38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0074 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0074  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  793  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2013  hypothetical protein  53.7 
 
 
414 aa  424  1e-117  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1261  DNA repair photolyase-like  29.1 
 
 
389 aa  146  8e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.288369  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1935  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 
375 aa  134  2e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.779003  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1936  DNA repair photolyase-like protein  27.18 
 
 
371 aa  129  1e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.290758  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2907  Radical SAM domain protein  25.98 
 
 
368 aa  111  2e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1929  DNA repair photolyase-like protein  26.52 
 
 
335 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0715996  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1282  DNA repair photolyase-like protein  28.04 
 
 
426 aa  107  4e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2595  DNA repair photolyase-like protein  28.51 
 
 
336 aa  89.7  7e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0693761  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1416  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 
338 aa  73.9  5e-12  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.285665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0639  DNA repair photolyase-like protein  24.55 
 
 
337 aa  73.2  8e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.177826  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2336  DNA repair photolyase-like protein  24.77 
 
 
332 aa  70.1  6e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  2.45241e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3948  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  68.6  2e-10  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0709  radical SAM domain protein  26.67 
 
 
291 aa  67.8  3e-10  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  1.73731e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4109  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  67.4  4e-10  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4225  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  67.4  4e-10  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4429  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  67.4  4e-10  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3959  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  67  5e-10  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.901366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0919  spore photoproduct lyase  25.84 
 
 
341 aa  66.6  6e-10  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4315  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  66.6  6e-10  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4278  spore photoproduct lyase  25.36 
 
 
341 aa  66.6  7e-10  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0463  DNA repair photolyase  22.57 
 
 
335 aa  64.7  3e-09  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4334  spore photoproduct lyase  24.88 
 
 
341 aa  63.9  5e-09  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0691  spore photoproduct lyase  28.5 
 
 
352 aa  62.4  1e-08  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4058  spore photoproduct lyase  24.4 
 
 
341 aa  62.8  1e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0624  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 
339 aa  61.6  2e-08  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00552775  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0226  spore photoproduct lyase  24.39 
 
 
341 aa  60.8  4e-08  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1838  hypothetical protein  28.12 
 
 
331 aa  56.2  9e-07  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  1.26536e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3628  hypothetical protein  26.04 
 
 
334 aa  54.7  3e-06  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00018062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0667  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 
341 aa  52  2e-05  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00881865  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1777  hypothetical protein  27.37 
 
 
331 aa  48.5  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0238  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 
340 aa  47.8  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1110  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 
359 aa  47  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2710  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0234574 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2695  radical SAM domain-containing protein  23.12 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.955919  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2665  radical SAM family protein  23.12 
 
 
370 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134857  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2489  spore photoproduct lyase  28.95 
 
 
342 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1928  spore photoproduct lyase, splB  24.57 
 
 
340 aa  43.1  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0376642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>