More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0049 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0049  lysine decarboxylase family protein  100 
 
 
201 aa  406  1e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.435452  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0091  lysine decarboxylase family protein  99 
 
 
201 aa  402  1e-111  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0063  lysine decarboxylase family protein  92.04 
 
 
202 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0239  lysine decarboxylase family protein  62 
 
 
211 aa  240  1e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1018  hypothetical protein  49.5 
 
 
196 aa  177  9e-44  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1441  hypothetical protein  48.51 
 
 
197 aa  177  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00785449  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  45.21 
 
 
247 aa  161  5e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  41.92 
 
 
244 aa  161  5e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  1.50026e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  43.23 
 
 
225 aa  159  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  43.65 
 
 
247 aa  157  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  40.31 
 
 
239 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  43.09 
 
 
252 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  43.09 
 
 
249 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  42.49 
 
 
216 aa  155  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  1.81982e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  39.8 
 
 
239 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  40.62 
 
 
317 aa  155  3e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  43.09 
 
 
252 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  40.62 
 
 
317 aa  155  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  43.09 
 
 
252 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  43.09 
 
 
252 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  43.09 
 
 
252 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1207  hypothetical protein  47.19 
 
 
197 aa  155  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  40.1 
 
 
317 aa  154  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  43.09 
 
 
218 aa  154  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  1.13726e-06 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  43.09 
 
 
252 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  41.99 
 
 
247 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  43.09 
 
 
252 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  41.03 
 
 
261 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  45.66 
 
 
263 aa  152  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  41.99 
 
 
244 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  41.99 
 
 
244 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  41.99 
 
 
249 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  41.99 
 
 
244 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  41.99 
 
 
244 aa  151  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  41.99 
 
 
244 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  41.99 
 
 
249 aa  151  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  40.51 
 
 
258 aa  151  5e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  150  9e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  38.66 
 
 
239 aa  150  9e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  4.60605e-05 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  38.66 
 
 
245 aa  150  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  41.03 
 
 
269 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  38.97 
 
 
279 aa  149  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  42.19 
 
 
262 aa  148  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  38.54 
 
 
241 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  42.93 
 
 
266 aa  146  2e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  41.67 
 
 
243 aa  146  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  2.55019e-08 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  40 
 
 
242 aa  145  5e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  44.2 
 
 
263 aa  144  9e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  38.66 
 
 
249 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  1.09192e-06 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  38.46 
 
 
266 aa  143  1e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  37.89 
 
 
239 aa  143  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  41.18 
 
 
248 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  40.53 
 
 
264 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  39.06 
 
 
267 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  40.1 
 
 
260 aa  141  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  38.54 
 
 
273 aa  140  1e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  40.31 
 
 
259 aa  140  1e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  38.27 
 
 
217 aa  140  1e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  38.95 
 
 
242 aa  139  2e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  37.37 
 
 
241 aa  140  2e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  39.49 
 
 
332 aa  139  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0170  hypothetical protein  34.18 
 
 
218 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177593 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  37.89 
 
 
241 aa  139  4e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  40.62 
 
 
229 aa  138  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  38.66 
 
 
242 aa  136  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  39.09 
 
 
242 aa  136  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  38.66 
 
 
289 aa  136  3e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  37.3 
 
 
263 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  37.24 
 
 
243 aa  135  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  38.95 
 
 
244 aa  135  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  38.02 
 
 
255 aa  134  7e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  37.97 
 
 
247 aa  134  7e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  36.13 
 
 
313 aa  133  1e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  36.6 
 
 
241 aa  132  3e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  35.84 
 
 
261 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  36.41 
 
 
267 aa  131  6e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  35.9 
 
 
278 aa  131  8e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  37.5 
 
 
218 aa  130  1e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  37.3 
 
 
268 aa  130  1e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  42.44 
 
 
229 aa  130  1e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  36.9 
 
 
280 aa  130  1e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  39.01 
 
 
266 aa  130  2e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  36.22 
 
 
283 aa  129  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  37.7 
 
 
283 aa  129  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4232  hypothetical protein  39.55 
 
 
365 aa  128  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692535 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2800  hypothetical protein  36.41 
 
 
275 aa  127  9e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.983756  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  35.9 
 
 
266 aa  127  9e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  36.9 
 
 
218 aa  127  1e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  37.5 
 
 
243 aa  127  1e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  40.36 
 
 
266 aa  127  1e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  41.48 
 
 
245 aa  127  1e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  38.95 
 
 
276 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  38.6 
 
 
288 aa  125  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  39.64 
 
 
241 aa  124  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  35.87 
 
 
259 aa  124  8e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2032  hypothetical protein  35.5 
 
 
222 aa  124  8e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4084  hypothetical protein  39.89 
 
 
275 aa  124  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2520  hypothetical protein  37.5 
 
 
260 aa  124  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177513 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  38.15 
 
 
235 aa  123  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  37.5 
 
 
240 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>