248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tLeu02 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_tLeu02  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.453597  normal  0.570342 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  95.12 
 
 		 82 bp  131  3e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0008  tRNA-Leu  91.3 
 
 		 82 bp  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.410755  normal  0.517805 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0025  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 85 bp  85.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.330204  normal  0.162761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0053  tRNA-Leu  88.73 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177582  normal  0.0218771 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0023  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.184177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6036  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.510432 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0079  tRNA-Leu  86.75 
 
 		 85 bp  77.8  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0034  tRNA-Leu  89.39 
 
 		 85 bp  75.8  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.501303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0060  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0047  tRNA-Leu  97.62 
 
 		 84 bp  75.8  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0059  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0559  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2172  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.204006  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0059  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 82 bp  75.8  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.408323  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0039  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 85 bp  73.8  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.56181 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_R0004  tRNA-Leu  89.86 
 
 		 81 bp  73.8  0.000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00103905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0044  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 82 bp  73.8  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.312452 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2516  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00849706  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2526  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000137231  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2220  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000237155  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2230  tRNA-Leu  95.56 
 
 		 84 bp  73.8  0.000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 83 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5691  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4574  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000586853  normal  0.081406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5636  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.115457  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000254003  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-1  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-8  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Leu-2  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 84 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000233591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0098  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5729  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000974817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0101  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000651871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0140  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000406181  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150176  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0331  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000146268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4256  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.10215e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0021  tRNA-Leu  85.71 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0857  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000493478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0029  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561598  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0782  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.20057e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0215  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0047  tRNA-Leu  95.45 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000181775  normal  0.0158723 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0021  tRNA-Leu  93.75 
 
 		 81 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0114577  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0069  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202771  hitchhiker  0.000000827914 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0894  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0074  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.313873  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0048  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000119164  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2630  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2316  tRNA-Leu  95.35 
 
 		 84 bp  69.9  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tLeu03  tRNA-Leu  88.06 
 
 		 88 bp  69.9  0.00000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0175696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1776  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000114198  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1774  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0044  tRNA-Leu  87.95 
 
 		 83 bp  69.9  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.892657  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1770  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135684  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0017  tRNA-Leu  85.54 
 
 		 85 bp  69.9  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.137168  normal  0.352813 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t13  tRNA-Leu  87.8 
 
 		 80 bp  67.9  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0039  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0067  tRNA-Leu  85.37 
 
 		 82 bp  67.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00168442  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna42  tRNA-Leu  87.88 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0044  tRNA-Leu  93.48 
 
 		 80 bp  67.9  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000745541  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0030  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 82 bp  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0049  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.172845  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0042  tRNA-Leu  86.96 
 
 		 85 bp  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.59111  normal  0.0140325 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  93.18 
 
 		 84 bp  63.9  0.000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0064  tRNA-Leu  87.5 
 
 		 85 bp  63.9  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2139  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  61.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0230095  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt07  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R53  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.9371 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0050  tRNA-Leu  84.34 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0830  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 84 bp  61.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0029  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  61.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.988938  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0045  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0044  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.257347  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1765  tRNA-Leu  90 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000020879  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0054  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0053  tRNA-Leu  86.36 
 
 		 85 bp  60  0.00000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000111519  normal  0.477245 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0048  tRNA-Leu  94.59 
 
 		 85 bp  58  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0044  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0046  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0046  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 82 bp  58  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5729  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000506844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5816  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000614665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Leu-6  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000113622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 84 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0312649  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0459  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000131572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5000  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4653  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.43114e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5031  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 86 bp  56  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000523525  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0136  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000583941  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0065  tRNA-Leu  85.94 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5018  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000585411  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0097  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000723849  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0691  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0737  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000058826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0049  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000545607  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0796  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000227497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0021  tRNA-Leu  89.58 
 
 		 81 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00453135  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0831  tRNA-Leu  90.91 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000791902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>