
 
 		 332 aa  237  3e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.675613  normal  0.359967 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0660  ABC transporter related  33.93 
 
 		 337 aa  236  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  hitchhiker  0.000000264016 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1966  ABC transporter related  37.06 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000391335  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1759  ABC transporter-like protein protein  34.02 
 
 		 326 aa  234  2.0000000000000002e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1396  ABC transporter related protein  34.12 
 
 		 331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2818  ABC transporter related protein  32.34 
 
 		 333 aa  230  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.700865  normal  0.172012 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10521  putative multidrug efflux ABC transporter  38.89 
 
 		 331 aa  228  8e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29121  putative multidrug efflux ABC transporter  33.73 
 
 		 331 aa  228  2e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0178  ATPase  33.53 
 
 		 325 aa  224  1e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.604425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  38.01 
 
 		 329 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2891  ABC transporter-like protein  32.74 
 
 		 330 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.130142 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10511  putative multidrug efflux ABC transporter  38.64 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.110589  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0981  ATPase  44.73 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.425969  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0234  ATPase  34.62 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.822297  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09011  putative multidrug efflux ABC transporter  34.32 
 
 		 332 aa  219  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266178 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0893  ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 343 aa  213  4.9999999999999996e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0547  ABC transporter related  40.98 
 
 		 333 aa  212  9e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.757671  normal  0.958151 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0136  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 314 aa  207  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013516  Smon_1507  ABC transporter related protein  43.2 
 
 		 314 aa  206  4e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  decreased coverage  0.000000000014489  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3566  ABC transporter related  35.22 
 
 		 302 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2651  ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 		 329 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  39.09 
 
 		 251 aa  162  7e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.47 
 
 		 317 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.98 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  36.03 
 
 		 243 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  36.44 
 
 		 243 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  34 
 
 		 310 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  38.53 
 
 		 266 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  35.93 
 
 		 327 aa  152  8e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  36.29 
 
 		 279 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  34.29 
 
 		 332 aa  149  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.62 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>