More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0079 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0079  putative amino acid permease  100 
 
 		 440 aa  862    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41010  putative amino acid permease  31.91 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3476  putative amino acid permease  31.52 
 
 		 451 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1307  amino acid permease-associated region  32.8 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.678061 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4244  amino acid permease-associated region  33.94 
 
 		 453 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2346  amino acid permease-associated region  33.26 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5198  amino acid permease-associated region  32.64 
 
 		 441 aa  220  5e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.043341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2801  amino acid permease  30.86 
 
 		 476 aa  219  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764757  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0540  arginine/ornithine antiporter protein  32.31 
 
 		 465 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00650316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0596  amino acid permease family protein  32.31 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0758  amino acid permease family protein  32.31 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0684  amino acid permease family protein  32.31 
 
 		 465 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0697  amino acid permease family protein  32.09 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2206  amino acid permease-associated region  33.72 
 
 		 452 aa  218  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.218547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4672  amino acid permease family protein  32.31 
 
 		 465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.1139e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0540  arginine/ornithine antiporter protein  32.09 
 
 		 465 aa  217  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0629  amino acid permease family protein  32.09 
 
 		 465 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1754  amino acid permease-associated region  32.75 
 
 		 474 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0665  amino acid permease family protein  32.09 
 
 		 465 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0542  amino acid permease-associated region  31.65 
 
 		 465 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2782  arginine:agmatin antiporter  32.42 
 
 		 444 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.604082  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2861  arginine:agmatin antiporter  32.42 
 
 		 444 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0608832  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1326  arginine:agmatin antiporter  32.42 
 
 		 444 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.501085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3940  amino acid permease-associated region  34.44 
 
 		 460 aa  209  7e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.447116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  32.29 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  32.29 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  32.29 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  32.29 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0536  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 		 435 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.555012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2394  arginine:agmatin antiporter  34.02 
 
 		 450 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.66662  normal  0.401461 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  32.06 
 
 		 445 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4612  arginine:agmatin antiporter  32.81 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1674  phospholipid binding protein  31.69 
 
 		 438 aa  206  8e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.054806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4355  arginine:agmatin antiporter  32.59 
 
 		 445 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.705479  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03986  arginine:agmatin  32.59 
 
 		 445 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3877  amino acid permease-associated region  32.59 
 
 		 445 aa  204  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5628  arginine:agmatin antiporter  32.59 
 
 		 445 aa  204  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3912  arginine:agmatin antiporter  32.59 
 
 		 445 aa  204  4e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4580  arginine:agmatin antiporter  32.59 
 
 		 445 aa  204  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.721219  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03947  hypothetical protein  32.59 
 
 		 445 aa  204  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4669  arginine:agmatin antiporter  32.59 
 
 		 445 aa  204  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0941  amino acid permease family protein  30.82 
 
 		 474 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000289126 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0755  amino acid permease-associated region  31.09 
 
 		 474 aa  200  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.254398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0754  arginine/ornithine antiporter  31.03 
 
 		 474 aa  200  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0937  amino acid permease family protein  30.82 
 
 		 474 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4436  amino acid permease family protein  30.6 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0280359  normal  0.0537632 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3702  arginine:agmatin antiporter  32.8 
 
 		 509 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.391119 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0901  amino acid permease family protein  30.3 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.264525  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1029  amino acid permease family protein  30.6 
 
 		 474 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.530326  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0780  arginine:agmatin antiporter  32.57 
 
 		 510 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12332  normal  0.0754473 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0683  amino acid permease-associated region  30.54 
 
 		 471 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0749  arginine/ornithine antiporter  30.39 
 
 		 474 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000982146  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4860  arginine:agmatin antiporter  32.57 
 
 		 508 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.086172  hitchhiker  0.00303215 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4344  arginine:agmatin antiporter  32.57 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.620829  hitchhiker  0.000578907 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1458  arginine/ornithine antiporter  30.02 
 
 		 472 aa  193  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0071658  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1782  amino acid permease-associated region  32.35 
 
 		 473 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3167  amino acid permease-associated region  29.23 
 
 		 436 aa  190  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0147  amino acid permease-associated region  31.72 
 
 		 448 aa  188  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3254  putrescine transporter  29.89 
 
 		 442 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04834  putrescine transporter  32.57 
 
 		 436 aa  187  3e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  31.18 
 
 		 503 aa  186  9e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0805  amino acid permease family protein  30.13 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0845  amino acid permease family protein  30.13 
 
 		 456 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001093  putrescine/proton symporter putrescine/ornithine antiporter PotE  32.12 
 
 		 436 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0537  amino acid permease-associated region  32.09 
 
 		 474 aa  182  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.198205  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2101  arginine/ornithine antiporter  32.52 
 
 		 475 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0476819  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2423  arginine/ornithine antiporter  28.67 
 
 		 489 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1671  arginine/ornithine antiporter  31.78 
 
 		 475 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0760  putrescine transporter  30.73 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.428261  normal  0.419082 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2065  arginine/ornithine antiporter  31.49 
 
 		 475 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00119125  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0808  putrescine transporter  30.73 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.210181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0747  putrescine transporter  30.73 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110662  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0857  putrescine transporter  30.73 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0821  putrescine transporter  30.73 
 
 		 439 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.438039  normal  0.147845 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2166  arginine/ornithine antiporter  29.45 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2127  arginine/ornithine antiporter  31.04 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.712584  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2391  arginine/ornithine antiporter  31.25 
 
 		 471 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.463763  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2061  arginine/ornithine antiporter  31.04 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.111642  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2307  arginine/ornithine antiporter  31.04 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2281  arginine/ornithine antiporter  31.04 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2315  arginine/ornithine antiporter  31.25 
 
 		 471 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.145649  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0714  putrescine transporter  30.29 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0136028  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0422  arginine/ornithine antiporter  32.88 
 
 		 471 aa  177  3e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00648  putrescine/proton symporter: putrescine/ornithine antiporter  30.07 
 
 		 439 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.173719  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2945  arginine/ornithine antiporter  30.07 
 
 		 439 aa  176  5e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00640  hypothetical protein  30.07 
 
 		 439 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.167643  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2964  putrescine transporter  30.07 
 
 		 439 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.018093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4896  arginine/ornithine antiporter  32.88 
 
 		 471 aa  176  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.782908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0474  arginine/ornithine antiporter  32.43 
 
 		 471 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1067  putrescine transporter  31 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0784  putrescine transporter  30.07 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0285849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2264  arginine/ornithine antiporter  31.28 
 
 		 475 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0343  arginine-ornithine antiporter  32.66 
 
 		 471 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1204  putrescine transporter  29.28 
 
 		 437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.658764  decreased coverage  0.0000377329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3335  putrescine transporter  32.67 
 
 		 438 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1392  arginine/ornithine antiporter  27.69 
 
 		 496 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.679815 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0313  putrescine transporter  32.05 
 
 		 439 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0409  arginine/ornithine antiporter  32.43 
 
 		 471 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0196821 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2989  putrescine transporter  29 
 
 		 443 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00443871  normal  0.0573626 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6446  amino acid permease-associated region  28.7 
 
 		 750 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.396159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>