More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0063 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0063  lysine decarboxylase family protein  100 
 
 
202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0091  lysine decarboxylase family protein  92.04 
 
 
201 aa  370  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0049  lysine decarboxylase family protein  92.04 
 
 
201 aa  370  1e-101  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.435452  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0239  lysine decarboxylase family protein  63 
 
 
211 aa  243  1.9999999999999999e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1018  hypothetical protein  49.01 
 
 
196 aa  172  1.9999999999999998e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1441  hypothetical protein  48.02 
 
 
197 aa  171  9e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00785449  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1089  hypothetical protein  45.21 
 
 
247 aa  161  8.000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0299  hypothetical protein  41.92 
 
 
244 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000150026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1082  hypothetical protein  42.71 
 
 
225 aa  156  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.396045  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0872  hypothetical protein  41.15 
 
 
239 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.736442  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2043  hypothetical protein  41.15 
 
 
317 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2835  hypothetical protein  45.3 
 
 
216 aa  155  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000181982  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2436  hypothetical protein  40.62 
 
 
317 aa  155  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2231  hypothetical protein  40.62 
 
 
317 aa  155  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2625  hypothetical protein  40.62 
 
 
239 aa  155  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.553648 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1207  hypothetical protein  47.75 
 
 
197 aa  154  8e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2835  hypothetical protein  42.86 
 
 
247 aa  154  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2219  hypothetical protein  42.31 
 
 
252 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4828  hypothetical protein  42.31 
 
 
252 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.203832  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3656  hypothetical protein  41.05 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.387963  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0604  decarboxylase family protein  42.31 
 
 
249 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.266669  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4494  hypothetical protein  41.05 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535293  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3871  hypothetical protein  41.05 
 
 
252 aa  152  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20921  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6789  hypothetical protein  41.05 
 
 
218 aa  151  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818446  hitchhiker  0.00000113726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3768  hypothetical protein  42.31 
 
 
252 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00574254  hitchhiker  0.00551314 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3841  hypothetical protein  40.51 
 
 
258 aa  150  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.107126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1094  hypothetical protein  39.49 
 
 
279 aa  150  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208202  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3242  hypothetical protein  42.31 
 
 
252 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0247899 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3898  hypothetical protein  40.21 
 
 
261 aa  150  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0758722  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3081  hypothetical protein  42.71 
 
 
243 aa  149  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000255019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3662  hypothetical protein  41.75 
 
 
263 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0914373  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0086  hypothetical protein  40 
 
 
241 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2215  hypothetical protein  45.3 
 
 
263 aa  148  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.531186  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1499  decarboxylase family protein  41.21 
 
 
244 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780956  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0318  decarboxylase family protein  41.21 
 
 
249 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0852  decarboxylase family protein  41.21 
 
 
249 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.134375  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1695  decarboxylase family protein  41.21 
 
 
244 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.232557  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2547  hypothetical protein  41.21 
 
 
244 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0928666  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0352  decarboxylase family protein  41.21 
 
 
244 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2404  decarboxylase family protein  41.21 
 
 
244 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4418  hypothetical protein  41.21 
 
 
247 aa  148  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.52452  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0496  hypothetical protein  40 
 
 
269 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3095  conserved hypothetical protein TIGR00730  37.63 
 
 
245 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1689  hypothetical protein  38.42 
 
 
239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2693  hypothetical protein  37.63 
 
 
239 aa  145  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.721192  hitchhiker  0.0000460605 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3023  hypothetical protein  42.78 
 
 
248 aa  144  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.897661  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4300  hypothetical protein  41.67 
 
 
262 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.336059  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2452  hypothetical protein  39.47 
 
 
242 aa  142  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0709  hypothetical protein  40.82 
 
 
259 aa  143  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4048  hypothetical protein  42.39 
 
 
266 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1161  hypothetical protein  41.05 
 
 
264 aa  143  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0868  conserved hypothetical protein TIGR00730  39.01 
 
 
266 aa  142  3e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0045  hypothetical protein  37.5 
 
 
241 aa  142  4e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.666378  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06300  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  40.62 
 
 
260 aa  141  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1842  hypothetical protein  39.49 
 
 
289 aa  140  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0573823  normal  0.171511 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0164  hypothetical protein  39.18 
 
 
242 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2426  lysine decarboxylase family protein  39.89 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000109192 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2861  hypothetical protein  37.37 
 
 
241 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.33158  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0875  hypothetical protein  39.49 
 
 
332 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0359  hypothetical protein  39.66 
 
 
243 aa  138  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0930458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8428  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  38.54 
 
 
267 aa  137  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676666  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3814  hypothetical protein  38.42 
 
 
241 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.383956  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0567  hypothetical protein  38.42 
 
 
242 aa  137  1e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.892575  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1555  hypothetical protein  38.02 
 
 
273 aa  135  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4510  hypothetical protein  39.09 
 
 
242 aa  135  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.649813  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6911  hypothetical protein  37.57 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135288  normal  0.167118 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0682  putative DNA uptake protein  36.65 
 
 
313 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0774  hypothetical protein  38.02 
 
 
255 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0727  hypothetical protein  37.97 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1863  hypothetical protein  37.76 
 
 
217 aa  133  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.9915  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0555  hypothetical protein  36.84 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.456463  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0170  hypothetical protein  33.67 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0977  hypothetical protein  37.84 
 
 
268 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213763  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4873  hypothetical protein  38.95 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.626213 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0806  hypothetical protein  36.96 
 
 
267 aa  130  9e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.489855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3751  hypothetical protein  38.22 
 
 
283 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0136365  normal  0.197215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2928  hypothetical protein  37.3 
 
 
263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00045368 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10023  hypothetical protein  39.47 
 
 
229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4133  hypothetical protein  36.73 
 
 
283 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.242281  normal  0.352812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1602  hypothetical protein  38.1 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1000  hypothetical protein  35.9 
 
 
278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0395  hypothetical protein  42.05 
 
 
245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0342519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1780  hypothetical protein  38.1 
 
 
218 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00264225  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0106  hypothetical protein  34.67 
 
 
273 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.402019  normal  0.787059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0974  hypothetical protein  41.86 
 
 
229 aa  128  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.130247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11220  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  35.9 
 
 
266 aa  127  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.124999  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25950  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  36.9 
 
 
280 aa  127  9.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256647  normal  0.891073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1173  hypothetical protein  38.46 
 
 
266 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0612248  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2032  hypothetical protein  36.5 
 
 
222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19460  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2  39.18 
 
 
288 aa  126  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0125018 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1077  hypothetical protein  39.47 
 
 
276 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7947  hypothetical protein  35.33 
 
 
259 aa  125  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3030  hypothetical protein  39.31 
 
 
235 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.862157  hitchhiker  0.00666776 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1915  hypothetical protein  40.36 
 
 
266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1849  hypothetical protein  37.3 
 
 
245 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1201  hypothetical protein  36.96 
 
 
243 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5499  hypothetical protein  39.64 
 
 
241 aa  123  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.026859  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2390  hypothetical protein  35.52 
 
 
245 aa  123  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311617  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0297  hypothetical protein  37.5 
 
 
240 aa  122  3e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15410  conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 1 TIGR00725/conserved hypothetical protein, DprA/Smf-related, family 2 TIGR00730  35.42 
 
 
267 aa  122  3e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.47781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>