More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1935 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  72.41 
 
 		 89 aa  132  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  75.9 
 
 		 88 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  74.7 
 
 		 88 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  69.88 
 
 		 88 aa  125  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  71.26 
 
 		 88 aa  125  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  72.41 
 
 		 87 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 88 aa  123  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  123  9e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  69.88 
 
 		 90 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  70.11 
 
 		 87 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  72.29 
 
 		 89 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  69.88 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1441  ribosomal protein S15  71.95 
 
 		 88 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  69.88 
 
 		 89 aa  120  7e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 89 aa  120  8e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1216  ribosomal protein S15  67.82 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.296388  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2479  ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.053537  normal  0.211646 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  68.97 
 
 		 88 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  63.86 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  69.88 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  69.88 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  69.88 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3178  SSU ribosomal protein S15P  67.44 
 
 		 91 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 89 aa  117  4.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1465  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 100 aa  117  4.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0290661 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  66.27 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3584  ribosomal protein S15  65.52 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.890304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0055  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  68.67 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3723  SSU ribosomal protein S15P  68.67 
 
 		 89 aa  115  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  68.29 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  65.06 
 
 		 88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  63.86 
 
 		 89 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10370  SSU ribosomal protein S15P  63.22 
 
 		 89 aa  115  3e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00597955  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  65.06 
 
 		 89 aa  114  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  65.85 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  65.06 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  66.27 
 
 		 89 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  63.86 
 
 		 88 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09240  SSU ribosomal protein S15P  63.22 
 
 		 90 aa  113  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.811486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2767  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 88 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0332694  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  67.47 
 
 		 89 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  58.62 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1284  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.942726  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1124  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0212  ribosomal protein S15  67.07 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0442  ribosomal protein S15  65.06 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  63.86 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1024  ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0921  30S ribosomal protein S15  65.48 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2812  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 86 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.789885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  63.86 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  63.22 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  63.86 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  62.65 
 
 		 90 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  62.65 
 
 		 90 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07090  30S ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  111  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.619693  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23390  SSU ribosomal protein S15P  63.22 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.103973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2521  30S ribosomal protein S15  64.37 
 
 		 89 aa  110  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.846935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2069  30S ribosomal protein S15  61.9 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.614484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1023  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.672022 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5582  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171961  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2278  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0135045  normal  0.085969 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1642  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.655154  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2292  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0792803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2171  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.191878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2254  30S ribosomal protein S15  63.1 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2014  ribosomal protein S15  61.9 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0275051  normal  0.303203 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  62.07 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5113  30S ribosomal protein S15  60.92 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0443958  normal  0.15757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1449  SSU ribosomal protein S15P  60.92 
 
 		 89 aa  110  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00001939  normal  0.2265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3784  30S ribosomal protein S15  62.65 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116654  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1257  ribosomal protein S15  62.65 
 
 		 89 aa  110  8.000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  61.45 
 
 		 89 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1629  ribosomal protein S15  55.81 
 
 		 95 aa  109  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.232909  hitchhiker  0.0000867446 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1417  SSU ribosomal protein S15P  65.85 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0360533  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1496  ribosomal protein S15  59.77 
 
 		 87 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00211437 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>