118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03640 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH03640  membrane protein, putative  100 
 
 
283 aa  570  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0291661  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02960  conserved hypothetical protein  59.19 
 
 
257 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.392793  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02140  conserved hypothetical protein  57.99 
 
 
281 aa  249  4e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31420  predicted protein  40.51 
 
 
258 aa  150  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.450745  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07317  conserved hypothetical protein  39.9 
 
 
221 aa  141  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0696491  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35799  predicted protein  37.37 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0356533  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38314  putative transporter  33.84 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.801192  normal  0.297491 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31253  predicted protein  33.17 
 
 
266 aa  124  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_83722  Accumulation of DYads  35.1 
 
 
274 aa  122  7e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05226  Acetate permeasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2K4]  38.39 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.719404  normal  0.707615 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35800  predicted protein  33.17 
 
 
264 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33707  predicted protein  36.26 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373247  hitchhiker  0.000185367 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0605  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.84 
 
 
197 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0724  GPR1/FUN34/yaaH  36.9 
 
 
214 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.38 
 
 
214 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.444258  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0761  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.38 
 
 
214 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.954499  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01839  conserved hypothetical protein  30.92 
 
 
293 aa  103  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.009571  normal  0.645979 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3467  hypothetical protein  36.27 
 
 
203 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0798  hypothetical protein  36.27 
 
 
203 aa  102  6e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000907373  normal  0.0776345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3595  hypothetical protein  36.27 
 
 
203 aa  102  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0906121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1126  GPR1/FUN34/yaaH  37.38 
 
 
203 aa  102  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2982  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.87 
 
 
186 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.119024  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0492  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.22 
 
 
197 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3478  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.9 
 
 
195 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0065  GPR1/FUN34/yaaH family protein  38.15 
 
 
196 aa  100  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1124  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.5 
 
 
196 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.546055 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0999  hypothetical protein  35.57 
 
 
203 aa  99.4  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5595  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.68 
 
 
201 aa  99  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.626541  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3630  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.82 
 
 
209 aa  97.4  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0577  hypothetical protein  32.99 
 
 
188 aa  97.4  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.825629  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0552  hypothetical protein  35.75 
 
 
194 aa  97.1  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.85069e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0634  GPR1/FUN34/yaaH  35.35 
 
 
198 aa  97.4  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0870411  normal  0.0467455 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1410  hypothetical protein  34.54 
 
 
204 aa  96.7  4e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1861  hypothetical protein  34.59 
 
 
211 aa  96.3  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1357  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.31 
 
 
194 aa  96.3  5e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.55658  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00010  conserved inner membrane protein associated with acetate transport  34.02 
 
 
188 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3586  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.02 
 
 
188 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0011  hypothetical protein  34.02 
 
 
188 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.708242  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0010  hypothetical protein  34.02 
 
 
188 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3645  hypothetical protein  34.02 
 
 
188 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0011  hypothetical protein  34.02 
 
 
188 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00010  hypothetical protein  34.02 
 
 
188 aa  96.3  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1050  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.36 
 
 
203 aa  95.9  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0263  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.36 
 
 
199 aa  95.1  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0691  hypothetical protein  34.87 
 
 
199 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.003925  hitchhiker  0.00210263 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0009  hypothetical protein  34.02 
 
 
188 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1327  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.38 
 
 
197 aa  94.7  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.39924  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0580  hypothetical protein  33.16 
 
 
190 aa  94  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3588  gpr1/fun34/yaaH family protein  36.08 
 
 
189 aa  94  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3660  hypothetical protein  34.41 
 
 
191 aa  94  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.444217  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0010  hypothetical protein  33.51 
 
 
188 aa  94  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.728204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3855  hypothetical protein  34.05 
 
 
191 aa  93.2  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.770098  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1352  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.23 
 
 
186 aa  93.2  4e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000041614  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0009  hypothetical protein  32.29 
 
 
188 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0009  hypothetical protein  32.29 
 
 
188 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207704  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0009  hypothetical protein  32.29 
 
 
188 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.436891  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0009  hypothetical protein  32.29 
 
 
188 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.350527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0009  hypothetical protein  32.29 
 
 
188 aa  93.2  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.396236  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3002  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.08 
 
 
189 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0614903  normal  0.240175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0541  hypothetical protein  32.63 
 
 
190 aa  92.8  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3180  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.57 
 
 
189 aa  92.4  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3083  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.57 
 
 
189 aa  91.7  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0605595  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0904  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.98 
 
 
188 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1305  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.89 
 
 
200 aa  91.3  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0755  GPR1/FUN34/yaaH  36.7 
 
 
190 aa  90.9  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.830173  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1348  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.95 
 
 
197 aa  91.3  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00408603 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4506  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.83 
 
 
202 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.733694  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22570  predicted membrane protein  34.44 
 
 
197 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.216454  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1320  membrane protein  34.38 
 
 
183 aa  90.5  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0524  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.1 
 
 
196 aa  88.6  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.153386 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.55 
 
 
187 aa  88.6  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.264314  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1108  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.03 
 
 
187 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00215615 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0890  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.8 
 
 
199 aa  87.8  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.400956  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01082  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  86.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1075  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.51 
 
 
187 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1067  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.87 
 
 
206 aa  85.5  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00312411  normal  0.445935 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1287  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.95 
 
 
255 aa  85.1  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  hitchhiker  0.00383069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0237  Gpr1/Fun34/YaaH family protein  34.24 
 
 
183 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004328  hypothetical protein  33.16 
 
 
196 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2076  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.11 
 
 
183 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1117  GPR1/FUN34/yaaH family protein  33.65 
 
 
207 aa  84  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0710546  normal  0.454396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1224  transcriptional regulator  37.1 
 
 
200 aa  83.2  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1480  permease  33.51 
 
 
189 aa  83.2  0.000000000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0666  GPR1/FUN34/yaaH family protein  34.24 
 
 
186 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0435275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0299  hypothetical protein  34.21 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0228  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.35 
 
 
209 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0029  GPR1/FUN34/yaaH family protein  37.84 
 
 
223 aa  79.7  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0364  GPR1/FUN34/yaaH family protein  35.39 
 
 
186 aa  79  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0695  gpr1/fun34/YaaH family protein  36.32 
 
 
200 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0014  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.97 
 
 
183 aa  78.6  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0212  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.35 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0761648 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2423  GPR1/FUN34/yaaH family protein  32.32 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542283  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2835  GPR1/FUN34/yaaH family protein  36.32 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.244228  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2192  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.77 
 
 
201 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032608 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2772  GPR1/FUN34/yaaH family protein  30.37 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.713345  normal  0.632048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1006  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.02 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0753776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3283  GPR1/FUN34/yaaH family protein  39.02 
 
 
187 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0944573 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1065  putative regulatory protein  30.57 
 
 
194 aa  70.1  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08390  plasma membrane ammonium transporter (Ato3), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01140)  27.83 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.284038  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7849  predicted protein  32.45 
 
 
191 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.161215 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>