62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1257 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1257  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  414  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000444267  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1069  hypothetical protein  97.06 
 
 		 204 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000104806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0654  protein of unknown function DUF1130  42.42 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0956  hypothetical protein  31.63 
 
 		 198 aa  121  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.98733 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2774  hypothetical protein  33.76 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000000000670042  unclonable  0.000000153517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2541  hypothetical protein  25.82 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2844  protein of unknown function DUF1130  36.36 
 
 		 199 aa  97.8  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000271396  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1308  hypothetical protein  31.76 
 
 		 224 aa  85.9  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.164659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0626  protein of unknown function DUF1130  26.46 
 
 		 194 aa  83.2  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1541  protein of unknown function DUF1130  33.1 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.931737  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1742  hypothetical protein  30.77 
 
 		 151 aa  77  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1876  hypothetical protein  29.8 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0629  protein of unknown function DUF1130  29.73 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3491  hypothetical protein  30.41 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3471  hypothetical protein  31.54 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.646682  normal  0.0531544 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2660  protein of unknown function DUF1130  28.06 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3855  hypothetical protein  25.99 
 
 		 178 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.588539  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3417  hypothetical protein  29.1 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.383582  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4534  protein of unknown function DUF1130  28.76 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.360408  normal  0.813049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1577  hypothetical protein  29.22 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3713  hypothetical protein  28.67 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251744  normal  0.149746 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4004  hypothetical protein  28.67 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4695  protein of unknown function DUF1130  27.15 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0878626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4926  hypothetical protein  32.89 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4609  hypothetical protein  29.53 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.155084  normal  0.570285 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3237  hypothetical protein  32.89 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3408  hypothetical protein  30.2 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0793  hypothetical protein  27.63 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.894091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4337  hypothetical protein  30.32 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0844376  hitchhiker  0.00670192 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3526  hypothetical protein  28.99 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4905  hypothetical protein  26.97 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.556359  normal  0.961888 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3461  hypothetical protein  26.97 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30420  hypothetical protein  22.52 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.711369  normal  0.230414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4854  hypothetical protein  30.32 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.388946  normal  0.0401842 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1153  protein of unknown function DUF1130  26.45 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.908122 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5381  hypothetical protein  26.97 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0782244  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3108  hypothetical protein  31.46 
 
 		 106 aa  53.9  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0971254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1081  hypothetical protein  27.86 
 
 		 148 aa  54.3  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0130  hypothetical protein  24.43 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0891  hypothetical protein  26.09 
 
 		 167 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0714712  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0796  protein of unknown function DUF1130  21.94 
 
 		 176 aa  52  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1426  protein of unknown function DUF1130  22.42 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.000439309  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0317  hypothetical protein  35 
 
 		 102 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.0000000000191328  decreased coverage  0.00259322 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4520  hypothetical protein  29.53 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0127  hypothetical protein  27.89 
 
 		 160 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3308  protein of unknown function DUF1130  33.33 
 
 		 68 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.65089  normal  0.526797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4634  hypothetical protein  23.18 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.546233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4341  hypothetical protein  23.18 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449808  normal  0.127657 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4255  hypothetical protein  23.18 
 
 		 178 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3555  protein of unknown function DUF1130  29.93 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1437  hypothetical protein  23.46 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1898  hypothetical protein  22.3 
 
 		 149 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0934802  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0033  protein of unknown function DUF1130  24.83 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0015  hypothetical protein  24.83 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1643  hypothetical protein  19.18 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.512897  normal  0.627167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3491  protein of unknown function DUF1130  29.93 
 
 		 176 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.374497  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30650  hypothetical protein  23.38 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1109  hypothetical protein  26.39 
 
 		 298 aa  45.8  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.137011  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1162  hypothetical protein  22.66 
 
 		 284 aa  43.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2160  hypothetical protein  23.29 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0291564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5517  hypothetical protein  23.45 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0586  hypothetical protein  21.53 
 
 		 154 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.794259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>