80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0914 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0914  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 
176 aa  340  5.999999999999999e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00240789  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  71.02 
 
 
176 aa  249  1e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1528  F0F1 ATP synthase subunit delta  51.14 
 
 
176 aa  168  5e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0797496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0512  ATP synthase F1, delta subunit  47.16 
 
 
176 aa  159  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0684  F0F1 ATP synthase subunit delta  43.75 
 
 
176 aa  144  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0192  F0F1 ATP synthase subunit delta  47.16 
 
 
173 aa  141  6e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.745397  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0111  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.34 
 
 
173 aa  121  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262179  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0099  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.34 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0139  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.34 
 
 
173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1406  F0F1 ATP synthase subunit delta  37.29 
 
 
177 aa  108  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.233831  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4610  ATP synthase F1, delta subunit  29.1 
 
 
178 aa  58.9  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.994341  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.45 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.45 
 
 
179 aa  58.2  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2590  ATP synthase F1, delta subunit  25.15 
 
 
178 aa  57.8  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.570122  normal  0.0802262 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.66 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
178 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.66 
 
 
178 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  30.38 
 
 
178 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.8 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.8 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.8 
 
 
179 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
178 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4111  H+-transporting two-sector ATPase, delta (OSCP) subunit  29.68 
 
 
178 aa  55.5  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243479  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.67 
 
 
180 aa  54.7  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 
179 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 
179 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3287  ATP synthase F1, delta subunit  27.01 
 
 
178 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.19524  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.75 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.75 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.75 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.75 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.75 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.75 
 
 
179 aa  53.9  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.14 
 
 
179 aa  53.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  29.63 
 
 
178 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.04 
 
 
179 aa  52.4  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3358  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.75 
 
 
179 aa  52  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  31.16 
 
 
178 aa  52  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.04 
 
 
179 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.12 
 
 
178 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0023  ATP synthase F1, delta subunit  25.16 
 
 
178 aa  51.2  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0910717  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.75 
 
 
179 aa  50.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0019  ATP synthase F1, delta subunit  25.16 
 
 
178 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000168594  hitchhiker  0.000447823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.97 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.64 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  23.74 
 
 
178 aa  50.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2913  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.26 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3056  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.26 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  25.32 
 
 
178 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  27.67 
 
 
178 aa  48.1  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06287  ATP synthase oligomycin sensitivity conferral protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G12400)  30.99 
 
 
227 aa  47.4  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.822341  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3848  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.73 
 
 
177 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2328  ATP synthase F1, delta subunit  25.29 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000241371  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.33 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.88 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.88 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.88 
 
 
178 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.84 
 
 
177 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0300  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.86 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0305  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.86 
 
 
180 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790297 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  28.48 
 
 
178 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0369  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.43 
 
 
180 aa  45.1  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.398312 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3062  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.55 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.19 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  22.09 
 
 
178 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0005  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.85 
 
 
177 aa  44.7  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000453389  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0293  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.71 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4191  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.68 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000591932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3990  F0F1 ATP synthase subunit delta  33.72 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4901  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.24 
 
 
177 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00369053  normal  0.260895 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.38 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  25.19 
 
 
175 aa  42.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0212  ATP synthase F1, delta subunit  28.57 
 
 
177 aa  41.2  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.69 
 
 
180 aa  41.2  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4254  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.74 
 
 
177 aa  40.8  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177027  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.9 
 
 
177 aa  40.8  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.24 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.24 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.24 
 
 
177 aa  40.8  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>